DNAman 9.0安裝教程及使用教程
1.DNAman 9.0簡(jiǎn)介
DNAman是美國(guó)LynnonBiosoft公司開(kāi)發(fā)的高度集成化的分子生物學(xué)應(yīng)用軟件，幾乎可完成所有日常核酸和蛋白質(zhì)序列分析工作，包括多重序列比對(duì)、PCR引物設(shè)計(jì)、限制性酶切分析、蛋白質(zhì)分析、質(zhì)粒繪圖等。DNAMAN的速度，多功能性，準(zhǔn)確性和高質(zhì)量的表現(xiàn)使其成為每個(gè)分子生物學(xué)家可以依賴的基本工具之一。DNAMAN在許多同行評(píng)審的科學(xué)期刊中被高度引用的序列分析軟件。它也是一個(gè)序列分析軟件，對(duì)于每個(gè)大學(xué)，研究機(jī)構(gòu)，實(shí)驗(yàn)室和研究科學(xué)家來(lái)說(shuō)都是首選。
2.DNAman 9.0下載
DNAMAN9:
鏈接：https://pan.baidu.com/s/1vVcgxF-QtBzjI6csvG9Wdg
提取碼：9ky7
使用教程：獲取方式，將推文分享到朋友圈，截圖小編領(lǐng)取。
3.DNAman 9.0安裝步驟
第一步：下載安裝包，打開(kāi)后，雙擊DNAMAN 9.exe
第二步：選擇I accept the agreement，點(diǎn)擊next
第三步：選擇安裝路徑，點(diǎn)擊Next
第四步：點(diǎn)擊Install，安裝完成，點(diǎn)擊finish
第五步：安裝完成后將破解補(bǔ)丁DNAMAN復(fù)制到安裝目錄下替換源文件即可
第六步：打開(kāi)軟件
常用功能
還是先看一下DNAMAN的初始界面，從上到下分別是：
主菜單：文件，編輯，查找，酶切位點(diǎn)，引物等；工具欄：新建，打開(kāi)，打印，復(fù)制，粘貼等；瀏覽器欄：界面顯示，前進(jìn)，后退等。最左側(cè)的則是Channels工具條，用于存放DNA或蛋白序列，DNAMAN中提供20個(gè)Channels，也就是一次性能導(dǎo)入20條序列。
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序列比對(duì)?
（1）導(dǎo)入序列
先選中某個(gè)Channel，單擊菜單→【Sequence】→【Load Sequence】→【From Sequence File】選中相應(yīng)的序列文件即可導(dǎo)入序列。
也可以點(diǎn)擊工具欄中的新建序列文件，將序列復(fù)制到對(duì)話框中，選中序列，再選中相應(yīng)的Channel，單擊菜單→【Sequence】→【Load Sequence】→【From Selection】。
（2）多序列比對(duì)
單擊菜單→【Sequence】→【Alignment】→【Multiple Sequence Alignment】，在Sequence窗口中選擇DNA或者蛋白選項(xiàng)，點(diǎn)擊【Channels】進(jìn)入Selection窗口，選中需要比對(duì)文件所在的channel，點(diǎn)擊【OK】加載序列，然后在Sequence窗口中點(diǎn)擊【下一步】進(jìn)入比對(duì)方法窗口，這里選擇默認(rèn)的比對(duì)方法。
比對(duì)完成后的結(jié)果如下，不同的顏色表示不同的比對(duì)情況，如綠色表示其中兩條序列比對(duì)上，紅色表示3條序列比對(duì)上，黑色則表示4條序列都比對(duì)上。比對(duì)結(jié)果通常以圖片形式展示，方法是選中需要顯示的序列，Ctrl+C復(fù)制，在左上角出現(xiàn)的窗口中選擇Graph格式，然后粘貼到Word或者PPT等文件中即可。如果要用比對(duì)后的文件做后續(xù)的分析，則單擊菜單→【File】→【Save As】，保存成.msd文件，可以用于構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)等分析。
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酶切位點(diǎn)分析?
加載序列后，單擊菜單→【Restriction】→【Restriction Analysis】，選擇需要分析的酶切位點(diǎn)，點(diǎn)擊【完成】即可。分析結(jié)果會(huì)給出序列上酶切位點(diǎn)的具體位置，也會(huì)給出相應(yīng)的示意圖。
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引物設(shè)計(jì)?
加載序列后，單擊菜單→【Primer】→【Design PCR Primers for DNA】，引物設(shè)計(jì)的選項(xiàng)與在線的Primer3相似，主要選擇PCR產(chǎn)物長(zhǎng)度、正/反向引物的范圍和引物長(zhǎng)度等參數(shù)。給出的結(jié)果中包含引物位置、引物序列和Tm值等信息。
關(guān)于DNAMAN的常用功能就介紹到這里，另外DNAMAN還可以用于序列同源性分析，畫質(zhì)粒模式圖等等，在此不做進(jìn)一步的介紹。
