在過去的幾年中，質譜（MS）在技術和應用方面經(jīng)歷了驚人的發(fā)展。MS是一種技術，它產(chǎn)生氣相分析物離子，根據(jù)其質荷比（m/z）分離并檢測這些離子。

質譜儀由三個主要部分組成，包括離子源、質量分析器和檢測器系統(tǒng)。在質譜實驗中，分析的過程按順序分為五個階段，包括進樣、分析物電離、質量分析、離子檢測和數(shù)據(jù)處理。

離子源的常見類型有：

電子電離（EI）、->A:/chemical-ionization.html

質量分析器的常見類型有：

飛行時間、四級桿、線性四極離子阱、三維四極桿離子阱、傅立葉變換離子回旋共振（FT-ICR）、Orbitrap。

檢測器的常見類型有：

電子倍增器、微通道板檢測器、Daly檢測器、焦平面檢測器。

串聯(lián)質譜（MS/MS）依次組合了不同的質量分析器，以提高功能性并允許多重實驗。串聯(lián)質譜儀可以進行多輪質譜分析，通常被某種形式的分子碎裂分開，串聯(lián)MS分子碎裂的常見方法包括：

1. 碰撞誘導解離（CID）

2. 高能碰撞解離（HCD）

3. 電子捕獲解離（ECD）

4. 電子轉移解離（ETD）

進樣

雖然進樣系統(tǒng)實際上并不是MS的一部分，但在保持高真空要求的同時使樣品進入離子源是很重要的。進樣可能涉及單個樣品或接于色譜分離后。大多數(shù)現(xiàn)代質譜儀都與高效液相色譜（HPLC）組合在一起，它結合了液相色譜儀的物理分離能力和質譜儀的質量分析能力。此外，對于某些研究（如蛋白質組學），色譜分離可以提前進行分析。

分析物電離

在質譜分析中，電離是指產(chǎn)生氣相離子以進行后續(xù)質量分析。電離技術一直是確定可以通過質譜分析哪些類型樣品的關鍵。MS中有各種類型的電離方法，如根據(jù)分析物分子的物理狀態(tài)進行分類。如電子電離（EI）和化學電離（CI）是氣相電離技術，通常用于氣相色譜-質譜（GC-MS）中；電噴霧電離（ESI）和基質輔助激光解吸電離（MALDI）作為液相電離技術，被廣泛用于液相色譜-質譜（LC-MS）中。

質量分析

質量分析是質譜的核心部分，氣相離子產(chǎn)生后，被傳輸?shù)劫|量分析器中并根據(jù)m/z被分析。質量分析器有使用靜態(tài)或動態(tài)場的各種類型，每種分析器都有各自的優(yōu)缺點，有一些重要的特征被用來測量質量分析器的性能。質量范圍決定了質量分析器測量離子的m/z極限；掃描速度是指分析器在特定質量范圍內測量的速率；質量精度是指m/z的測量誤差與真實m/z之間的差；質量分辨率則是指區(qū)分m/z稍有不同的兩個峰的能力。

離子檢測

離子通過質量分析器后，被檢測器檢測并轉化為可用信號。檢測器能夠從入射離子產(chǎn)生與其豐度成正比的電流。由于在特定瞬間離開質量分析器的離子數(shù)量一般很小，因此通常需要放大來獲得可用信號。一些檢測器被用于一次計數(shù)單個質量的離子，因此它們會在一個點上依次檢測所有離子的到達。其他類型的檢測器（如照相板或圖像電流檢測器）可對多個質量進行計數(shù)，并沿一個平面同時檢測所有離子的到達。

數(shù)據(jù)處理

質譜獲得的數(shù)據(jù)可用于定量分析、分子測定、結構解析或序列測定。質譜可以產(chǎn)生各種類型的數(shù)據(jù)。質譜是相對豐度與m/z的關系圖，是最常見的數(shù)據(jù)表示形式。質譜的解釋需要多種技術（如數(shù)據(jù)庫）的結合。在這里，我們收集了一些可免費訪問的數(shù)據(jù)庫，這些數(shù)據(jù)庫可能有助于蛋白質組學和代謝組學中的數(shù)據(jù)處理。

蛋白質組學和代謝組學常用數(shù)據(jù)庫