誅神之戰(zhàn)（3.0高難度殲滅討伐戰(zhàn)?上古眾神）

(就像之前的巴哈姆特和水晶塔一樣，主線任務(wù)后的高難度殲滅討伐戰(zhàn)、24人本、大型任務(wù)8人本這些編年史任務(wù)都只有大致的時間，基本都穿插在前一個大版本的主線和后一個大版本的主線中間，后面的瑪哈之影和亞歷山大也是如此）

隨著娜娜莫女王的蘇醒，光之戰(zhàn)士和拂曉血盟的嫌疑也被清洗，并且在塔塔露等人的努力下，越來越多的拂曉血盟成員被找了回來。因此石之家也恢復(fù)了往日的繁榮。然而在原先敏菲利亞的辦公室內(nèi)多了一個帶著白色面具的少年，自稱蛇心。少年并不想過多地談及自己的事情，只是告訴光之戰(zhàn)士瓦努族和骨頷族已經(jīng)召喚了更加強(qiáng)大的俾斯麥和羅波那，云神和武神甚至覬覦著三斗神的力量，而三斗神本身也快覺醒了。聽聞了這個消息，光之戰(zhàn)士馬上又以同樣的方法擊敗了云神和武神。

不久之后，蛇心又告訴光之戰(zhàn)士，三斗神之中的魔神薩菲洛特已經(jīng)蘇醒了。三斗神是亞拉戈帝國征伐美拉西迪亞時，當(dāng)?shù)氐脑N族為了抵抗侵略而召喚的蠻神。但三斗神最終還是不敵亞拉戈帝國，和巴哈姆特一樣，他們也被亞拉戈帝國拘束了起來。當(dāng)時托爾丹七世來到魔大陸就是為了吸收三斗神的力量，或許三斗神也因此而蘇醒。

于是蛇心和光之戰(zhàn)士還有雅·修特拉、于里昂熱和可露兒一起來到魔大陸的三斗神制御區(qū)對抗魔神。魔神薩菲洛特是美拉西迪亞的樹狀種族所信仰的主神，而魔大陸上則記錄魔神原是世界最初的圣樹，司掌生命之力。在戰(zhàn)斗中，魔神甚至把自己巨大化，不過還是無法戰(zhàn)勝光之戰(zhàn)士，最終光之戰(zhàn)士把魔神從數(shù)千年的囚禁中解脫了出來。

戰(zhàn)勝了魔神的一行人準(zhǔn)備離開魔大陸，但雷古拉的帝國第六軍團(tuán)從來沒有離開過這里。蠻神死后依然會被信徒重新召喚，因此致力于消滅蠻神的加雷馬帝國想要得到亞拉戈帝國拘束蠻神的技術(shù)。而另一邊，可露兒則在猜測著蛇心這個神秘少年的真實想法。

不久之后雷古拉率領(lǐng)第六軍團(tuán)再次入侵了魔科學(xué)研究所想要得到亞拉戈帝國的“變換式”來拘束蠻神。但拂曉血盟的眾人反對拘束這種方法，因為這只會像巴哈姆特那樣增加蠻神的怒火。最終拂曉血盟的一眾人趕在雷古拉得到變換式前將他擊退。

又過了一段時間，光之戰(zhàn)士一眾人在魔大陸受到了一群發(fā)著金光的人的襲擊，他們就是女神索菲亞的信徒。根據(jù)信徒的話語，光之戰(zhàn)士等人推測女神早已預(yù)料到了巴哈姆特的覺醒，因此在五千年前就是囑咐信徒將來解開她的封印。但即便如此女神最終還是不敵光之戰(zhàn)士。女神索菲亞是掌管平衡的神，而蛇心也是為了“平衡”而來到艾歐澤亞。

又過了不久，光之戰(zhàn)士等人開始調(diào)查三斗神中的最后一個，鬼神祖爾宛。這時雷古拉找到了光之戰(zhàn)士，鬼神的信徒已經(jīng)開始使鬼神蘇醒，而第六軍團(tuán)也開始戰(zhàn)斗了，為了打倒鬼神，也為了拯救自己的部下，雷古拉希望暫時和光之戰(zhàn)士等人合作。思考再三之后光之戰(zhàn)士還是答應(yīng)了雷古拉。在魔科學(xué)研究所內(nèi)，雷古拉和拂曉血盟的一眾人解救了尚未被精煉的帝國士兵，但雷古拉為了保護(hù)蛇心而被鬼神殺死。

最終光之戰(zhàn)士也沒有辜負(fù)雷古拉的犧牲，將鬼神消滅為了以太。

終于，三斗神都從亞拉戈帝國的束縛中解脫了，也幾乎沒有信徒再去召喚他們了，三斗神的危機(jī)徹底解除了。一行人回到了石之家，按照之前的約定，蛇心向眾人摘下了面具，說明了自己的來歷：蛇心也具有超越之力，他來自十三個平行世界中的第十三世界。在那里，還沒等到蛇心這個具有超越之力的人發(fā)揮作用，整個世界就已經(jīng)被泛濫的黑暗能量所吞噬變成了光之戰(zhàn)士等人熟知的虛無界。蛇心的主人艾里迪布斯讓他來的原初世界調(diào)停光與暗的平衡。

在拂曉血盟和光之戰(zhàn)士的幫助下，蛇心終于不再為自己的力量而苦惱，這一次他一定會拯救這個世界。蛇心摘下了他的面具，但還有很多人依然帶著面具……