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LAYN 是一種預(yù)后生物標(biāo)志物,與胃癌和結(jié)腸癌的免疫浸潤相關(guān)

2022-02-02 21:58 作者:275276  | 我要投稿


LAYN Is a Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Infiltrates in Gastric and Colon Cancers

背景:萊依林(LAYN)是調(diào)節(jié)T細(xì)胞功能的關(guān)鍵基因。然而,LAYN 與不同癌癥預(yù)后和腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞的相關(guān)性仍不清楚。

方法:通過 Oncomine 數(shù)據(jù)庫和腫瘤免疫估計(jì)資源 (TIMER) 網(wǎng)站分析 LAYN 表達(dá)。我們使用 Kaplan-Meier 繪圖儀、PrognoScan 數(shù)據(jù)庫和基因表達(dá)譜交互分析 (GEPIA) 評(píng)估了 LAYN 對(duì)臨床預(yù)后的影響。通過 TIMER 研究了 LAYN 和癌癥免疫浸潤之間的相關(guān)性。此外,通過 TIMER 和 GEPIA 分析了 LAYN 表達(dá)與免疫浸潤基因標(biāo)記組之間的相關(guān)性。

結(jié)果:結(jié)直腸癌患者隊(duì)列 (?GSE17536?) 表明,高 LAYN 表達(dá)與較差的總生存期 (OS)、疾病特異性生存期 (DSS) 和無病生存期 (DFS) 相關(guān)。此外,LAYN 的高表達(dá)與胃癌的不良 OS 和無進(jìn)展生存期 (PFS) 顯著相關(guān)(OS HR = 1.97,P?= 3.6e-10;PFS HR = 2.12,P?= 2.3e-10)。此外,LAYN 通過癌癥基因組圖譜 (TCGA) 顯著影響多種癌癥的預(yù)后。具體而言,LAYN 高表達(dá)與 2 至 4 期較差的 OS 和 PFS 相關(guān),但與 1 期和 N0 期胃癌患者無關(guān)(P?= 0.28, 0.34;?P= 0.073,0.092)。LAYN 表達(dá)與結(jié)腸腺癌 (COAD) 和胃腺癌 (STAD) 中 CD4+ T 和 CD8+ T 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞 (DC) 的浸潤水平呈正相關(guān)。LAYN 表達(dá)與 COAD 和 STAD 中的不同免疫標(biāo)記集顯示出強(qiáng)相關(guān)性。

結(jié)論:這些發(fā)現(xiàn)表明,LAYN 與多種癌癥,尤其是結(jié)腸癌和胃癌患者的預(yù)后和免疫浸潤水平相關(guān),包括 CD8+ T 細(xì)胞、CD4+ T 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和 DC。此外,LAYN 表達(dá)可能有助于調(diào)節(jié)結(jié)腸癌和胃癌中的腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞 (TAM)、DC、T 細(xì)胞耗竭和 Treg。這些發(fā)現(xiàn)表明,LAYN 可用作預(yù)后生物標(biāo)志物,用于確定胃癌和結(jié)腸癌的預(yù)后和免疫浸潤。

關(guān)鍵詞:LAYN,淋巴細(xì)胞,腫瘤浸潤,預(yù)后,胃癌,結(jié)腸癌

LAYN在不同類型人類癌癥中的mRNA表達(dá)水平

為了確定腫瘤和正常組織中 LAYN 表達(dá)的差異,使用 Oncomine 數(shù)據(jù)庫分析了多種癌癥類型的不同腫瘤和正常組織中的 LAYN mRNA 水平。該分析顯示,與正常組織相比,LAYN 在乳腺癌、結(jié)直腸癌、胃癌、腎癌、胰腺癌和淋巴瘤腫瘤中的表達(dá)更高。圖 1A)。此外,在一些數(shù)據(jù)集中,在膀胱癌、乳腺癌、結(jié)腸直腸癌、頭頸癌、肺癌、卵巢癌和前列腺癌中觀察到較低的表達(dá)。補(bǔ)充表1總結(jié)了不同癌癥類型中LAYN表達(dá)的詳細(xì)結(jié)果。

圖1
不同類型人類癌癥中的 LAYN 表達(dá)水平。(A)與 Oncomine 數(shù)據(jù)庫中的正常組織相比,不同癌癥數(shù)據(jù)集中的 LAYN 增加或減少。(B) TCGA 數(shù)據(jù)庫中不同腫瘤類型的人 LAYN 表達(dá)水平通過 TIMER 測(cè)定 ( * P < 0.05, ** P < 0.01, *** P < 0.001)。

為了進(jìn)一步評(píng)估 LAYN 在人類癌癥中的表達(dá),我們使用 TCGA 中多種惡性腫瘤的 RNA-seq 數(shù)據(jù)檢查了 LAYN 的表達(dá)。LAYN 在所有 TCGA 腫瘤中的腫瘤和相鄰正常組織之間的差異表達(dá)顯示在圖 1B.?LAYN 在 BLCA(膀胱尿路上皮癌)、BRCA(乳腺癌)、COAD(結(jié)腸腺癌)、KICH(腎嫌色細(xì)胞)、LUAD(肺腺癌)、PRAD(前列腺癌)、READ(直腸腺癌)、 STAD(胃腺癌)、THCA(甲狀腺癌)和 UCEC(子宮體子宮內(nèi)膜癌)與鄰近正常組織的比較。然而,與鄰近的正常組織相比,LAYN 在 CHOL(膽管癌)、HNSC(頭頸癌)、KIRC(腎腎透明細(xì)胞癌)和 LIHC(肝肝細(xì)胞癌)中的表達(dá)顯著升高。

LAYN 在癌癥中的預(yù)后潛力

我們研究了 LAYN 表達(dá)是否與癌癥患者的預(yù)后相關(guān)。使用 PrognoScan 評(píng)估 LAYN 表達(dá)對(duì)存活率的影響。PrognoScan 中不同癌癥的 LAYN 表達(dá)與預(yù)后之間的關(guān)系顯示在補(bǔ)充表 2中。值得注意的是,LAYN 表達(dá)顯著影響 4 種癌癥的預(yù)后,包括結(jié)直腸癌、乳腺癌、眼癌和卵巢癌。圖 2A-H)。兩個(gè)隊(duì)列 (?GSE17536?,?GSE14333?) (?30?,?31?) 包括 177 個(gè)樣本和 226 個(gè)處于結(jié)直腸癌不同階段的樣本,并顯示高 LAYN 表達(dá)與較差的預(yù)后略微相關(guān)(OS HR = 1.50, 95% CI = 0.98 至 2.29, Cox?P?= 0.06;DSS HR = 1.84,95% CI=1.15 至 2.97,Cox?P?= 0.012;DFS HR = 2.32,95% CI=1.27 至 4.25,Cox?P?= 0.006;DFS HR = 1.72,95% CI = 1.21 至 2.46,考克斯P?= 0.003) (圖 2A-D)。因此,可以想象,高表達(dá) LAYN 是一個(gè)獨(dú)立的危險(xiǎn)因素,導(dǎo)致 CRC 患者預(yù)后不良。

圖 2
Kaplan-Meier 生存曲線比較了 PrognoScan (A-H)和 Kaplan-Meier 繪圖儀數(shù)據(jù)庫(I-P)中不同類型癌癥中 LAYN 的高表達(dá)和低表達(dá)。(A-D)兩個(gè)結(jié)直腸癌隊(duì)列 [ GSE17536 ( n = 177) 和GSE14333 ( n = 226)] 中 OS、DSS 和 DFS 的生存曲線。(E,F)乳腺癌隊(duì)列中 OS 和 DFS 的生存曲線 ( GSE1456 - GPL97 , n = 159)。(G,H)高 LAYN 表達(dá)與眼癌隊(duì)列中較差的 DMFS 相關(guān) ( GSE22138 , n= 63) 和卵巢癌隊(duì)列中較差的 OS ( GSE9891 , n = 278)。(I,J)胃癌的 OS 和 DFS 生存曲線 ( n = 631, n = 522)。(K,L)乳腺癌的 OS 和 RFS 生存曲線 ( n = 626, n = 1,764)。(M,N)肺癌的 OS 和 PFS 生存曲線 ( n = 1,145, n = 596)。(O,P)卵巢癌的 OS 和 PFS 生存曲線 ( n = 655, n= 614)。OS,總生存期;DFS,無病生存;RFS,無復(fù)發(fā)生存;DSS,疾病特異性生存。DMFS,無遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移生存。

