空間代謝組學(xué)可開(kāi)展生物組織中代謝物成像與原位分析，有利于掌握機(jī)體生理或病理相關(guān)的代謝物變化規(guī)律和時(shí)空分布特征，能深層次地理解其在生命活動(dòng)及病變過(guò)程中的作用和機(jī)制。空間代謝組學(xué)首先可得到物質(zhì)的分布信息，然后根據(jù)物質(zhì)分布信息對(duì)組織區(qū)域代謝特征進(jìn)行劃分，并尋找不同區(qū)域特征代謝物，以解釋生命活動(dòng)機(jī)理。接下來(lái)我們看下空間代謝組的核心結(jié)果展示。

01·HE&離子成像圖&SSCC

樣本HE染色圖，不同離子模式成對(duì)離子的成像圖，單樣本水平降維聚類cluster圖。

02·成對(duì)離子MSI合并圖

前體離子與其代謝產(chǎn)物的比例圖，圖中區(qū)域顏色越亮，前體離子的表達(dá)水平越高。

03·差異代謝物SSCC

所有樣本和單樣本水平，差異代謝物降維聚類可視化圖形。all-cluster，所有樣本的像素點(diǎn)按照聚類的cluster區(qū)分；all-sample，所有樣本的像素點(diǎn)按照樣本名區(qū)分；sample1，單樣本水平按照聚類的cluster區(qū)分。

04·差異代謝物大類熱圖

兩個(gè)比較組間，差異代謝物按照Fold Change 值繪制熱圖。橫軸色塊顯示差異代謝物的Super Class類別，縱軸色塊顯示像素點(diǎn)所屬區(qū)域信息及不同比較組。差異代謝物按表達(dá)值橫聚類繪制熱圖。橫軸色塊顯示差異代謝物的Super Class類別，縱軸色塊顯示像素點(diǎn)所屬區(qū)域信息及不同組別。

05·WGCNA

特征離子聚類樹(shù)及對(duì)應(yīng)模塊；特征離子模塊及性狀關(guān)聯(lián)分析。

06·circos差異代謝物相關(guān)性環(huán)圖

不同顏色顯示代謝物Super Class信息，點(diǎn)的大小顯示Fold Change值，線的顏色顯示相關(guān)性系數(shù)的大小。

07·KGML網(wǎng)絡(luò)圖

圓為不同的代謝物；三角為與代謝物有顯著相關(guān)性的蛋白；方塊為代謝物&蛋白富集到的通路信息；菱形表示與代謝物有相互關(guān)聯(lián)的外源性代謝物。紅藍(lán)兩色表示上下調(diào)的信息。點(diǎn)的大小為節(jié)點(diǎn)之間的連接度。

優(yōu)質(zhì)的空間代謝組

定性算法經(jīng)過(guò)多維校準(zhǔn)

定性結(jié)果同時(shí)考慮物質(zhì)表達(dá)空間情況、加和離子及同位素峰表達(dá)強(qiáng)度相似性、同位素表達(dá)空間分布相似性、非靶向質(zhì)譜數(shù)據(jù)和空代自建數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行校準(zhǔn)。

項(xiàng)目實(shí)測(cè)結(jié)果

可實(shí)現(xiàn)定性代謝物數(shù)量：1000-3000個(gè)代謝物

定性代謝物類型:70%為700Da以下的小分子物質(zhì)，30%為脂質(zhì)大分子

本期的高分辨率空間代謝組學(xué)分析篇—質(zhì)譜成像與空間成像分析到這里就結(jié)束啦，后續(xù)基于不同領(lǐng)域及方向的空間代謝組鹿明將有一系列，進(jìn)一步解讀更多空間代謝組學(xué)方法和結(jié)果，干貨多多，請(qǐng)不要錯(cuò)過(guò)！

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