繼空間轉(zhuǎn)錄組測序被?Nature Methods?選定為2020年度創(chuàng)新技術(shù)后，空間多組學(xué)技術(shù)又被?Nature?評為2022年最值得期待的七個技術(shù)之一。空間多組學(xué)目前主要包括空間轉(zhuǎn)錄組、空間蛋白質(zhì)組、空間代謝組和空間表觀組等，可以對生物組織進行全方位、全組學(xué)維度的精準描繪。

博奧晶典的空間組學(xué)平臺包含了空間轉(zhuǎn)錄組和空間代謝組兩種。博奧晶典 SpaceM 空間代謝組是業(yè)內(nèi)唯一亞微米級高分辨率高精度的空間代謝組技術(shù)。該技術(shù)可以通過對組織切片進行二次離子質(zhì)譜掃描，獲得每個像素點的代謝組數(shù)據(jù)，實現(xiàn)組織切片中單細胞分辨率的空間代謝組圖譜繪制，定位感興趣的代謝物在組織中的空間分布，尋找代謝物在空間位置上的含量差異。該技術(shù)實現(xiàn)了代謝組學(xué)信息與空間信息的結(jié)合，為傳統(tǒng)代謝組學(xué)分析提供全新的可視化視角和多維的信息深度。

博奧晶典已經(jīng)利用該技術(shù)平臺對多種組織樣本進行了檢測，均獲得了理想的結(jié)果。下面以小鼠腎臟組織為例，詳細解析一下空間代謝組的檢測結(jié)果。

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小鼠腎臟

將新鮮的小鼠腎臟組織進行 OCT 冷凍包埋，連續(xù)切片，選取最優(yōu)切片進行質(zhì)譜掃描，并對數(shù)據(jù)進行質(zhì)控過濾。

質(zhì)譜掃描的數(shù)據(jù)通過軟件分析之后，可以對組織切片進行細胞核定位、細胞分群、細胞亞群定位以及差異代謝物分析。

? ? ? ? ? ? ? ??除了小鼠腎臟之外，我們還對小鼠肝臟、小鼠腦和人前列腺癌的樣本進行了檢測，獲得了組織對應(yīng)區(qū)域的細胞分群和代謝組差異結(jié)果。

02

小鼠肝

03

小鼠腦

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人前列腺癌

從實驗結(jié)果可以看出，SpaceM 空間代謝組，能夠利用代謝組數(shù)據(jù)對組織中的細胞進行分群，發(fā)現(xiàn)代謝物在細胞亞群核組織區(qū)域中的含量及分布。因此空間代謝組與單細胞轉(zhuǎn)錄組和空間轉(zhuǎn)錄組可以進行聯(lián)合分析，對通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)獲得的特異性代謝通路是否真實發(fā)生了變化進行驗證。

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