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如何從雜交瘤細(xì)胞中測(cè)序獲得抗體基因?

2023-11-29 14:02 作者:南京德泰生物  | 我要投稿

近年來,各種抗體庫(kù)技術(shù)的發(fā)展使得制備針對(duì)特定靶標(biāo)的重組工程抗體的技術(shù)已經(jīng)千差萬別。但如何從多種類型的抗體生產(chǎn)細(xì)胞,如小鼠的雜交瘤細(xì)胞、人的B細(xì)胞等抗體生產(chǎn)細(xì)胞中克隆正確的目標(biāo)抗體V區(qū)基因或是抗體結(jié)合位點(diǎn)的基因片段,仍然是研究者開展基因工程抗體研究所面臨的第一個(gè)問題。經(jīng)過多年的發(fā)展完善之后,研究者們已經(jīng)建立了一套很有效的基于PCR的技術(shù)路線和方法,來從各類抗體生產(chǎn)細(xì)胞中克隆單一或者混合的抗體V區(qū)基因。 在Morrison等人發(fā)明最早的基因工程抗體——人-鼠嵌合抗體時(shí),他們僅采用了來自基因組序列的小鼠V區(qū)基因片段進(jìn)行重組,構(gòu)建嵌合抗體基因。隨著PCR技術(shù)的出現(xiàn)和普及、應(yīng)用,研究者發(fā)現(xiàn)使用小鼠V區(qū)基因cDNA基因片段進(jìn)行重組構(gòu)建更為便捷有效。對(duì)于從生產(chǎn)單一抗體的細(xì)胞如小鼠雜交瘤細(xì)胞中克隆V區(qū)基因cDNA基因片段,目前研究者普遍采用的方法是RT-PCR法,先反轉(zhuǎn)錄制備細(xì)胞的cDNA,或相應(yīng)抗體基因的DNA,然后利用經(jīng)過精心設(shè)計(jì)的套裝引物,采用PCR的方法從中特異擴(kuò)增目標(biāo)抗體的輕重鏈V區(qū)基因片段,分離這些PCR擴(kuò)增片段,常規(guī)克隆入相應(yīng)載體之后,采用測(cè)序、測(cè)定結(jié)合活性等手段鑒定所克隆獲得的抗體輕重鏈V區(qū)基因。上述過程通常所有的操作均可以按照標(biāo)準(zhǔn)的分子克隆程序進(jìn)行。 在采用RT-PCR法克隆抗體輕重鏈V區(qū)基因的過程中最關(guān)鍵的是設(shè)計(jì)用于PCR特異擴(kuò)增抗體V區(qū)基因的套裝引物。雖然對(duì)于每一種單克隆抗體來說其V區(qū)基因兩端的序列都有可能是不同的,但經(jīng)過多年的研究積累,目前人們對(duì)于各種抗體V區(qū)基因兩端序列的變化規(guī)律已經(jīng)有了深入的認(rèn)識(shí),同種類型的單克隆抗體V區(qū)基因的兩側(cè)序列具有很高的同源性。通過使用多個(gè)同源性高的兩端序列,并結(jié)合簡(jiǎn)并堿基的引物設(shè)計(jì)方案,研究者已經(jīng)設(shè)計(jì)出大量的V區(qū)基因PCR擴(kuò)增套裝引物,它們多數(shù)在實(shí)際應(yīng)用中都能有效地?cái)U(kuò)增,獲得目標(biāo)抗體的V區(qū)基因cDNA片段。當(dāng)遇到某套裝引物不能奏效時(shí),仍然可以嘗試其他套裝引物直至獲得合適的擴(kuò)增片段。 在采用RT-PCR法克隆抗體輕重鏈V區(qū)基因時(shí)仍然有一些問題是需要我們高度重視并小心處理的。首要需要注意的是,雜交瘤等抗體生產(chǎn)細(xì)胞往往是不穩(wěn)定的,抗體基因的突變和丟失將可能隨著體外培養(yǎng)時(shí)間的延長(zhǎng)而變得越來越嚴(yán)重,導(dǎo)致克隆獲得錯(cuò)誤的抗體V區(qū)基因,甚至根本無法擴(kuò)增克隆出V區(qū)基因。因此,獲得穩(wěn)定分泌抗體的雜交瘤克隆,或在克隆V區(qū)基因之前進(jìn)行適當(dāng)?shù)膩喛寺〔僮?,保證所提取的細(xì)胞DNA均含有正有標(biāo)抗體V區(qū)基因,確保最終能克隆獲得正確的抗體V區(qū)基因。另外,擴(kuò)增用的簡(jiǎn)并套裝引物雖然為PCR擴(kuò)增的成功提供了保障,這種引物設(shè)計(jì)的方式以及包括PCR擴(kuò)增過程本身,都有可能為抗體V區(qū)基因的克隆帶來突變的風(fēng)險(xiǎn),導(dǎo)致克隆的抗體V區(qū)與抗原結(jié)合的特性發(fā)生顯著的改變。對(duì)多個(gè)所獲得的抗體V區(qū)基因克隆測(cè)序可以排除PCR擴(kuò)增過程本身所帶來的突變。這些突變可能多數(shù)不起作用,但有時(shí)也能顯著影響抗體結(jié)位點(diǎn)與抗原結(jié)合的特性。為了確保測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性,可對(duì)所獲抗體V區(qū)是否能正確地與抗原結(jié)合進(jìn)行適當(dāng)?shù)蔫b定。 即便是分泌單一單克隆抗體的雜交瘤細(xì)胞中也同時(shí)具有多個(gè)完整的抗體基因,有時(shí)我們還會(huì)碰到同時(shí)克隆出多個(gè)具有正確的抗體V區(qū)基因特征的基因片段,這時(shí)分別鑒定其表達(dá)的抗體的結(jié)合功能是我們確定正確的目標(biāo)抗體V區(qū)基因的唯一辦法。 德泰生物自建雜交瘤測(cè)序平臺(tái),基于RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技術(shù)和Failsafe?假基因排除技術(shù),能夠提供快速、可靠的雜交瘤抗體基因測(cè)序服務(wù)http://www.detaibio.com/hybridoma-antibody-sequencing-service.html。可對(duì)抗體的可變區(qū)或全長(zhǎng)進(jìn)行準(zhǔn)確測(cè)序,測(cè)序范圍涵蓋小鼠、大鼠、兔、山羊等物種。同時(shí),德泰生物還擁有成熟的抗體表達(dá)平臺(tái),可以將獲得的抗體基因進(jìn)行表達(dá)、純化、驗(yàn)證,測(cè)序表達(dá)快至1周。

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