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拓端tecdat|Python用T-SNE非線性降維技術(shù)擬合和可視化高維數(shù)據(jù)iris鳶尾花、MNIST 數(shù)據(jù)

2021-10-27 21:56 作者:拓端tecdat  | 我要投稿

原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=24002

原文出處:拓端數(shù)據(jù)部落公眾號

T-distributed Stochastic Neighbor Embedding (T-SNE) 是一種可視化高維數(shù)據(jù)的工具。T-SNE 基于隨機鄰域嵌入,是一種非線性降維技術(shù),用于在二維或三維空間中可視化數(shù)據(jù)。

Python?API 提供? T-SNE 方法可視化數(shù)據(jù)。在本教程中,我們將簡要了解如何在 Python 中使用 TSNE 擬合和可視化數(shù)據(jù)。教程涵蓋:

  1. 鳶尾花數(shù)據(jù)集TSNE擬合與可視化

  2. MNIST 數(shù)據(jù)集 TSNE 擬合和可視化

我們將從加載所需的庫和函數(shù)開始。


  1. import seaborn as sns

  2. import pandas as pd??

鳶尾花數(shù)據(jù)集TSNE擬合與可視化

加載 Iris 數(shù)據(jù)集后,我們將獲取數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)和標(biāo)簽部分。?

  1. x = iris.data

  2. y = iris.target?

然后,我們將使用 TSNE 類定義模型,這里的 n_components 參數(shù)定義了目標(biāo)維度的數(shù)量。'verbose=1' 顯示日志數(shù)據(jù),因此我們可以檢查它。

TSNE( verbose=1)

接下來,我們將在圖中可視化結(jié)果。我們將在數(shù)據(jù)框中收集輸出組件數(shù)據(jù),然后使用“seaborn”庫的 scatterplot() 繪制數(shù)據(jù)。在散點圖的調(diào)色板中,我們設(shè)置 3,因為標(biāo)簽數(shù)據(jù)中有 3 種類型的類別。

  1. df = p.Dtame()

  2. df["] = y

  3. df["cm"] =z[:,0]

  4. df[cop"] = z[,]


  5. plot(hue=dfytlst()

  6. patte=ns.cor_ptt("hls", 3),

  7. dat=df)?

MNIST?數(shù)據(jù)集 TSNE 擬合和可視化

接下來,我們將把同樣的方法應(yīng)用于更大的數(shù)據(jù)集。MNIST手寫數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)集非常合適,我們可以使用Keras API的MNIST數(shù)據(jù)。我們只提取數(shù)據(jù)集的訓(xùn)練部分,因為這里用TSNE來測試數(shù)據(jù)就足夠了。TSNE需要太多的時間來處理,因此,我將只使用3000行。


  1. x_train= xtrin[:3000]

  2. y_rin = ytrin[:3000]

  3. print(x_train.shape)?

MNIST 是一個三維數(shù)據(jù),我們將其變形為二維數(shù)據(jù)。?


  1. print(xtishpe)

  2. x_nit = rshap(_rin, [xran.shap[0],xtrn.shap[1]*xrin.shap[2])

  3. print(x_mit.shape)




在這里,我們有 784 個特征數(shù)據(jù)。現(xiàn)在,我們將使用 TSNE 將其投影到二維中,并在圖中將其可視化。

  1. z = tsne.fit(x_mnist)

  2. df["comp1"] = z[:,0]

  3. df["comp2"] = z[:,1]


  4. plot(huedf.tit(),

  5. ata=f)

該圖顯示了 MNIST 數(shù)據(jù)的二維可視化。顏色定義了目標(biāo)數(shù)字及其在 2D 空間中的特征數(shù)據(jù)位置。

在本教程中,我們簡要地學(xué)習(xí)了如何在 Python 中使用 TSNE 擬合和可視化數(shù)據(jù)。

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