土壤DNA提取,還是這種方法比較可取
土壤中的微生物資源非常豐富,原核生物細(xì)胞含量大約1×10^7個(gè)/g,但用傳統(tǒng)技術(shù)培養(yǎng)的微生物僅占微生物總數(shù)的0.01%~10%,且大部分微生物處于不可培養(yǎng)的狀態(tài),使相當(dāng)多的菌種不能被充分地開發(fā)和利用。
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由于土壤微生物成分復(fù)雜,常規(guī)提取總DNA的方法難以去除腐殖酸,而微量的腐殖酸便可抑制PCR擴(kuò)增中的TaqDNA聚合酶以及酶切反應(yīng)的限制性內(nèi)切酶活性。另外,土壤質(zhì)地和成分的差異也會(huì)影響土壤微生物DNA的提取效果.
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國內(nèi)外學(xué)者對(duì)不同的土壤DNA提取和純化方法進(jìn)行了比較研究,現(xiàn)行土壤微生物基因組DNA提取方法可分為直接法和間接法2類,直接法采用原位裂解土壤微生物提取DNA(一般采用直接法),間接法采用速差離心回收菌體,裂解菌體提取DNA.間接法會(huì)大大降低土壤中腐殖酸,重金屬鹽對(duì)DNA提取帶來的影響,但是這種方法會(huì)丟失許多微生物,得到的DNA并非土壤樣品中的全基因組(宏基因組)。
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如何從土壤樣本中提取純化DNA?艾美捷土壤DNA提取純化試劑盒或許可以幫你解決這個(gè)難題。
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艾美捷土壤DNA提取試劑盒特點(diǎn)如下:
1.快速簡便的土壤樣品中微生物檢測(cè)方法;
2.處理所有土壤類型,包括常見的土壤樣品和腐植酸含量高的難處理的土壤樣品,如堆肥和糞肥;
3.使用OSR(Organic Substance Removal)溶液去除有機(jī)物質(zhì);
4.從DNA樣本中去除所有腐殖酸;
5.使用快速離心柱形式進(jìn)行快速簡便的處理;
6.從包括細(xì)菌、真菌和藻類在內(nèi)的各種微生物中分離出高質(zhì)量的總DNA;
7.純化的DNA質(zhì)量很高,完全兼容下游PCR應(yīng)用,因?yàn)樵诜蛛x過程中去除了腐殖酸物質(zhì)和PCR抑制劑。
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艾美捷土壤DNA提取試劑盒樣品使用量與DNA產(chǎn)出數(shù)據(jù)參考:
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艾美捷土壤DNA提取試劑盒操作流程圖:
