微生物多樣性+轉(zhuǎn)錄組測序開發(fā)了一種可預防齲齒的新型抗菌肽
前言
齲齒(蛀牙)是最普遍的口腔疾病,嚴重危害人類公共健康,治療費用昂貴。齲齒是細菌生物膜引起的常見疾病。目前臨床防治藥物往往會對口腔微生物多樣性和正常組織產(chǎn)生不良影響,主要原因是藥物的生物膜靶向性較差。因此,開發(fā)高效破壞致齲細菌生物膜的抗菌劑對齲齒的防治尤為迫切和重要。
近日,湖南師范大學工程實驗室張鵬博士后、劉中華教授和南開大學余志林研究員為共同通訊作者,在 ?期刊(IF:11.556)發(fā)表了題為“Dual-sensitive antibacterial peptide nanoparticles prevent dental caries”的研究論文,報道了一種pH和脂質(zhì)雙敏感性抗菌肽納米粒子pHly-1 NPs用于齲齒的防治。
研究結(jié)果
1、?pHly-1依賴于pH和脂質(zhì)進行構(gòu)象轉(zhuǎn)變
首先通過氨基酸替換策略,選擇性的引入組氨酸作為pH敏感元件、調(diào)整多肽的電荷以及疏水性,設計pHly-1肽,隨后對pHly-1的電位、形態(tài)和二級結(jié)構(gòu)進行了表征。在正常生理條件下,pHly-1采用β-折疊構(gòu)象。在酸性環(huán)境下,pHly-1呈無規(guī)則卷曲構(gòu)象,當與脂質(zhì)雙分子層結(jié)合時,pHly-1肽的構(gòu)象由無規(guī)則卷曲構(gòu)象變換為α-螺旋。多肽的TEM形貌表明,在酸性條件下多肽為大小約40 nm的球形顆粒,而在中性條件下則為長度約400 nm的纖維。
圖1|pHly-1設計及其pH或脂質(zhì)響應構(gòu)象
2、pHly-1顯示pH和脂質(zhì)雙敏感的抗菌活性
變形鏈球菌UA159()的最低抑制濃度(MICs)檢測和溶血實驗測定結(jié)果顯示,pHly-1 NPs抗菌活性高,且溶血活性?。▓D2A-B)。在pH 5.5和7.0時,pHly-1 NPs 的MIC值分別為5.5 μM和大于44 μM。殺菌動力學表明,pHly-1 NPs殺菌迅速,且具有pH依賴性,效果優(yōu)于CHX(口服抗菌治療金標準)(圖2C-D)。
表明了pHly-1是一種pH敏感的抗菌肽,在酸性條件下具有強而快速的殺菌活性。其發(fā)揮雙敏感的潛在機制如圖2E所示:在酸性pH環(huán)境下,當pHly-1與細菌膜表面結(jié)合時,構(gòu)象由無規(guī)則卷曲轉(zhuǎn)變?yōu)棣?螺旋,導致膜破壞從而表現(xiàn)出較強的抗菌活性。相反,在中性環(huán)境下,pHly-1呈β-折疊構(gòu)象,彼此間通過多種弱相互作用力而發(fā)生堆積,限制了多肽對細菌細胞膜的作用,因此抗菌活性較低。
圖2|pHly-1抗菌活性的機制
3、pHly-1 NPs抗菌活性的機理分析
直接破壞細菌膜是大多數(shù)抗菌肽殺滅細菌最常見的機制。該研究,通過SEM細菌形態(tài)觀察和熒光雙染研究,證實pHly-1 NPs在pH4.5酸性條件下具有破壞細菌膜的作用,表現(xiàn)出殺菌作用(圖3A-B)。轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)進一步顯示,pHly-1 NPs處理后,引起195個基因差異表達(DEGs)。功能富集分析顯示,主要涉及蛋白質(zhì)折疊、細胞程序性死亡、細胞溶解、轉(zhuǎn)錄調(diào)控等與在細菌的生存和生長相關條目(圖3C)。
此外,pHly-1 NPs處理導致了細胞溶解調(diào)控基因的表達增加,糖代謝、核酸代謝和DNA復制的基因表達降低(圖3D)。除了破壞細菌膜外,與抗菌活性和群體感應相關基因表達下調(diào),群體感應相關基因基因與細菌生物膜發(fā)育過程中細菌增殖和群體行為調(diào)節(jié)有關(圖3D)。該結(jié)果也為解釋了pHly-1 NPs抑制細菌生物膜形成和發(fā)展奠定了一定基礎。
圖3|不同pH條件下,pHly-1 NPs或CHX處理細菌后的顯微研究、熒光染色和轉(zhuǎn)錄組分析
