在與企業(yè)最為相關(guān)的“認定條件與程序”、“監(jiān)督管理”的兩個方面，新管理辦法均做出了很大調(diào)整：一是降低高新技術(shù)企業(yè)認定的具體條件，讓更多科技企業(yè)受惠于國家政策，在科研人員比例、研發(fā)費用占比等核心條件上放寬標準；二完善以往政策的不足，提高政策彈性，更加符合實際；三是明顯強化后續(xù)監(jiān)督力度，提高對企業(yè)合規(guī)性的要求，違規(guī)成本增大。

　　新辦法增加了“需提供近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表”、每年4月底前在高新企業(yè)認定管理工作網(wǎng)填報“上一年度知識產(chǎn)權(quán)、科技人員、研發(fā)費用、經(jīng)營收入等年度發(fā)展情況報表”等要求，同時，規(guī)定“累計兩年未填報年度發(fā)展情況報表的將取消高新資格”，可見，國家對于高新企業(yè)的后續(xù)管理寄予了充分的重視，也是2013年大檢查的延續(xù)，企業(yè)需要予以充分的關(guān)注。事實上，按照《稅收征管法（修改意見稿）》的規(guī)定，未來騙取稅收優(yōu)惠資格將納入“偷稅”范圍，將被處以罰款甚至刑事責任，切不可大意。

與以往管理辦法，在高新企業(yè)認定條件、后續(xù)管理等方面有八大變化：

變化一：

　　在知識產(chǎn)權(quán)方面，取消獨占許可類型的知識產(chǎn)權(quán)。與自主研發(fā)、受讓、受贈、并購等取得知識產(chǎn)權(quán)相比，“獨占許可”取得知識產(chǎn)權(quán)是通過簽署“獨占許可協(xié)議”的方式獲取，涉及境外知識產(chǎn)權(quán)在中國境內(nèi)的獨占許可協(xié)議，目前國家知識產(chǎn)權(quán)局尚不予受理備案登記，主管機關(guān)核查困難，在此背景下，新規(guī)予以取消。

變化二：

　　在人員比例方面，放寬對科技人員和研發(fā)人員比例的要求。新辦法由現(xiàn)行“科技人員占企業(yè)當年職工總數(shù)的30%以上”調(diào)整為“科技人員占企業(yè)當年職工總數(shù)的比例不低于10%”，同時取消了“大學(xué)專科以上學(xué)歷”的限制；取消“研發(fā)人員占企業(yè)當年職工總數(shù)的10%以上”的規(guī)定。對于部分傳統(tǒng)行業(yè)的大型企業(yè)而言，是一大利好。

變化三：

　　在研發(fā)費用方面，降低研發(fā)費用比例要求。研發(fā)費用比例是在高新企業(yè)認定中最為核心的指標之一，新辦法將“三檔”降為“兩檔”，以2億元作為分水嶺，設(shè)置4%和3%兩個比例。將2億元以下統(tǒng)一設(shè)置為4%，取消6%的比例規(guī)定，意在鼓勵中小企業(yè)的科技創(chuàng)新和發(fā)展，使得包括“新三板”在內(nèi)的中小企業(yè)可以申請高新資格。

變化四：

　　在申請材料方面，增加企業(yè)所得稅年度納稅申報表。新辦法規(guī)定，申請高新資格提交的材料中應(yīng)包含“近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表 ”，同時，對企業(yè)稅務(wù)的規(guī)范性提出了更高的要求，企業(yè)歷年的納稅申報記錄與會計報表等提交其他資料應(yīng)保證內(nèi)在邏輯的一致性。2014版申報表由原來的17張增加到41張，為稅務(wù)機關(guān)開展所得稅后續(xù)管理和風險管理、納稅評估提供了基礎(chǔ)信息。