在制藥企業(yè)生產(chǎn)過程中所產(chǎn)生的廢水，根據(jù)種類和規(guī)模的不同，采取的處理工藝也是有很大的差異。制藥的種類有化學合成藥、中成藥、生物制藥等，根據(jù)生產(chǎn)過程有原料藥、中間體等，廢水的水量從每天幾噸到幾千噸不等。制藥種類不同，廢水的水質(zhì)也不同。根據(jù)水質(zhì)的特點，來選擇處理的方法。廢水是根據(jù)生產(chǎn)來的，是連續(xù)的，而且是間歇性的。因此，要將廢水在流程中逐漸的處理掉。廢水的處理工藝大致上是包括預(yù)處理-厭氧-好氧-深度處理，預(yù)處理為厭氧、好氧做準備，這是有先后次序的。

預(yù)處理包括物理和化學方法，包括混凝沉淀、過濾、氣浮、吸附、離子交換、鐵碳-芬頓、萃取、吹脫、微電解等，其中最常用的工藝是混凝沉淀和氣浮法?；炷恋硎窍驈U水中投放混凝劑，使得廢水中的顆粒物相互凝聚，在重力的作用下沉淀到底部，實現(xiàn)固液分離。氣浮法是向廢水中充氣，使得廢水中充滿了微小的氣泡，氣泡和廢水中的油脂顆粒物相互結(jié)合，在浮力的作用下升到廢水的表面，通過刮渣系統(tǒng)實現(xiàn)固液分離。當廢水中存在較難生物氧化的有機污染物的時候，就要先使用化學方法或降低濃度的方法來提高可生物氧化性。

常用的化學氧化法是鐵碳-芬頓法，它是鐵碳和芬頓試劑法的聯(lián)合。芬頓試劑法是向廢水中添加對應(yīng)比例和濃度的Fe2+和H2O2，當Fe2+和H2O2發(fā)生反應(yīng)的時候，生成了具有強氧化性的羥基離子。羥基離子和難降解的大分子有機物發(fā)生反應(yīng)，生成可微生物氧化的小分子有機物。在廢水處理的過程中，使用聯(lián)合鐵碳的作用可提高廢水的氧化效率。預(yù)處理的過程，也是調(diào)節(jié)水質(zhì)和水量的過程。當水質(zhì)均勻了，可以準確檢測水質(zhì)成分，有的放矢，投放的量就會很精準，不容易造成二次污染。在后續(xù)生物氧化的過程中，水質(zhì)均勻還能提高效率，避免污泥的浪費，降低成本。

生物氧化法是厭氧和有氧的結(jié)合。厭氧處理包括升流式厭氧活性污泥法（UASB）、UBF厭氧反應(yīng)器、ABR厭氧折流板反應(yīng)器、水解酸化等，常用的厭氧方法是UASB和水解酸化。好氧處理包括普通活性污泥法、生物接觸氧化法、序批式間歇活性污泥法（SBR）、深井曝氣池、生物轉(zhuǎn)盤、CASS法、生物膜氧化法（MBR）等。在生物氧化的過程中，并非單純的厭氧和好氧，有的時候會采用兼氧的方法。為什么要先進行厭氧才進行好氧呢？厭氧是好氧的前提和準備條件，經(jīng)過厭氧微生物的作用，廢水的COD大幅下降，符合好氧的條件。好氧的處理是充分利用氧氣的作用，使得活性污泥的微生物和有機物充分氧化。