爾云間? 一個專門做科研的團隊

原創(chuàng)?小果?生信果

各位小伙伴們，大家好呀，我是你們的老朋友小果，最近收到許多粉絲朋友的留言，說是不知道怎么下載TCGA中的突變數(shù)據(jù)，為此小果今天特地為大家?guī)鞹CGA下載突變數(shù)據(jù)教學。接下里就跟隨小果一起去看看吧。

小果在這里以下載肝癌LIHC的突變數(shù)據(jù)為例，進行演示，下載步驟如下：

1.?進入官網(wǎng)GDC，在搜索框中輸入LIHC，選擇TCGA LIHC搜索

2.?查看搜索結(jié)果，在Data Category下點擊simple nucleotide variation后面的數(shù)字375，進入單核苷酸突變數(shù)據(jù)頁面

3. 在單核苷酸突變數(shù)據(jù)頁面點擊FILE，Data Type選擇masked Somatic Mutation ，Access下選擇open，點擊Add ALL File to Cart

4. 點擊完后，查看Cart中的數(shù)據(jù)情況，點擊Downloads選擇Cart進行數(shù)據(jù)下載，這樣數(shù)據(jù)就會下載到本地了

好了以上就是小果的分享，小伙伴們快去實踐下吧。

推薦閱讀

• GEO數(shù)據(jù)到底需不需要標準化，看這里
  

• miRNA靶基因的集大成者，miRWalk數(shù)據(jù)庫
  

• 不做實驗也能看到的顯微圖像，HPA數(shù)據(jù)庫
  

• 簡單使用ICGC數(shù)據(jù)庫進行數(shù)據(jù)查詢與下載
  

• 鐵死亡基因的專屬倉庫，F(xiàn)errDb數(shù)據(jù)庫

shengxinguoer

生信果

生信硬核知識解答

和小果一起學生信