python機(jī)器學(xué)習(xí)-乳腺癌細(xì)胞挖掘:http://dwz.date/bwey

前言

警鐘長(zhǎng)鳴！癌癥離我們遠(yuǎn)嗎？《我不是藥神》催人淚下，筆者在此揭露真相，癌癥不是小概率疾病，癌癥就在身邊。癌癥早期發(fā)現(xiàn)和控制可極大延長(zhǎng)壽命和減少治療費(fèi)用。筆者下載美國(guó)威斯康辛臨床數(shù)據(jù)，運(yùn)用python sklearn建立乳腺癌分類器模型，可預(yù)測(cè)正常細(xì)胞和癌細(xì)胞。

乳腺癌

乳腺癌是威脅我國(guó)女性健康最主要的惡性腫瘤之一，根據(jù)世界衛(wèi)生組織國(guó)際癌癥研究機(jī)構(gòu)全球184個(gè)國(guó)家和地區(qū)的癌癥報(bào)告，中國(guó)女性乳腺癌的發(fā)病率和死亡率在全球中處于較低水平，但是發(fā)病人數(shù)占全球的11.19%，僅次于美國(guó)，且近20年來發(fā)病率與死亡率增長(zhǎng)迅速，防控形勢(shì)嚴(yán)峻。

乳腺癌位居女性惡性腫瘤發(fā)病首位

根據(jù)國(guó)家癌癥中心公布的數(shù)據(jù)，2014年全國(guó)女性乳腺癌新發(fā)病例約27.89萬例，占女性惡性腫瘤發(fā)病16.51%，位居女性惡性腫瘤發(fā)病第1位。

其中，城市地區(qū)女性乳腺癌新發(fā)病例約18.46萬，農(nóng)村地區(qū)女性乳腺癌新發(fā)病例約9.43萬。

中國(guó)是乳腺癌發(fā)病率增長(zhǎng)速度最快的國(guó)家之一,并且以每年2%的速度遞增，癌癥負(fù)擔(dān)在不斷增加。在全球范圍內(nèi)，中國(guó)占據(jù)新診斷乳腺癌病例的12.2%，占據(jù)乳腺癌死亡的9.6%。

55歲是女性乳腺癌發(fā)病高峰

中國(guó)女性乳腺癌發(fā)病率在20歲之前處于較低的水平，此后發(fā)病率隨年齡增長(zhǎng)迅速上升，并于55歲年齡組達(dá)到高峰，而后隨年齡增長(zhǎng)下降。

城鄉(xiāng)地區(qū)年齡別發(fā)病率曲線與全國(guó)女性乳腺癌發(fā)病情況類似，但城市地區(qū)女性乳腺癌發(fā)病水平高于農(nóng)村，城市地區(qū)發(fā)病率最高出現(xiàn)在60歲年齡組。30~60歲年齡組城市地區(qū)女性乳腺癌發(fā)病率約為農(nóng)村地區(qū)的1.5倍，65歲年齡組后達(dá)2倍以上。

一方面這可能與城市居民生活條件較好，脂肪等攝入過多，肥胖增加以及人口老齡化程度高有關(guān)；另一方面由于城市女性受教育程度較高，初產(chǎn)年齡較晚，未產(chǎn)、母乳喂養(yǎng)的時(shí)間減少等導(dǎo)致乳腺癌發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)更高。

女性乳腺癌死亡率隨年齡增長(zhǎng)逐漸升高

同時(shí)，中國(guó)女性乳腺癌25歲后死亡率隨年齡增長(zhǎng)迅速上升，并于60歲年齡組達(dá)到高峰后略有下降，70歲年齡組后再次上升，并于85歲以上年齡組達(dá)到死亡高峰。城鄉(xiāng)地區(qū)年齡別死亡率變化趨勢(shì)與全國(guó)相似。

課程概述

Toby，持牌照金融公司擔(dān)任模型驗(yàn)證專家,國(guó)內(nèi)最大醫(yī)藥數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)挖掘部門負(fù)責(zé)人！此課程講述如何運(yùn)用python的sklearn快速建立機(jī)器學(xué)習(xí)模型。課程結(jié)合美國(guó)威斯康辛乳腺癌細(xì)胞臨床數(shù)據(jù)，實(shí)操演練，建立癌細(xì)胞預(yù)測(cè)分類器。

本視頻系列通俗易懂，課程針對(duì)學(xué)生和科研機(jī)構(gòu)，python愛好者。
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了解癌癥腫瘤基本常識(shí)，建立健康生活方式，預(yù)防癌癥，減輕癌癥治療成本。?

