It’s not as if…是英語中的固定句式，也可說成 it’s not as though，主要用于表示某個解釋不正確，意思是“好像不是”“顯然不是”“真不是”等。如：

It’s not as if?this was the first time she’s been difficult. 她這人難對付，好像這并不是第一次了。

It isn’t as if?he didn’t recognize me! He just walked straight past me as I stood there. ?他不像是沒認出我！可是我站在那里他逕直從我跟前走過。

I am surprised by the fuss she’s making.?It’s not as if?my personality has changed. ?她的大驚小怪令我很吃驚。顯然不是我的個性改變了。

你的句子意思是：

I don’t know why you’re so frightened of her,?it’s not as if?she’s got any power over you. 我不知道你為什么那么怕她，她好像沒權力管你吧。