為了進(jìn)一步檢查 LAYN 在不同癌癥中的預(yù)后潛力,使用 Kaplan-Meier 繪圖儀數(shù)據(jù)庫評(píng)估基于 Affymetrix 微陣列的 LAYN 預(yù)后價(jià)值。有趣的是,胃癌(OS HR = 1.97, 95% CI = 1.59 to 2.45,?P?= 3.6e-10; PFS HR = 2.12, 95% CI = 1.67 to 2.69,?P?= 2.3e-10)和卵巢預(yù)后不良癌癥(OS HR = 1.31,95% CI = 1.07 至 1.5,P?= 0.0085;PFS HR = 1.73,95% CI = 1.43 至 2.09,P?= 8.8e-9)顯示與更高的 LAYN 表達(dá)相關(guān)。然而,LAYN 表達(dá)對(duì)乳腺癌的影響較?。〝?shù)字 2K,L),并且在肺癌中顯示出更好的 OS (圖 2M,N)。這些結(jié)果表明 LAYN 的表達(dá)對(duì)卵巢癌和胃癌的預(yù)后有影響。圖 2H,I)。

除了在 PrognoScan 和 Kaplan-Meier 繪圖儀數(shù)據(jù)庫中對(duì) LAYN 進(jìn)行微陣列分析外,還使用 TCGA 中的 RNA 測(cè)序數(shù)據(jù)通過 GEPIA 分析 LAYN 在不同癌癥中的預(yù)后潛力。我們分析了 33 種癌癥中 LAYN 表達(dá)與預(yù)后值之間的關(guān)系(補(bǔ)充圖 1)。LAYN 高表達(dá)水平與 COAD、OV(卵巢漿液性囊腺癌)和 UVM(葡萄膜黑色素瘤)的 OS 和 DFS 預(yù)后較差有關(guān);GBM(多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤)中的 DFS 和 HNSC、MESO(間皮瘤)和 STAD 中的 OS。同時(shí),高 LAYN 表達(dá)與 KIRP 和 THCA(甲狀腺癌)中 DFS 的更好預(yù)后以及 SKCM(皮膚皮膚黑色素瘤)中的 OS 相關(guān)。這些結(jié)果證實(shí)了 LAYN 在某些特定類型癌癥中的預(yù)后價(jià)值,并且 LAYN 表達(dá)的增加和減少具有不同的預(yù)后價(jià)值,具體取決于癌癥的類型。

LAYN高表達(dá)影響淋巴轉(zhuǎn)移患者胃癌的預(yù)后

為了更好地了解 LAYN 在癌癥中表達(dá)的相關(guān)性和潛在機(jī)制,我們?cè)?Kaplan-Meier 繪圖儀數(shù)據(jù)庫中研究了 LAYN 表達(dá)與胃癌患者臨床特征之間的關(guān)系。LAYN的過表達(dá)與男性和女性患者較差的OS和PFS以及兩種類型的Lauren分類和分化相關(guān)(P?<0.05)。具體而言,LAYN mRNA 高表達(dá)與胃癌患者 2 至 4 期較差的 OS 和 PFS 相關(guān),但與 1 期的 OS 和 PFS 無關(guān)(OS HR = 0.54,P?= 0.28;PFS HR = 0.58,P?= 0.34)和 N0 期患者(OS HR = 2.13,P?= 0.073;PFS HR = 2.08,P?= 0.92)(表格1)。這里的 N 類是指淋巴結(jié)受累;N0 表示無區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,N1-N3 表示區(qū)域淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移 (?32?)。此外,高LAYN表達(dá)在四個(gè)N類別中具有最高的OS和PFS的N1 HR值。這些結(jié)果表明LAYN表達(dá)水平可以影響胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者的預(yù)后。