課程中十大經(jīng)典機(jī)器學(xué)習(xí)算法震撼登場(chǎng)：邏輯回歸，支持向量，KNN,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，隨機(jī)森林，xgboost,lightGBM,catboost。課程提供視頻里講解腳本，這些模型腳本可以應(yīng)用于各個(gè)領(lǐng)域數(shù)據(jù)，包括金融反欺詐模型，信用評(píng)分模型，收入預(yù)測(cè)模型等等，為中小企業(yè)提供現(xiàn)成解決方案。

隨機(jī)森林變量權(quán)重可視化

課程耗費(fèi)三年時(shí)間，360度無死角的講述整個(gè)模型開發(fā)周期，非市場(chǎng)上快餐教學(xué)。教程包括數(shù)據(jù)獲取，數(shù)據(jù)預(yù)處理，變量篩選，模型篩選，模型評(píng)估，模型調(diào)參。

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Anaconda+KNN+網(wǎng)格調(diào)參+交叉驗(yàn)證?

目錄

章節(jié)1:癌癥常識(shí)

課時(shí)1警鐘長(zhǎng)鳴！癌癥就在你身邊11:00

課時(shí)2癌癥科普介紹23:05

課時(shí)3病毒細(xì)菌誘發(fā)的癌癥20:43

課時(shí)4禍從口入-致癌食物大揭秘08:37

課時(shí)5Python機(jī)器學(xué)習(xí)挖掘癌細(xì)胞概述13:11

章節(jié)2:sklearn編程環(huán)境搭建

課時(shí)6Python非官方擴(kuò)展包下載地址02:21

課時(shí)7python第三方包安裝(pip和conda install) 02:48

課時(shí)8Anaconda下載安裝07:02

課時(shí)9Canopy下載和安裝03:47

章節(jié)3:sklearn機(jī)器學(xué)習(xí)基礎(chǔ)知識(shí)

課時(shí)10機(jī)器學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)庫介紹02:19

課時(shí)11機(jī)器學(xué)習(xí)書籍推薦02:59

課時(shí)12Python數(shù)據(jù)科學(xué)常用的包13:14

課時(shí)13如何選擇模型03:57

課時(shí)14sklearn算法速查表02:29

課時(shí)15sklearn建?；A(chǔ)代碼18:19

課時(shí)16python數(shù)據(jù)科學(xué)入門介紹（選修）55:15

章節(jié)4:獲取乳腺癌臨床數(shù)據(jù)

課時(shí)17數(shù)據(jù)獲取-乳腺癌細(xì)胞臨床數(shù)據(jù)07:06

章節(jié)5:變量篩選和描述性統(tǒng)計(jì)

課時(shí)18因子分析-解釋癌細(xì)胞特征33:24

課時(shí)19變量篩選1-模型法11:50

課時(shí)20變量篩選2-比例法percentile07:04

課時(shí)21變量篩選3-方差法（推薦）06:36

課時(shí)22變量篩選4-KBest01:59

章節(jié)6:十大經(jīng)典機(jī)器學(xué)習(xí)算法-建立乳腺癌細(xì)胞分類器

課時(shí)23邏輯回歸logistic regression27:17

課時(shí)24支持向量SVM13:48

課時(shí)25KNN最近鄰算法13:38

課時(shí)26決策樹-decision tree21:59

課時(shí)27隨機(jī)森林-random forest14:02

課時(shí)28神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)neural network17:07

課時(shí)29xgboost12:27

課時(shí)30lightGBM03:51

課時(shí)31catboost07:08

課時(shí)32算法優(yōu)劣對(duì)比10:52

課時(shí)33bagging VS boosting05:51

章節(jié)7:數(shù)據(jù)預(yù)處理

課時(shí)34pandasl數(shù)據(jù)處理基礎(chǔ)知識(shí)15:50

課時(shí)35啞變量處理-hotcode熱編碼06:14

課時(shí)36imputer-缺失數(shù)據(jù)處理04:49

課時(shí)37scale-數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化處理12:13

章節(jié)8:模型調(diào)參

課時(shí)38遍歷調(diào)參法05:15

課時(shí)39網(wǎng)格調(diào)參106:10

課時(shí)40網(wǎng)格調(diào)參204:26

課時(shí)41隨機(jī)網(wǎng)格調(diào)參02:29

章節(jié)9:模型驗(yàn)證

課時(shí)42交叉驗(yàn)證cross validation03:45

課時(shí)43模型驗(yàn)證前言12:15

課時(shí)44混淆矩陣14:16

課時(shí)45ROC曲線11:57

課時(shí)46PSI（population stability index）10:20

課時(shí)47基尼系數(shù)GINI index25:16

課時(shí)48KS（kolmogorov-smirnoff）06:51

章節(jié)10:附錄

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課時(shí)50顯微鏡下癌細(xì)胞

python機(jī)器學(xué)習(xí)生物信息學(xué)系列課（博主錄制）：http://dwz.date/b9vw