最近，有很多經(jīng)典的研究方向又開始獲得CNS級別期刊的青睞，比如小云前面講過的“細胞衰老”，這回又看到1個Nature重磅綜述（IF=108.555）研究“線粒體調(diào)控炎癥”

文章講到：許多線粒體成分和代謝產(chǎn)物可以作為損傷相關(guān)分子模式(DAMPs)在釋放到細胞溶質(zhì)或細胞外環(huán)境時促進炎癥，并且失控的炎癥反應涉感染性和自身免疫性疾病，神經(jīng)，心血管，腫瘤疾病等眾多人類疾病。文章討論了mtDAMPs引發(fā)炎癥的分子機制，線粒體控制炎癥過程的信號轉(zhuǎn)導級聯(lián)反應，以及線粒體調(diào)節(jié)的炎癥在人類疾病中的相關(guān)性。

當然是，線粒體這個研究方向依然是大熱門??！

出于生信人的直覺，第一想法就是：線粒體作為一個經(jīng)典又熱門的方向，現(xiàn)在生信發(fā)文潛力和空間如何？（這可怕的直覺，看啥都想生信）

Pubmed里轉(zhuǎn)一圈就發(fā)現(xiàn)，線粒體方向的生信文章確實不少，但高分的也很多，也證明這個方向的生信發(fā)文前景依然堅挺呀！

再說說發(fā)文空間，線粒體與腫瘤和很多非腫瘤疾病都密切相關(guān)，也就是說可研究疾病范圍廣泛；另外，線粒體與細胞死亡、免疫、氧化應激、腫瘤代謝等大熱點也密切相關(guān)，在研究廣度上也有一定的拓展，可以多熱點關(guān)聯(lián)研究（比如鐵死亡和線粒體）。這兩個方面都使得線粒體方向的發(fā)文空間有橫向和縱向的拓展。

簡單來說就是，前景一片大好，可以放心上車！（還在找生信方向的小伙伴看過來，線粒體就像六邊形戰(zhàn)士，熱門又百搭，拿下高分不在話下）

1、線粒體功能障礙+非腫瘤疾病

題目：原發(fā)性干燥綜合征中線粒體功能障礙與唾液腺免疫微環(huán)境之間的聯(lián)系

研究思路：線粒體相關(guān)基因和基因表達數(shù)據(jù)從MitoMiner、MitoCarta和GEO數(shù)據(jù)庫下載。通過生信分析構(gòu)建了pSS-唾液腺中線粒體功能和免疫微環(huán)境之間的網(wǎng)絡。隨后，在臨床樣本中進行qPCR以驗證生物信息學結(jié)果。對非pSS和pSS患者的唇唾液腺樣本進行組織學染色和透射電子顯微鏡(TEM)進一步研究以觀察疾病不同階段的線粒體相關(guān)表型（詳見下圖）。

2、線粒體相關(guān)基因構(gòu)建腫瘤預后模型

題目：線粒體相關(guān)轉(zhuǎn)錄組特征與肝細胞癌的預后、血管侵犯、腫瘤微環(huán)境和治療反應相關(guān)

研究思路：147個核線粒體相關(guān)基因(NMRGs)從MITOMAP數(shù)據(jù)庫下載。應用單變量和多變量以及LASSO Cox回歸分析來構(gòu)建NMRG特征，并利用ROC曲線下面積(AUC)的值來評估特征和列線圖。進一步研究高風險和低風險人群之間的功能分化、腫瘤微環(huán)境和精準治療的治療反應（詳見下圖）。

3、線粒體能量代謝+腫瘤生化復發(fā)

題目：能量代謝相關(guān)基因預后指數(shù)預測接受根治性前列腺切除術(shù)的前列腺癌患者生化復發(fā)

研究思路：首先基于TCGA-PCa隊列數(shù)據(jù)進行差異基因分析，以及通過WGCNA識別腫瘤相關(guān)基因。隨后，通過腫瘤相關(guān)基因、DEGs和能量代謝相關(guān)基因的交集來確定候選基因。使用Lasso和COX回歸分析找出與無BCR生存率相關(guān)的獨立風險基因，然后建立能量代謝相關(guān)基因預后指數(shù)(EMRGPI)。隨后進行KM生存分析，并利用ROC曲線評估EMRGPI對BCR的預測能力。評估EMRGPI與TME的相關(guān)性，并根據(jù)EMRGPI中位數(shù)將患者分為高低風險組進行GSEA分析（詳見下圖）。

小結(jié)

看完這幾篇近期發(fā)表的文章，想必小伙伴們也能感受到“線粒體”方向生信文章分數(shù)依然堅挺！當你不知道自己關(guān)注的疾病應該選怎么生信切入點時，線粒體作為一個經(jīng)典熱門又百搭的方向總能給你一線希望，試試它準沒錯。既能單兵作戰(zhàn)，又能與其他熱點強強聯(lián)手，既可做生信，又能延伸做大課題，說它是發(fā)文和申課題利器不為過吧？