LAYN 表達(dá)與結(jié)腸癌和胃癌的免疫浸潤水平相關(guān)

腫瘤浸潤淋巴細(xì)胞是癌癥前哨淋巴結(jié)狀態(tài)和存活率的獨(dú)立預(yù)測(cè)因子 (?33?,?34)。因此,我們研究了 LAYN 表達(dá)是否與不同類型癌癥的免疫浸潤水平相關(guān)。我們?cè)u(píng)估了來自 TIMER 的 39 種癌癥類型中 LAYN 表達(dá)與免疫浸潤水平的相關(guān)性。結(jié)果表明,LAYN表達(dá)與26種癌癥的腫瘤純度顯著相關(guān),與14種癌癥的B細(xì)胞浸潤水平顯著相關(guān)。此外,LAYN 表達(dá)與 18 種癌癥中 CD8+ T 細(xì)胞、23 種癌癥中 CD4+ T 細(xì)胞、23 種癌癥中的巨噬細(xì)胞、19 種癌癥中的中性粒細(xì)胞和 25 種癌癥中的樹突狀細(xì)胞的浸潤水平顯著相關(guān)癌癥(圖 3和補(bǔ)充圖2)。

圖 3
LAYN 表達(dá)與 COAD(結(jié)腸腺癌)、LUSC(肺鱗狀細(xì)胞癌)和 STAD(胃腺癌)中免疫浸潤水平的相關(guān)性。(A) LAYN 表達(dá)與腫瘤純度顯著負(fù)相關(guān),并且與 COAD 中 CD8+ T 細(xì)胞、CD4+ T 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞的浸潤水平顯著正相關(guān),B 細(xì)胞除外 ( n = 457)。(B) LAYN 表達(dá)與腫瘤純度和 LUSC 中 B 細(xì)胞、CD8+ T 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞的浸潤水平?jīng)]有顯著相關(guān)性。LAYN 表達(dá)與 LUSC 中 CD4+ T 細(xì)胞浸潤水平的相關(guān)性非常弱(n = 501)。(C)LAYN 表達(dá)與腫瘤純度呈顯著負(fù)相關(guān),與 STAD 中 CD8+ T 細(xì)胞、CD4+ T 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞的浸潤水平呈顯著正相關(guān),但與 B 細(xì)胞的浸潤水平無顯著相關(guān)性(n = 415) .

鑒于 LAYN 表達(dá)與不同類型癌癥中免疫浸潤水平的關(guān)聯(lián),我們接下來確定了不同類型的癌癥,其中 LAYN 與預(yù)后和免疫浸潤相關(guān)。腫瘤純度是影響通過基因組方法分析臨床腫瘤樣本中免疫浸潤的重要因素 (?35?),TIMER 和 GEPIA 具有來自 TCGA 的大部分同源數(shù)據(jù) (?23?,?29 ))。因此,我們?cè)?TIMER 中選擇了 LAYN 表達(dá)水平與腫瘤純度呈顯著負(fù)相關(guān),在 GEPIA 中與預(yù)后顯著相關(guān)的癌癥類型。有趣的是,我們發(fā)現(xiàn) LAYN 表達(dá)水平與 COAD 和 STAD 中較差的預(yù)后和高免疫浸潤相關(guān)。LAYN表達(dá)水平與CD8+ T細(xì)胞(r?= 0.169,?P?= 6.23e-04)、CD4+ T細(xì)胞(r?= 0.273,?P?= 2.63e-08)、巨噬細(xì)胞(r?= 0.528,?P?= 2.14e-30)、中性粒細(xì)胞 (?r?= 0.411,?P?= 8.34e-18) 和 DCs (?r?= 0.453,?P= 8.74e-22) 在 COAD (圖 3A)。同樣,CD8+ T 細(xì)胞 (?r?= 0.323,?P?= 1.95e-10)、CD4+ T 細(xì)胞 (?r?= 0.426,?P?= 1.52e-17)、巨噬細(xì)胞 (?r?= 0.678,?P?= 3.83e-41)、中性粒細(xì)胞 (?r?= 0.345,?P?= 7.90e-12) 和 DCs (?r?= 0.551,?P?= 5.07e-26) 在 COAD (圖 3C)。此外,LAYN 表達(dá)與腫瘤純度和 LUSC 中 B 細(xì)胞、CD8+ T 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞的浸潤水平?jīng)]有顯著相關(guān)性。這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)烈表明 LAYN 在結(jié)腸癌和胃癌的免疫浸潤中發(fā)揮特定作用,尤其是巨噬細(xì)胞和 DC 的免疫浸潤。

