擴增子測序是對特定長度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進行測序，目前主要是應(yīng)用高通量測序技術(shù)對特定環(huán)境中特定遺傳物質(zhì)進行測序。大多數(shù)天然微生物都不能通過傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)方法進行分離和克隆，這對于天然微生物定性和定量，探索微生物多樣性是嚴(yán)重的挑戰(zhàn)。擴增子測序可以克服傳統(tǒng)分離培養(yǎng)的弱點，對樣品中的微生物進行定性和定量，目前在微生物多樣性檢測中廣泛應(yīng)用。

16S和18S rDNA是細(xì)菌和真菌中16s或18s rDNA基因的高變區(qū)，而ITS（Internal Transcribed Spacer）則是細(xì)菌、真菌和古細(xì)菌中小亞基和大亞基rRNA基因之間的間隔區(qū)DNA。這些特定的遺傳物質(zhì)都包括進化保守性及進化可變區(qū)。由于PCR擴增容易，可以從少量DNA中擴增出來，而基因序列即使在近緣種間也有高度的變異，因而擴增子測序在分類學(xué)和分子系統(tǒng)學(xué)中得到了廣泛的應(yīng)用。

根據(jù)研究目的不同擴增子測序可細(xì)分為如下幾個產(chǎn)品類型：

16S rDNA測序：16S rDNA是編碼16S rRNA的基因，存在于所有細(xì)菌基因組。16S rDNA既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異，又能利用測序技術(shù)較容易地得到其序列，目前被廣泛用于病原菌的檢測和鑒定。16S rRNA的可變區(qū)經(jīng)常用于不同微生物群落的屬或種系統(tǒng)進化分類。

18S rDNA測序：18S rDNA為編碼真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。在結(jié)構(gòu)上分為保守區(qū)和高變區(qū)，保守區(qū)反映生物物種間的親緣關(guān)系，高變區(qū)反映物種間的差異，18S rDNA在進化速率上相對于ITS更加保守。

ITS測序：在真核生物中，18S rDNA和28S rDNA轉(zhuǎn)錄間隔序列稱為ITS區(qū)。ITS由于是非轉(zhuǎn)錄區(qū)，承受的選擇壓力較小，變異強。ITS屬于中度保守區(qū)域，利用它可研究種及種以下的分類階元。

擴增子測序技術(shù)優(yōu)勢：

鑒定效率高：與克隆或培養(yǎng)等傳統(tǒng)鑒定方法相比，微生物群16S/18S/ITS測序是一種更快、更準(zhǔn)確的方法；
雙區(qū)檢測：針對一個或多個可變區(qū)域的靈活性，能夠進行更長的序列讀取，并能夠?qū)溥M行更準(zhǔn)確的分析；
較低的成本：與宏基因組測序相比，對測序深度的要求更低，性價比較高；
高靈敏度：可以鑒定出豐度極低的細(xì)菌。

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擴增子測序分析流程：

擴增子測序服務(wù)優(yōu)勢：

經(jīng)驗豐富的技術(shù)人員，可以提供從實驗設(shè)計、樣品檢測、數(shù)據(jù)分析等全套專業(yè)服務(wù)；
流程明確，減少不必要的樣品和時間浪費，交付時間短；
不同來源樣本采用不同提取方法和建庫測序策略，滿足多種環(huán)境研究需求；
百泰派克生物科技擁有蛋白組、代謝組等分析平臺，可進行多組學(xué)整合分析，提升文章質(zhì)量。

擴增子測序樣品要求：

樣品類型：Meta樣品，如糞便、土壤等或Meta DNA樣品均可進行檢測。具體要求請咨詢技術(shù)人員。

擴增子測序案例展示：