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R語言APRIORI關聯(lián)規(guī)則、K-MEANS均值聚類分析中藥專利復方治療用藥規(guī)律網(wǎng)絡可視化|附代

2023-03-27 20:57 作者:拓端tecdat  | 我要投稿

全文鏈接:http://tecdat.cn/?p=30605

最近我們被客戶要求撰寫關于中藥專利復方治療的研究報告,包括一些圖形和統(tǒng)計輸出。

應用關聯(lián)規(guī)則、聚類方法等數(shù)據(jù)挖掘技術分析治療的中藥專利復方組方配伍規(guī)律

方法檢索治療中藥專利復方,排除外用中藥及中西藥物合用的復方。最近我們被要求撰寫關于用藥規(guī)律的研究報告,包括一些圖形和統(tǒng)計輸出。對入選的中藥專利復方進行術語規(guī)范化等處理,抽取信息、建立表,應用數(shù)據(jù)分析軟件R對數(shù)據(jù)進行關聯(lián)規(guī)則分析,應用網(wǎng)絡分析軟件進行聚類分析。

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colnames(data) <- paste0("X",1:ncol(data)) database <- NULLfor(i in 1:nrow(data)) { ?tmp <- integer(length(total_types))

建立apriori

plot(all_rules, method = "graph")

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R語言用關聯(lián)規(guī)則和聚類模型挖掘處方數(shù)據(jù)探索藥物配伍中的規(guī)律

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中藥專利復方中藥對的關聯(lián)規(guī)則分析

藥對是方劑配伍的基本形式,它反映了中藥之間相輔相成、相反相成、同類相從等配伍關系。藥對中的中藥在組方配伍時具有在處方中同時出現(xiàn)的特點,因此在關聯(lián)規(guī)則分析中,分析置信度較大且雙向關聯(lián)的規(guī)則即可得到藥對。?

根據(jù)置信度和支持度篩選強關聯(lián)規(guī)則

K-means均值網(wǎng)絡聚類分析

抑郁癥中藥專利復方中藥物之間形成了一個復雜的配伍關系網(wǎng)絡,關聯(lián)規(guī)則分析可以用來發(fā)現(xiàn)其中的藥對及強關聯(lián)規(guī)則,但隨著支持度和置信度閾值參數(shù)的降低,關聯(lián)規(guī)則大量涌現(xiàn),使得其中的配伍規(guī)律變得難以分析,應用網(wǎng)絡聚類方法可以有效地發(fā)現(xiàn)其中的配伍規(guī)律。

#聚類類別號kmod$cluster

查看每個類別中的強關聯(lián)規(guī)則

聚類1

聚類2

配伍關系網(wǎng)絡的聚類分析結果顯示了抑郁癥治療中常用的中藥“社團”,反映了復方中一些配伍關系相對密切、固定的中藥聯(lián)合,臨床運用可以提高療效。

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本文選自《R語言APRIORI關聯(lián)規(guī)則、K-MEANS均值聚類數(shù)據(jù)挖掘中藥專利復方治療用藥規(guī)律網(wǎng)絡可視化》。

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