LAYN表達(dá)與免疫標(biāo)記集的相關(guān)性分析

為了研究 LAYN 與多種免疫浸潤細(xì)胞之間的關(guān)系,我們重點(diǎn)研究了 LAYN 與 TIMER 和 GEPIA 數(shù)據(jù)庫中 COAD、STAD 的各種免疫細(xì)胞的免疫標(biāo)記組之間的相關(guān)性。我們分析了不同免疫細(xì)胞的LAYN表達(dá)與免疫標(biāo)記基因之間的相關(guān)性,包括CD8+ T細(xì)胞、T細(xì)胞(一般)、B細(xì)胞、單核細(xì)胞、TAMs、M1和M2巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、NK細(xì)胞和COAD和STAD中的DCs,使用肺鱗狀細(xì)胞癌(LUSC)作為對(duì)照(表 2和圖 4I-L)。我們還分析了不同功能的 T 細(xì)胞,例如 Th1 細(xì)胞、Th2 細(xì)胞、Tfh 細(xì)胞、Th17 細(xì)胞和 Treg,以及耗盡的 T 細(xì)胞。通過純度進(jìn)行相關(guān)性調(diào)整后,結(jié)果顯示LAYN表達(dá)水平與COAD和STAD中各種免疫細(xì)胞和不同T細(xì)胞的大多數(shù)免疫標(biāo)志物組顯著相關(guān)。然而,LAYN 表達(dá)水平僅與 LUSC 中的 16 個(gè)基因標(biāo)記顯著相關(guān)(表 2)。

在單獨(dú)的窗口中打開
圖 4
LAYN 表達(dá)與 COAD(結(jié)腸腺癌)和 STAD(胃腺癌)中的巨噬細(xì)胞極化相關(guān)。標(biāo)志物包括單核細(xì)胞的CD86和CSF1R;TAM(腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞)的 CCL2、CD68 和 IL10;M1 巨噬細(xì)胞的 NOS2、IRF5 和 PTGS2;M2 巨噬細(xì)胞的 CD163、VSIG4 和 MS4A4A。(A-D) COAD ( n = 457)中LAYN 表達(dá)與單核細(xì)胞(A)、TAM (B)和 M1 (C)和 M2 巨噬細(xì)胞(D)的基因標(biāo)記之間相關(guān)性的散點(diǎn)圖。(E-H) LAYN 表達(dá)與單核細(xì)胞(E)、TAM (F)和 M1 (G)基因標(biāo)記之間相關(guān)性的散點(diǎn)圖STAD ( n = 415)中的M2 巨噬細(xì)胞(H )。(I-L)作為對(duì)照組的 LUSC(肺鱗狀細(xì)胞癌)顯示 LAYN 表達(dá)與 LUSC 中的巨噬細(xì)胞極化無顯著相關(guān)性(n = 501)。LUSC 中巨噬細(xì)胞的標(biāo)記組還包括單核細(xì)胞(I)、TAM (J)和 M1 (K)和 M2 巨噬細(xì)胞(L)。

有趣的是,我們發(fā)現(xiàn)大多數(shù)單核細(xì)胞、TAM、M2 巨噬細(xì)胞標(biāo)記組的表達(dá)水平與 COAD 和 STAD 中的 LAYN 表達(dá)有很強(qiáng)的相關(guān)性。表 2)。具體而言,我們發(fā)現(xiàn)TAMs的趨化因子(CC基序)配體(CCL)-2、CD68、IL10、M1表型的PTGS2、IRF5、M2表型的CD163、VSIG4和MS4A4A與COAD和STAD中LAYN的表達(dá)顯著相關(guān)(P?< 0.0001;圖 4A-H)。我們進(jìn)一步分析了 LAYN 表達(dá)與 GEPIA 數(shù)據(jù)庫中單核細(xì)胞和 TAM 的上述標(biāo)志物之間的相關(guān)性,包括 COAD、STAD 和 LUSC。LAYN與單核細(xì)胞和TAMs標(biāo)志物的相關(guān)結(jié)果與TIMER中的相似(表3)。這些發(fā)現(xiàn)表明,LAYN 可能調(diào)節(jié) COAD 和 STAD 中的巨噬細(xì)胞極化。

LAYN 高表達(dá)與 COAD 和 STAD 中 DC 的高浸潤水平有關(guān),DC 標(biāo)志物如 HLA-DPB1、BDCA-1、BDCA-4 和 CD11c 也與 LAYN 表達(dá)顯著相關(guān)。這些結(jié)果進(jìn)一步表明 LAYN 和 DCs 浸潤之間存在很強(qiáng)的關(guān)系。此外,對(duì)于Treg細(xì)胞,LAYN與COAD和STAD中的FOXP3和TGFB1呈正相關(guān)。DCs 可以通過增加 Treg 細(xì)胞和降低 CD8+ T 細(xì)胞的細(xì)胞毒性來促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)移 (?36?)。LAYN是否是介導(dǎo)DC和腫瘤轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵因素還需要進(jìn)一步研究。

我們還發(fā)現(xiàn) LAYN 與 Treg 和 T 細(xì)胞衰竭的標(biāo)志基因如 FOXP3、CCR8、STAT5B、TGFβ、PD-1、CTLA4、LAG3 和 TIM-3 之間存在顯著相關(guān)性。表 2)。FOXP3 在 Treg 細(xì)胞中發(fā)揮重要作用,導(dǎo)致抑制攻擊腫瘤細(xì)胞的細(xì)胞毒性 T 細(xì)胞 (?37?)。有趣的是,TIM-3作為調(diào)節(jié)T細(xì)胞耗竭的關(guān)鍵基因,與LAYN表達(dá)呈強(qiáng)正相關(guān),提示LAYN高表達(dá)在TIM-3介導(dǎo)T細(xì)胞耗竭中起重要作用。因此,這些結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了 LAYN 與 COAD 和 STAD 中的免疫浸潤細(xì)胞特異性相關(guān)的發(fā)現(xiàn),這表明 LAYN 在結(jié)腸和胃癌微環(huán)境中的免疫逃逸中起著至關(guān)重要的作用。

討論

LAYN 是一種細(xì)胞表面透明質(zhì)酸 (HA) 受體,它經(jīng)常與細(xì)胞骨架元件連接。雖然 LAYN 尚未得到廣泛研究,但已知 LAYN 在活化的 Treg 和 CD8+ 淋巴細(xì)胞中上調(diào)。此外,它還抑制肺癌、結(jié)直腸癌和肝細(xì)胞癌中的 CD8+ 功能 (?18?,?19)。在這里,我們報(bào)告了 LAYN 表達(dá)水平的變化與不同類型癌癥的預(yù)后相關(guān)。LAYN 的高表達(dá)水平與 COAD 和 STAD 的較差預(yù)后相關(guān)。有趣的是,LAYN 表達(dá)水平升高會(huì)影響胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者的預(yù)后,表明 LAYN 表達(dá)可用作腫瘤轉(zhuǎn)移的預(yù)測(cè)因子。此外,我們的分析表明,在結(jié)腸癌和胃癌中,免疫浸潤水平和多種免疫標(biāo)志物組與 LAYN 表達(dá)水平相關(guān)。因此,我們的研究為了解 LAYN 在腫瘤免疫學(xué)中的潛在作用及其作為癌癥生物標(biāo)志物的用途提供了見解。

