免費的基因編輯系統(tǒng)神器—紅棉CRISPR基因編輯系統(tǒng)—源井生物
眾所周知,CRISPR/Cas技術相較于其他編輯手段有很大的優(yōu)勢,但是在實際應用CRISPR/Cas技術進行基因敲除時,難免會遇到許多問題,畢竟CRISPR/Cas技術從被發(fā)現(xiàn)到被使用也不過寥寥數(shù)年,實驗經驗較為不足,這不僅導致實驗試錯成本增加,甚至會影響科研人員的積極性。

而減少試錯成本最重要的手段就是預先設計實驗方案并進行預實驗,但是一個好的實驗方案真的這么容易設計嗎?僅僅gRNA的序列設計這一步就要考慮各種問題,包括如何才能覆蓋更多的轉錄本,如何盡量避免截短蛋白的表達,要同時使用幾個gRNA等等,甚至基因測序結果已經明確地表明已經完全敲除了,但WB的結果卻讓人仿佛在看一場世紀靈異事件大賞……
因此一個便捷又智能的CRISPR基因編輯方案設計工具就十分重要了,但且不說這個方案設計系統(tǒng)是否使用便捷,最基本的是,我們要如何確保這個系統(tǒng)設計出來的方案可行性足夠高呢?

目前國內只有一個由源井生物自主研發(fā)的免費CRISPR基因編輯系統(tǒng)——紅棉CRISPR基因編輯系統(tǒng),那么就來看看源井生物的專家團隊是如何解決這個問題的?
除了結合了兩大數(shù)據(jù)庫(Ensemble、NCBI數(shù)據(jù)庫)的龐大數(shù)據(jù),他們還加入了5000例基因成功敲除的獨家真實數(shù)據(jù),并進一步結合生物信息技術對這些大數(shù)據(jù)進行多維度的全方面分析,綜合計算了所有轉錄本、外顯子、編碼區(qū)的位置、大小等參數(shù),最終綜合得出最佳gRNA敲除區(qū)域,當然方案中還有更多能供你評估敲除風險的參數(shù),具體的使用方法可點擊了解。
除了保證紅棉系統(tǒng)所設計的方案的可行性,源井生物的專業(yè)團隊也在不斷優(yōu)化-紅棉系統(tǒng)的使用感,目前紅棉系統(tǒng)可智能設計涵蓋10大研究物種的基因敲除方案,只需輸入基因名/基因ID就可得到3套優(yōu)質的gRNA基因敲除方案,包括移碼敲除、小片段敲除或大片段敲除,能基本滿足你的研究需求,并且沒有復雜的注冊流程,只需掃碼關注公眾號即可使用,后續(xù)也可通過掃描二維碼進行登錄使用,進一步節(jié)約你的寶貴時間。
當然,從紅棉系統(tǒng)上線至今,也有許多科研工作者對紅棉系統(tǒng)以及背后的源井生物團隊表示認可或者提出寶貴建議,在未來源井生物也會秉持著最初的目標不斷前行,讓更多對CRISPR/Cas9技術感興趣的科研工作者們在使用CRISPR/Cas9技術時能更多地感受到這個被譽為“基因剪刀”的基因編輯工具的魅力,而不是被信息滯后等多種因素影響對科研的熱情。