近日，華大生命科學(xué)研究院團(tuán)隊(duì)在《Current Medicine》在線發(fā)表了題為“Spatial transcriptomics in human biomedical research and clinical application”的綜述文章。該文章針對(duì)生命科學(xué)領(lǐng)域當(dāng)前最熱門的技術(shù)——空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)（ST）展開(kāi)論述，探討了其如何以時(shí)空方式跟蹤疾病發(fā)生發(fā)展的機(jī)制，探尋疾病特異性生物標(biāo)記物，以及對(duì)該技術(shù)未來(lái)的發(fā)展前景，為研究者在疾病研究領(lǐng)域更好地利用該技術(shù)提供了參考。

過(guò)去15年來(lái)，單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)與其他多組學(xué)技術(shù)相結(jié)合，在基因組、轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組水平上揭示了人類發(fā)育、腫瘤和復(fù)雜疾病等的機(jī)理。然而，這種方法無(wú)法直接反映相關(guān)的空間信息。空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)的發(fā)展則為解決這一問(wèn)題提供了契機(jī)。

研究表明，ST技術(shù)是解決重大生物醫(yī)學(xué)和臨床問(wèn)題的有效工具，包括腫瘤、腦科學(xué)、胚胎發(fā)育研究、器官圖譜構(gòu)建以及其他復(fù)雜疾病的病理分析。研究人員推測(cè)未來(lái)ST的發(fā)展將進(jìn)一步揭示疾病的時(shí)空背景，并最終推動(dòng)各種疾病的新診斷和新治療。

在ST的發(fā)展過(guò)程中，各種技術(shù)相繼出現(xiàn)。其中，華大自主研發(fā)的時(shí)空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq，憑借納米級(jí)分辨率和厘米級(jí)全景視場(chǎng)的突破性優(yōu)勢(shì)，已助力研究人員在宮頸鱗癌、黑色素瘤、肝癌、糖尿病等疾病研究上實(shí)現(xiàn)了重要突破。

綜上所述，ST標(biāo)志著基因組測(cè)量的新開(kāi)端，有助于探索個(gè)體的動(dòng)態(tài)發(fā)育和疾病過(guò)程?？臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)的創(chuàng)新將為探索人類組織結(jié)構(gòu)和功能提供有力工具，拓展其在生物學(xué)之外的潛在應(yīng)用。

*引用本文

Hu, W., Zhang, Y., Mei, J. et al. Spatial transcriptomics in human biomedical research and clinical application[J]. Current Medicine, 2023. DOI: 10.1007/s44194-023-00023-4.

華大生命科學(xué)研究院臨床科研高級(jí)經(jīng)理胡維寧為論文的第一作者，華大生命科學(xué)研究院方曉東研究員為該文的通訊作者。