在這項(xiàng)研究中,我們使用 Oncomine 中的獨(dú)立數(shù)據(jù)集和 GEPIA 中 TCGA 數(shù)據(jù)的 33 種類型癌癥檢查了不同類型癌癥中 LAYN 的表達(dá)水平和系統(tǒng)預(yù)后景觀。在許多類型的癌癥中都觀察到 LAYN 在癌癥和正常組織之間的差異表達(dá)?;?Oncomine 數(shù)據(jù)庫,我們發(fā)現(xiàn) LAYN 與正常組織相比,在乳腺癌、結(jié)直腸癌、胃癌、腎癌、胰腺癌和淋巴瘤中高表達(dá),而一些數(shù)據(jù)集顯示 LAYN 在膀胱中的表達(dá)水平較低,乳腺癌、結(jié)直腸癌、頭頸癌、肺癌、卵巢癌和前列腺癌(圖 1A)。然而,對(duì) TCGA 數(shù)據(jù)的分析表明,與 LAYN 在 CHOL、HNSC、KIRC 和 LIHC 中的表達(dá)相比,LAYN 在 BLCA、BRCA、COAD、KICH、LUAD、PRAD、READ、STAD、THCA 和 UCEC 中的表達(dá)較低。正常鄰近組織(圖 1B)。不同數(shù)據(jù)庫中不同癌癥類型中 LAYN 表達(dá)水平的差異可能反映了與不同生物學(xué)特性相關(guān)的數(shù)據(jù)收集方法和潛在機(jī)制。然而,在這些數(shù)據(jù)庫中,我們發(fā)現(xiàn)結(jié)腸癌、胃癌和卵巢癌中 LAYN 表達(dá)之間存在一致的預(yù)后相關(guān)性。對(duì) TCGA 數(shù)據(jù)庫的分析顯示,在大多數(shù)腫瘤類型(COAD、HNSC、MESO、OV、STAD 和 UVM)中,LAYN 表達(dá)增加與預(yù)后不良相關(guān)。KIRP、SKCM 和 THCA 是高水平 LAYN 表達(dá)顯示更好預(yù)后的例外。此外,來自 PrognoScan 和 Kaplan-Meier Plotter 的數(shù)據(jù)分析表明,高水平的 LAYN 表達(dá)與結(jié)直腸癌、胃癌和卵巢癌的不良預(yù)后相關(guān)。在 PrognoScan 的三個(gè)數(shù)據(jù)集中,圖 2A-D、H)。Kaplan-Meier Plotter 還顯示 LAYN 的高表達(dá)與胃癌和卵巢癌較差的總生存期 (OS) 和無進(jìn)展生存期 (PFS) 的高風(fēng)險(xiǎn)比 (HR) 相關(guān)。圖 2I、J、O、P)。此外,LAYN 高水平表達(dá)與胃癌 2 至 4 期、T2 至 T4 和 N1 至 N3 期預(yù)后不良相關(guān),當(dāng) LAYN 在胃癌中高表達(dá)時(shí),不良 OS 和 PFS 的 HR 最高(表格1)??傊?,這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)烈表明 LAYN 是結(jié)直腸癌、胃癌和卵巢癌的預(yù)后生物標(biāo)志物。

