DDA（Data Dependent Acquisition）和PRM（Parallel Reaction Monitoring）是兩種不同的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集模式。DDA數(shù)據(jù)依賴采集模式主要用于非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的研究，PRM平行反應(yīng)監(jiān)測則多用于靶向蛋白質(zhì)組學(xué)的研究。?

DDA采集模式在非靶向蛋白質(zhì)定量研究中應(yīng)用廣泛，常見的蛋白質(zhì)定量技術(shù)如Label Free、iTRAQ、TMT和SILAC等都是基于DDA采集模式的質(zhì)譜分析技術(shù)。DDA依賴于預(yù)先設(shè)定的母離子篩選條件選擇合適的母離子進(jìn)行二級質(zhì)譜分析，這種篩選條件下，一些有價值的但不滿足目標(biāo)篩選條件的離子便不能被選擇進(jìn)行碎裂檢測，這就會導(dǎo)致數(shù)據(jù)利用度低，分析不全面。?

PRM是一種基于高分辨率和高精度質(zhì)譜的研究靶向蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)采集技術(shù)。其技術(shù)原理與MRM類似，但PRM多用于對蛋白質(zhì)和多肽進(jìn)行絕對定量，通過高分辨、高精度質(zhì)譜儀（一般為Q-Orbitrap）對目標(biāo)蛋白質(zhì)或修飾肽段進(jìn)行選擇性的檢測，所有的碎片離子經(jīng)過質(zhì)量分析器生成二級質(zhì)譜圖，通過提取其中的碎片離子信息即可實(shí)現(xiàn)目標(biāo)蛋白質(zhì)或肽段的精準(zhǔn)絕對定量，是研究蛋白質(zhì)靶向定量的有力工具。?

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