4、pHly-1 NPs體外抑制生物膜的形成和發(fā)展
該研究首先測定了pHly-1 NPs對細菌粘附的影響,實驗表明其能抑制了生物膜形成初期的細菌附著。為了進一步評估pHly-1 NPs對預形成生物膜發(fā)展的抑制效果,首先讓在載玻片上逐漸形成生物膜,12小時后,用55 μM pHly-1 NPs或CHX,在不同的pH下,處理生物膜10 min,每天一次共計處理3次。隨后采用SEM和共聚焦顯微鏡對生物膜進行成像,圖A中藍色箭頭以及圖B中的綠色熒光代表著,而紅色箭頭以及紅色熒光則代表著形成的EPS基質(zhì)。
實驗表明在pH 4.5下,pHly-1 NPs處理組中的生物膜團簇、細菌數(shù)量和EPS基質(zhì)密度顯著低于對照組(圖4A-B)。然而,在對照組、pH 7 條件下的pHly-1 NPs和CHX處理組之間沒有觀察到顯著變化(圖4A-B)。以上數(shù)據(jù)表明,pHly-1 NPs可能以pH依賴性的方式抑制生物膜的形成和發(fā)展。
圖4|體外酸性條件下pHly-1 NPs對細菌生物膜形成和發(fā)展的抑制作用
5、pHly-1 NPs體內(nèi)和體外的齲齒抑制作用
基于唾液包被的羥基磷灰石(sHA)的生物膜形成實驗,作者首先觀察到,pHly-1 NPs處理顯著減少了sHA表面細菌生物膜的數(shù)量和大小,將形成的生物膜超聲、勻漿,利用CFU計數(shù)法統(tǒng)計各處理組細菌的活力,表明pHly-1 NPs和CHX均能顯著抑制生物膜的形成與發(fā)展(圖5A-B)。
隨后收集患有嚴重齲齒兒童的牙菌斑生物膜樣本,分離變形鏈球菌,建立生物膜模型,進一步測試pHly-1 NPs對齲齒生物膜的抑制效果。實驗表明在pHly-1 NPs處理組中對形成的細菌生物膜網(wǎng)絡具有顯著的抑制作用(圖5C-D)。上述實驗表明了在酸性條件下,pHly-1 NPs顯著抑制了體外生物膜的形成與發(fā)展。
圖5|pHly-1 NPs體外的齲齒抑制作用
作者基于變形鏈球菌感染幼鼠牙齒的大鼠模型的體外實驗,發(fā)現(xiàn)pHly-1 NPs治療對初始、中度和重度病變的均能有效緩解。但CHX治療僅緩解嚴重的病變,對于初始和中度病變的治療效果顯著低于pHly-1 NPs,說明pHly-1 NPs的治療效果優(yōu)于CHX,并且對大鼠具有良好的生物安全性(圖6)。同時,細胞和類器官等毒性實驗也證實了,pHly-1 NPs對胃組織毒性較低,有效預防已報道的齲齒防治納米顆粒對胃組織造成的潛在損傷。
圖6|pHly-1 NPs體內(nèi)的齲齒抑制作用
6、pHly-1 NPs對口腔菌群及周圍組織的不良影響分析
為了評估pHly-1 NPs和CHX應用于漱口水的臨床安全性,將0.2 %的pHly-1 NPs或CHX處理后的小鼠唾液進行微生物組分析。pHly-1 NPs對門水平和屬水平的菌群組成并無影響(圖7A-C),與對照組結(jié)果更為相似(圖7D),且不改變口腔微生物的多樣性(圖7E-F),表明pHly-1 NPs沒有破壞微生物群的生態(tài)平衡。此外,H&E染色顯示pHly-1 NPs對小鼠牙齦、腭和胃組織沒有明顯的有害影響(圖7G),不良反應僅發(fā)生在CHX治療組。
圖7|pHly-1 NPs對口腔菌群及周圍組織的不良影響分析
研究結(jié)論
本文研發(fā)了pH和脂質(zhì)雙敏感的抗菌肽pHly-1,在酸性致齲生物膜微環(huán)境中,pHly-1與細菌膜結(jié)合后發(fā)生螺旋構(gòu)象轉(zhuǎn)變,從而殺死致齲細菌。pHly-1治療效果優(yōu)于臨床用藥CHX,對齲齒的預防和治療具備有效、安全的性能。這種肽設計策略為提高抗菌肽的生物相容性和應用于抗菌藥物開發(fā)提供了新的途徑。
湖南師范大學張鵬博士后、吳賽芝、李瑾婷以及長沙市口腔醫(yī)院卜曉霜為論文的共同第一作者。該研究還得到了梁宋平教授與本?;ぴ涸恿纸淌诘拇罅χС帧?/strong>
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