本研究的另一個(gè)重要方面是 LAYN 表達(dá)與癌癥中不同的免疫浸潤水平相關(guān),特別是在胃癌和結(jié)腸癌中。我們的研究結(jié)果表明,LAYN表達(dá)水平與巨噬細(xì)胞和DC浸潤水平呈中強(qiáng)正相關(guān),CD8+ T、CD4+ T細(xì)胞和中性粒細(xì)胞浸潤水平與COAD和STAD中LAYN表達(dá)呈顯著正相關(guān)。圖 3A、C)。此外,LAYN 表達(dá)與免疫細(xì)胞標(biāo)記基因之間的相關(guān)性暗示了 LAYN 在調(diào)節(jié) COAD 和 STAD 腫瘤免疫學(xué)中的作用。首先,PTGS2和IRF5等M1巨噬細(xì)胞的基因標(biāo)志物與LAYN表達(dá)呈弱相關(guān),而CD163、VSIG4和MS4A4A等M2巨噬細(xì)胞標(biāo)志物則呈中度和強(qiáng)相關(guān)性。表 2,,3)。3)。這些結(jié)果揭示了 LAYN 在腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞 (TAM) 極化中的潛在調(diào)節(jié)作用。此外,我們的結(jié)果表明,LAYN 具有激活 Tregs 并誘導(dǎo) T 細(xì)胞耗竭的潛力。LAYN 表達(dá)的增加與 COAD 和 STAD 中 Treg 和 T 細(xì)胞衰竭標(biāo)志物(FOXP3、CCR8、STAT5B、TIM-3、PD-1、CTLA4 和 LAG3)的表達(dá)呈正相關(guān)表 2)。TIM-3 是衰竭 T 細(xì)胞 ( 38?)上的一種關(guān)鍵表面蛋白,與 COAD 和 STAD 中的 LAYN 表達(dá)高度相關(guān)。此外,在 COAD 和 STAD 中,LAYN 表達(dá)與 T 輔助細(xì)胞的幾個(gè)標(biāo)志物(Th1、Th2、Tfh 和 Th17)的調(diào)節(jié)之間存在顯著相關(guān)性。這些相關(guān)性可能表明 LAYN 在 COAD 和 STAD 中調(diào)節(jié) T 細(xì)胞功能的潛在機(jī)制。這些發(fā)現(xiàn)共同表明,LAYN 在 COAD 和 STAD 中免疫浸潤細(xì)胞的募集和調(diào)節(jié)中起重要作用。

最近的研究提供了解釋為什么 LAYN 表達(dá)與免疫浸潤和不良預(yù)后相關(guān)的可能機(jī)制。HA 片段充當(dāng) LAYN 受體的配體,LAYN 僅在與 HA 寡糖(低分子量 <70 kDa 的 HA 片段)結(jié)合時(shí)才被激活 (?39?)。HA 片段可以由腫瘤細(xì)胞合成并積聚在腫瘤基質(zhì)中 (?40?)。間質(zhì)液中小 HA 寡糖的積累與結(jié)直腸癌的淋巴侵襲和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān) (?41?)。HA 寡糖激活 LAYN 可抑制 E-cadherin 蛋白表達(dá),這是腫瘤淋巴轉(zhuǎn)移中上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化 (EMT) 的關(guān)鍵蛋白 (?39)。HA 寡糖可能是導(dǎo)致這些腫瘤中 LAYN 活化增加的原因,并且可能會(huì)增強(qiáng)炎癥因子的分泌,從而導(dǎo)致在腫瘤微環(huán)境 (TME) 中募集更多的免疫細(xì)胞。LAYN 表達(dá)的激活導(dǎo)致許多炎癥因子的分泌顯著增強(qiáng),例如白細(xì)胞介素 (IL)-8、CCL5、可溶性細(xì)胞間粘附分子 (sICAM) 和補(bǔ)體 5 (C5/C5a) (?42?)。這可能是由腫瘤細(xì)胞通過激活 TME 中的相關(guān)信號(hào)傳導(dǎo)而分泌的多種趨化因子募集腫瘤介導(dǎo)的免疫細(xì)胞引起的(43)。因此,LAYN 和 HA 寡糖之間的相互作用可能是 LAYN 表達(dá)與免疫浸潤和 COAD 和 STAD 預(yù)后不良相關(guān)的潛在機(jī)制。

總之,LAYN 表達(dá)增加與多種癌癥,尤其是結(jié)腸癌和胃癌的 CD8+ T 細(xì)胞、CD4+ T 細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和 DCs 中的不良預(yù)后和免疫浸潤水平增加相關(guān)。此外,在胃癌和結(jié)腸癌中,LAYN 表達(dá)可能有助于調(diào)節(jié)腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞 (TAM)、DC、T 細(xì)胞耗竭和 Treg。因此,LAYN 可能在免疫細(xì)胞浸潤中發(fā)揮重要作用,并作為胃癌和結(jié)腸癌患者的預(yù)后生物標(biāo)志物。


LAYN 是一種預(yù)后生物標(biāo)志物,與胃癌和結(jié)腸癌的免疫浸潤相關(guān)的評(píng)論 (共 條)

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