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小海龜數(shù)字PCR應用于胃癌的潛在診斷生物標志物篩查

2023-09-25 09:31 作者:分子科普小feng子  | 我要投稿

數(shù)字PCR(dPCR)是一種核酸絕對定量的技術,與傳統(tǒng)的熒光定量PCR技術(qPCR)相比,dPCR擁有可以精確到單個核酸分子的高精準度、適合復雜樣本的高便捷度、且無需標準曲線或參照基因進行對比分析等特點。因此,高靈敏度、絕對定量、高穩(wěn)定性和更高的抗干擾能力成為數(shù)字PCR的4大優(yōu)勢。 作為最常見的腫瘤之一,胃癌(GC)具有高死亡率,因為當前的檢查方法不能實現(xiàn)早期診斷。核粒梭菌(Fn)主要定居在口腔中,據報道與胃腸道腫瘤的發(fā)展有關。迄今為止,關于唾液Fn和胃癌之間的關系知之甚少。該篇來自山東大學齊魯醫(yī)院文章確定唾液Fn能否作為診斷胃癌的生物標志物,并探討Fn對胃癌細胞的影響。

實驗方法:通過液滴數(shù)字聚合酶鏈反應對2019年1月至2020年12月山東大學齊魯醫(yī)院的120例GC患者、31例萎縮性胃炎(AG)患者、35例非AG (NAG)患者、26例胃息肉(GP)患者和20例正常對照(NC)的唾液中Fn的豐度進行定量。進行受試者工作特征(ROC)曲線分析,以評估Fn以及傳統(tǒng)血清腫瘤標志物(包括癌胚抗原(CEA)、糖類抗原(CA) 19-9和CA72-4)的診斷價值。Transwell實驗和傷口愈合實驗評估Fn感染對GC細胞的影響。western blot法檢測上皮間質轉化(EMT)標記物的表達。 實驗流程: ☆ 研究人員的樣本收集,120例GC患者、31例萎縮性胃炎(AG)患者、35例非AG (NAG)患者、26例胃息肉(GP)患者和20例正常對照(NC)的唾液樣本的收集,離心后儲存在-80℃。 ☆ 凱杰QIAamp Blood Mini Kit試劑盒提取200ul唾液樣本中的基因組DNA,濃度用Qubit 3熒光計測定。 ☆ 上海小海龜數(shù)字PCR儀進行Fn的測定,設計Fn的探針進行檢測。 ☆ 細胞的培養(yǎng),F(xiàn)n的菌株培養(yǎng) ☆ C細胞和Fn的菌株共培養(yǎng),進行感染 ☆ 染后的GC細胞進行Transwell分析 ☆ 愈合實驗,感染后的GC細胞進行Transwell分析,感染后用200 μL的移液管尖端進行直線刮擦,模擬傷口,隨后,除去培養(yǎng)基和漂浮細胞,用無血清培養(yǎng)基代替,并捕獲圖像。細胞培養(yǎng)48小時后,再次拍攝圖像。 ☆ Western blot分析,將感染Fn和未感染Fn的GC細胞裂解進行Western blot分析 實驗結果:核粒梭菌(Fn)是一種牙周致病菌,常見于胃腸道腫瘤組織中。在此,研究發(fā)現(xiàn)胃癌患者唾液Fn水平升高,可作為胃癌診斷的潛在生物標志物,其診斷能力優(yōu)于傳統(tǒng)的血清腫瘤標志物。研究還發(fā)現(xiàn)唾液Fn水平與胃癌TNM分期和淋巴結轉移呈正相關。此外,實驗在試管內揭示了Fn通過促進上皮-間質轉化過程來促進GC細胞的遷移和侵襲。該發(fā)現(xiàn)表明唾液Fn是診斷胃癌的潛在生物標志物。該研究表明唾液中Fn含量可作為診斷胃癌的生物標志物,F(xiàn)n感染可通過加速上皮間質轉化過程促進胃癌轉移。

該篇研究用的是小海龜數(shù)字PCR儀設備進行Fn數(shù)字PCR檢測。上海小海龜科技有限公司立足于基因檢測上游儀器、芯片耗材與試劑開發(fā)的高新技術企業(yè),其以微流控芯片技術為核心,已成功推出BioDigital 青數(shù)字PCR分體機、以及BioDigital ? 炎和SCI Digital系列數(shù)字PCR全自動一體機,實現(xiàn)了基因檢測與分子診斷前沿技術領域的重大原始材料科技創(chuàng)新和產業(yè)化突破。

BioDigital 青--真正的液滴制備全自動PCR

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性能特點:

☆ 操作簡單:全封閉自動化液滴制備,上樣、制備無人工操作,設有4℃樣本保存功能 ☆ 成本低廉:個位數(shù)芯片成本,支持單樣本開機 ☆ 開放:可兼容第三方qPCR Mix ☆ 高通量:1~96樣,4路熒光 ☆ 數(shù)量:>2萬,有效液滴比例:95%以上 ☆ 有一類醫(yī)療器械證,適用于醫(yī)院系統(tǒng) 更多精彩,請查看公眾號“優(yōu)寧維分子生物學”進行查詢

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