? ? ps：過渡態(tài)的搜索一直是理論模擬計算人員頭疼的問題。在今年的計算遇到大量問題后，簡單回顧過去一年的計算經(jīng)歷，雖然知識和能力提升了很多，也有了自己的paper，但是沒有把經(jīng)驗、心得等記錄下來。這導(dǎo)致了我在之后的計算遇到了問題后，有時意識到這個問題以前有過一個感悟，但就是想不起來，最后繞了一大圈弄完了之后終于想起來了。另外這一年有很多我想記錄的事現(xiàn)在也很多記不起來了。所以今天開始會不定時更新一些。

(一)

1：先檢查初末態(tài)結(jié)構(gòu)是否為勢能面連續(xù)的兩個極小值點，如果不是，新增加結(jié)構(gòu)優(yōu)化計算，找到中間的谷點（可以利用CINEB中間的那種比初末態(tài)能量都低的點）。當(dāng)已經(jīng)完成了粗收斂計算或者說精收斂計算失敗后，如果回過來發(fā)現(xiàn)初末態(tài)不連續(xù)時，不要來不來就重來，先看下粗收斂、精收斂過程中有沒有可以用improved dimer method（IDM）接著跑的點（離過渡態(tài)比較近），如果有，選出那個點用IDM進行過渡態(tài)搜索可補救，因為IDM是單點計算，很多時候可以避開不連續(xù)的影響。

2：CINEB計算某基元反應(yīng)出問題時，先去查看下當(dāng)初插點時的那幾個文件（插點方法是不是idpp，距離與插點數(shù)之間是否合理）,有些時候插點數(shù)不夠會導(dǎo)致過渡態(tài)難以搜索到。

3：檢查出問題的這個基元反應(yīng)的各個精度下的結(jié)構(gòu)（一般粗收斂都能收斂，出問題在精收斂）：

（1）如果最開始插點后的結(jié)構(gòu)合理，但粗收斂后的結(jié)構(gòu)不合理

? ? 在插點數(shù)合理的情況下，直接用CINEB跑可能就比較難。當(dāng)然，不排除后面用CINEB能重新跑到合理位置。但是這時可以考慮IDM這個方法?？梢韵扰芤粌蓚€電子自洽，保留WAVECAR與CHGCAR,然后再用IDM接著跑。建議初次使用時由于不清楚IDM是不是體系，因此第一個IDM用較為粗的精度，然后在這基礎(chǔ)上逐漸升高，直至找到在滿足領(lǐng)域內(nèi)適合的精度。

（2）如果最開始插點后的結(jié)構(gòu)合理，但粗收斂后的結(jié)構(gòu)合理，但精優(yōu)化過程中出現(xiàn)了結(jié)構(gòu)不合理或者偏離。

? ? 這種說明可以利用CINEB快速粗收斂，但是想精收斂比較困難，原因可能有許多（反應(yīng)不連續(xù)、初末態(tài)不合理等等）（以后有時間出一期過渡態(tài)優(yōu)化收斂失敗專欄），這時可以將CINEB粗收斂后的結(jié)構(gòu)接著用IDM方法進行優(yōu)化

4：注意！

? ? ?IDM方法不適用于羥基的脫除，我猜測可能是IDM方法不適用于這種兩個原子同時“脫除”的基元反應(yīng)