漢昭帝始元元年（乙未，公元前86年）夏季，益州所屬二十四個夷人村寨三萬余人全部背叛漢朝。漢朝廷派水衡都尉呂破胡招募官吏和百姓從軍，又征調犍為、蜀郡的武勇精壯之人前往征討，大破叛軍。秋季，七月，大赦天下。天降大雨，一直持續(xù)到十月，渭橋被大水沖斷。

漢武帝去世時，朝廷以印有皇帝玉璽的正式詔書通知各諸侯王。燕王劉旦見到詔書后不肯哭泣，說道：“詔書的印封過小，我懷疑京師已發(fā)生變故。”于是派他寵信的臣僚壽西長、孫縱之、王孺等前往長安，以詢問祭悼漢武帝的禮儀為借口，暗中刺探朝廷動態(tài)。及至漢昭帝下詔獎賞劉旦錢三十萬，增加其封國人口一萬三千戶時，劉旦生氣地說：“本來就應當由我作皇帝，用不著誰來賞賜我！”于是與皇室成員中山哀王之子劉長、齊孝王之孫劉澤等密謀共同反叛朝廷，還偽稱在漢武帝生前曾得到詔書，允許他掌握其封國內各級官吏的任免權，整頓封國的軍隊，防備非常事變。郎中成軫對劉旦說：“大王失去皇位繼承權，只能起來索取，坐著不動是得不到的。大王一旦起兵，燕國之內，既使是婦女也都會奮臂追隨大王。”于是劉旦與劉澤密商，編制造謠文書，宣稱：“如今的小皇帝并非武帝之子，而是由朝中大臣共同擁立的，天下應當共同討伐！”派人到各郡國廣為傳發(fā)，以動搖百姓之心。劉澤計劃返回齊國后從臨發(fā)兵，殺死青州刺史雋不疑。劉旦在燕國招攬各地奸邪之徒，征斂民間銅鐵來制造鎧甲武器，又多次檢閱燕國的車騎、材官等各類軍隊，征調百姓進行大規(guī)模行圍打獵活動，以訓練將士、馬匹的作戰(zhàn)能力，等待與劉澤約定的日期一到，共同舉兵叛亂。郎中韓義等多次勸阻劉旦，劉旦將韓義等共十五名官員處死。就在此時，瓶侯劉成得到劉澤謀反計劃，便通知了雋不疑。八月，雋不疑逮捕了劉澤等人，并奏聞朝廷。漢昭帝王派大鴻臚丞負責處理此事。審訊中，燕王劉旦被供出。漢昭帝下詔，以燕王為至親，下令不許追究，而將劉澤等全部處死。雋不疑調任京兆尹。雋不疑擔任京兆尹，官吏和百姓對他的威信都很敬服。每當他巡視各縣，審查囚徒的判處情況歸來，他的母親總要問他：“給受冤屈的人平反了嗎？救活了多少人？”如雋不疑為很多受冤屈的人平了反，其母便比平時高興；如沒有平反之事，其母便生氣得不肯吃飯。因此，雋不疑為官，雖然執(zhí)法嚴格，卻并不殘忍。

九月丙子（初二），侯金日去世。當初漢武帝病危時，曾留下遺詔，封金日為侯，上官桀為安陽侯，霍光為博陸侯，都是因為先前逮捕叛逆者馬何羅等人之功而賜與封爵。金日以新皇帝年紀幼小為理由，不肯接受封爵，霍光等也不敢接受。等到金日病重時，霍光才將武帝臨終時封他們三人為侯的事報告漢昭帝，于是金日躺在病床上接受了侯的印信和綬帶，一天后去世。金日的兩個兒子金賞、金建都擔任侍中，與漢昭帝年齡差不多一般大小，起床、睡覺都在一起。金賞的官職是奉車都尉，金建是駙馬都尉。后來金賞繼承了父親金日的侯爵，佩戴兩種綬帶，漢昭帝便對霍光說道：“金氏兄弟二人，不能讓他們都佩戴兩種綬帶嗎？”霍光回答說：“只能由金賞一人繼承他父親的侯爵?！睗h昭帝笑著說：“封侯不是由我和將軍決定嗎？”霍光說：“根據(jù)先皇的約定，對國家有功的人才能封侯?！庇谑菨h昭帝作罷。閏十月，漢昭帝派前任廷尉王平等五人攜帶皇帝符節(jié)巡視各郡、國，舉薦賢良人士，察問民間疾苦、冤屈和地方官是否有失職行為。冬季，氣候溫暖，不結冰。

