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MS軟件模塊翻譯-GULP擬合力場(chǎng)任務(wù)

2023-06-11 10:14 作者:邱新龍分子模擬小破屋  | 我要投稿



GULP擬合力場(chǎng)任務(wù)允許您生成新的或擬合的力場(chǎng)庫(kù),以便在后續(xù)的GULP計(jì)算中使用,方法是將現(xiàn)有力場(chǎng)與物理參數(shù)的實(shí)驗(yàn)確定值進(jìn)行擬合。

注:Brenner、Brenner1、EDIP carbon、EDIP Si、ReaxFF 5.5、ReaxFF 6.0、ReaxFF-Li、MEAM-1nn、MEAM-2nn和Dreiding力場(chǎng)庫(kù)不能用于力場(chǎng)擬合。




1.1.3.1執(zhí)行力場(chǎng)擬合運(yùn)行

1.將包含要用于力場(chǎng)擬合運(yùn)行的可觀測(cè)值的結(jié)構(gòu)導(dǎo)入到當(dāng)前項(xiàng)目中。

2.從菜單欄中選擇Modules | GULP | Calculation(模塊|GULP |計(jì)算)以顯示GULP Calculation對(duì)話框。

3.選擇“設(shè)置”選項(xiàng)卡,然后從“任務(wù)”下拉列表中選擇“擬合力場(chǎng)”。

4.從“力場(chǎng)”下拉列表中選擇要編輯的現(xiàn)有力場(chǎng)?;蛘?,選擇“瀏覽…”...

以顯示“選擇GULP力場(chǎng)”對(duì)話框,并在當(dāng)前項(xiàng)目中或從本地或網(wǎng)絡(luò)位置找到要編輯的合適的力場(chǎng)庫(kù)文件(.lib)。然后,所選文件將顯示在“力場(chǎng)”下拉列表中,并導(dǎo)入到當(dāng)前項(xiàng)目中(如果該文件尚未存在)。

5.點(diǎn)擊更多...按鈕顯示“GULP擬合力場(chǎng)”對(duì)話框,然后選擇“力場(chǎng)”選項(xiàng)卡。

6.如果您希望編輯所選力場(chǎng)庫(kù)中的力場(chǎng)類型,并更改為這些力場(chǎng)類型指定的電荷,請(qǐng)單擊類型...按鈕,以顯示“GULP力場(chǎng)類型”對(duì)話框并相應(yīng)地更改內(nèi)容。

7.從勢(shì)函數(shù)作用類型下拉列表中選擇一個(gè)相互作用。根據(jù)選擇,將啟用適當(dāng)數(shù)量的“力場(chǎng)類型”方案。通過(guò)從下拉列表中選擇所需的力場(chǎng)類型來(lái)定義要編輯的特定相互作用。




8.單擊“功能表單”字段。下拉列表將顯示可用于指定勢(shì)函數(shù)作用類型和力場(chǎng)類型的功能形式。選擇要編輯的功能窗體??梢詾樗x功能形式修改的參數(shù)將顯示在下面的網(wǎng)格中。

9.可以為所選功能表單編輯的參數(shù)和單位顯示在“功能表單”字段下方的網(wǎng)格頂部。對(duì)于每個(gè)參數(shù),選中“值”列中的復(fù)選框,以在網(wǎng)格的下部顯示可為該參數(shù)輸入的選項(xiàng)列表。根據(jù)需要為要使用的選項(xiàng)輸入數(shù)值,并在必要時(shí)通過(guò)選中“值”列中的相應(yīng)復(fù)選框來(lái)指定單位。

10.對(duì)于您希望擬合的每個(gè)參數(shù),請(qǐng)選中“擬合”列中相應(yīng)的復(fù)選框。

注意:建議每次擬合放上少量的參數(shù)進(jìn)行處理。如果你想適應(yīng)許多參數(shù),你應(yīng)該使用幾次跑步來(lái)實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)。

11.編輯完所有相互作用參數(shù)后,單擊“保存”按鈕將所有更改保存到當(dāng)前項(xiàng)目中的新.lib文件中。

注意:在更改“力場(chǎng)”選項(xiàng)卡上的設(shè)置時(shí),對(duì)力場(chǎng)所做的所有更改都將在單擊“保存”按鈕之前保存。

12.在GULP Fit Forcefield對(duì)話框中選擇Observables選項(xiàng)卡。

13.如果您希望使用弛豫,請(qǐng)選中“弛豫”復(fù)選框。否則,將同時(shí)進(jìn)行擬合。

14.單擊“結(jié)構(gòu)”字段,然后從當(dāng)前項(xiàng)目的下拉樹視圖中選擇一個(gè)結(jié)構(gòu)。

15.從observable下拉列表中選擇要用于擬合的observable。在“值”字段中輸入此可觀測(cè)值的實(shí)驗(yàn)值,然后單擊“添加”按鈕將新的可觀測(cè)值插入對(duì)話框底部的列表中。

16.當(dāng)您將所需數(shù)量的可觀測(cè)值添加到列表中時(shí),通過(guò)選中相應(yīng)的復(fù)選框來(lái)選擇您希望用于擬合運(yùn)行的可觀測(cè)量。

注意:可觀測(cè)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的數(shù)量應(yīng)該等于或大于您選擇的擬合參數(shù)數(shù)量。

17.選擇GULP計(jì)算對(duì)話框上的作業(yè)控制選項(xiàng)卡,然后從網(wǎng)關(guān)位置下拉列表中選擇要在其上運(yùn)行GULP作業(yè)的服務(wù)器。如有必要,請(qǐng)指定作業(yè)將提交到的隊(duì)列。GULP將根據(jù)包含要擬合的力場(chǎng)的文本文檔的名稱自動(dòng)為作業(yè)指定一個(gè)名稱。如果要指定替代名稱,請(qǐng)取消選中“自動(dòng)”復(fù)選框,然后在“作業(yè)任務(wù)”文本框中輸入新名稱。

18.點(diǎn)擊更多...按鈕顯示GULP作業(yè)控制選項(xiàng)對(duì)話框。選擇要用于實(shí)時(shí)更新的文檔,并設(shè)置GULP在作業(yè)完成時(shí)的行為。

19.單擊Run(運(yùn)行)按鈕。

20.作業(yè)完成后,將從GULP輸出文件(.gout)生成一個(gè)新的力場(chǎng),并將力場(chǎng)文件(.lib)保存到項(xiàng)目資源管理器中的相應(yīng)結(jié)果文件夾中。

要在后續(xù)GULP計(jì)算中使用新的力場(chǎng),請(qǐng)選擇“瀏覽…”...從“GULP計(jì)算”對(duì)話框的“設(shè)置”選項(xiàng)卡上的“力場(chǎng)”下拉列表中,顯示“選擇GULP力場(chǎng)”對(duì)話框。從當(dāng)前項(xiàng)目的下拉樹視圖中選擇新的.lib文件。然后,所選文件將被導(dǎo)入到“力場(chǎng)”下拉列表中。


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