始元二年（丙申，公元前85年）春季，正月，漢昭帝封大將軍霍光為博陸侯，左將軍上官桀為安陽侯。有人勸霍光說：“將軍沒有看到當初呂氏家族覆亡的教訓嗎？呂氏身處伊尹、周公的地位，主持朝政，專擅大權，卻疏遠皇族成員，不與他們共享朝權，因此失去了天下人的信任，最后終于滅亡。如今將軍身居高位，皇上年幼，應當納用皇族成員，并多與大臣共商政事，與呂氏家族的作法相反。如果這樣，便可以免除禍患?！被艄庹J為有道理，便在皇室成員中選擇可以擔任官職的人才，任命楚元王之孫劉辟疆和皇室成員劉長樂都為光祿大夫，劉辟疆還兼任長樂宮衛(wèi)尉。三月，漢昭帝派使者向缺乏種子、口糧的貧苦農民發(fā)放賑貸。秋季，八月，漢昭帝頒布詔書說：“往年災害多有發(fā)生，今年的蠶桑、小麥也受到傷害。因此，朝廷賑貸給農民的種子和口糧都不必歸還，并免除農民今年的田賦?！?/p>

當初，漢武帝派兵征伐匈奴，深入腹地，窮追猛打，前后二十余年，使匈奴的馬匹牲畜不能正常孕育繁殖，受到嚴重消耗，百姓貧苦疲憊到了極點，常常希望與漢朝恢復和親關系，但卻一直未能實現(xiàn)。匈奴狐鹿孤單于有一個同父異母的弟弟，擔任匈奴左大都尉，很是賢明，民心歸附于他。單于的母親怕單于不立兒子為繼承人而傳位給弟弟左大都尉，便私自派人將左大都尉殺死。此事引起左大都尉的同母哥哥的怨恨，從此不再去單于王庭。這一年，單于病重不起，臨死前，對貴族們說：“我的兒子年紀幼小，不能治理國家，我決定將單于之位傳給弟弟右谷蠡王?！眴斡谒篮?，衛(wèi)律等人與單于的正室夫人顓渠閼氏密謀、隱瞞了單于去世的消息，并偽造單于命令，改立單于的兒子左谷蠡王為壺衍單于。左賢王、右谷蠡王心懷不滿，打算率領部眾向南歸附漢朝，又怕自己的力量單薄，難以實現(xiàn)，于是脅迫盧屠王，打算與盧屠王一起向西歸降烏孫。盧屠王將此事向壺衍單于告發(fā)，壺衍單于派人前去查問，右谷蠡王不肯承認，反將陰謀背叛之事推到盧屠王身上，匈奴人都認為盧屠王冤枉。于是左賢王和右谷蠡王離去，留居在自己的轄地，不肯再參與每年一次的龍城祭祀大典，匈奴從此衰落。

始元三年（丁酉，公元前84年）

　　春，二月，有星孛于西北。
　　春季，二月，西北方向出現(xiàn)異星。

　　冬，十一月，壬辰朔，日有食之。
　　冬季，十一月壬辰朔（初一），出現(xiàn)日食。

　　初，霍光與上官桀相親善。光每休沐出，桀常代光入決事。光女為桀子安妻，生女，年甫五歲，安欲因光內之宮中；光以為尚幼，不聽。蓋長公主私近子客河間丁外人，安素與外人善，說外人曰：“安子容貌端正，誠因長主時得入為后，以臣父子在朝而有椒房之重，成之在于足下。漢家故事，常以列侯尚主，足下何憂不封侯乎！”外人喜，言于長主。長主以為然，詔召安女入為婕妤，安為騎都尉。
　　當初，霍光與上官桀關系親密，每當霍光休假離朝，上官桀常代替霍光入朝裁決政事?；艄獾呐畠菏巧瞎勹钪由瞎侔驳钠拮樱乱粋€女兒，只有五歲，上官安想通過霍光的關系使女兒進入后宮，霍光認為外孫女年紀還小，不肯答應。漢昭帝的姐姐蓋長公主與她兒子的門客河間人丁外人私通，上官安平時與丁外人關系很好，便對丁外人說：“我女兒容貌端正，如能得到長公主的幫助，入宮成為皇后，我與我父親在朝為官就有皇后作為依靠，此事的成敗全都在您。按漢朝的慣例，公主常常嫁給列侯，您又何愁不能封侯呢！”丁外人非常高興，便將此事告訴長公主，長公主表示贊同，于是讓漢昭帝頒布詔書，將上官安的女兒召入宮中，封為 ，并任命上官安為騎都尉。

始元四年（戊戌，公元前83年）春季，三月甲寅（二十五日），漢昭帝頒布詔書，立上官氏為皇后，大赦天下。

西南夷姑繒、葉榆兩部族再次背叛漢朝，漢朝廷派水衡都尉呂辟胡率領益州軍隊前往征討。呂辟胡屯兵不前，致使叛亂的蠻夷殺死益州太守，并乘勝與呂辟胡所部漢軍交戰(zhàn)，漢軍戰(zhàn)死及溺水而死的士卒達四千余人。冬季，漢朝廷派大鴻臚田廣明率兵前往征討。廷尉李種因被指控故意為犯有死罪的人開脫罪名，被當眾斬首。這一年，上官安被任命為車騎將軍。

始元五年（己亥，公元前82年）春季，正月，漢昭帝追尊外祖父趙父為順成侯。順成侯有位姐姐名叫趙君，漢昭帝賜給她錢二百萬以及奴婢、住宅等，以充實她的財產(chǎn)。兄弟們也都按著血緣的親疏得到賞賜，但沒有授予封爵、官職的。

有一位男子，乘坐黃牛犢車來到未央宮北門，自稱他是漢武帝的衛(wèi)太子劉據(jù)，公車官將此事奏聞朝廷。漢昭帝下詔書命三公、九卿、將軍、中二千石官等一同前往辨認。長安城中的一般官吏和百姓前去圍觀的達數(shù)萬人。右將軍為防止發(fā)生不測之事，率兵守在宮門前面。前往辨認的丞相、御史、中二千石官等，誰也不敢發(fā)言。京兆尹雋不疑最后趕到，命手下官吏將該男子逮捕。有人勸他說：“是否真是前太子還不能確定，暫且不要處理！”雋不疑說道：“各位又何必怕他是衛(wèi)太子！春秋時期，衛(wèi)國太子衛(wèi)蒯聵因違抗衛(wèi)靈公之命出逃，后其子衛(wèi)輒繼位，拒不接納其父回國，此事得到《春秋》的肯定。衛(wèi)太子得罪了先帝，逃亡在外，當時沒死，如今自己又回來了，也是國家的罪人?！庇谑菍⒃撃凶友核偷皆t獄。漢昭帝與大將軍霍光聽說后，稱贊雋不疑說：“公卿大臣就應當由這種精通經(jīng)典、明白大義的人來擔任。”于是雋不疑在朝中名重一時，其他身居高位的人都自認為比不上他。后經(jīng)廷尉審訊核問那個人，竟然發(fā)現(xiàn)是一騙案。那位自稱是衛(wèi)太子的人本是夏陽人，姓成，名方遂，住在湖縣，以占卜為職業(yè)。衛(wèi)太子的一位侍從曾經(jīng)請他占卜，并對他說：“您的身材相貌都很像衛(wèi)太子?！背煞剿炻牭酱搜灾箢H為動心，希望借此取得富貴。成方遂被定以誣罔不道之罪，腰斬。

夏季，六月，漢昭帝封上官安為桑樂侯。上官安日益驕縱yín亂，漢昭帝賜他在宮中飲宴，他回家后，對門客說：“與我女婿一起喝酒，非常高興。”看見漢昭帝的服飾，便派人回家，要將自己的東西燒掉。兒子因病去世，上官安竟仰面罵天。其頑劣狂悖到了如此地步。

漢朝撤銷儋耳、真番二郡。秋季，大鴻臚田廣明、軍正王平率兵征討在益州叛亂的西南夷姑繒、葉榆兩部族，共斬殺、捕獲叛亂者三萬余人，繳獲牲畜五萬余頭。諫大夫杜延年看到漢武帝的奢侈和屢次興兵出征給國家留下的困難，多次對大將軍霍光說：“連年收成不好，離鄉(xiāng)背井的百姓還沒有全部回到自己的家園，應當恢復孝文皇帝時的治國方針，提倡節(jié)儉，為政寬和，順從天意，取悅民心，年景就會跟著好轉?！被艄獠杉{了他的建議。杜延年是前御史大夫杜周的兒子。