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當(dāng)我們生成單細(xì)胞的數(shù)據(jù)矩陣并了解了細(xì)胞中基因表達(dá)的基本情況后，我們要如何整體觀察細(xì)胞間基因表達(dá)量的相關(guān)性呢？大家一起來和小果看一下吧！

01、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

首先，我們先來一起看一下生成的數(shù)據(jù)矩陣：

02、數(shù)據(jù)過濾

在查看基因在細(xì)胞中表達(dá)的相關(guān)性之前，我們先對(duì)數(shù)據(jù)做一個(gè)簡(jiǎn)單的篩選，在這里我們篩選出所有表達(dá)細(xì)胞數(shù)大于0的基因，和小果一起來看一下具體操作吧！

03、繪制熱圖

沒錯(cuò)，現(xiàn)在我們來到了今天的重頭戲，那就是通過熱圖來觀察基因在細(xì)胞中表達(dá)的相關(guān)性和差異性，那么什么是熱圖呢？在繪制之前小果先給大家做一個(gè)簡(jiǎn)單的介紹：

o 熱圖的概念：

熱圖(Heatmap)是通過將數(shù)據(jù)矩陣中的各個(gè)表達(dá)值按照一定的規(guī)律映射為不同的顏色，最終呈現(xiàn)給我們一個(gè)像“調(diào)色盤”一樣的圖表來展示數(shù)據(jù)的變化規(guī)律，可以直接美觀地向我們表達(dá)基因的全局表達(dá)狀況哦。

o?繪制熱圖

要繪制本次實(shí)驗(yàn)中對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)矩陣的熱圖，只需要通過R語言中的 pheatmap()函數(shù)繪制方法即可，讓我們一起來看一下具體的代碼操作吧！

讓我們一起來看看最終呈現(xiàn)出的熱圖是什么樣吧！

o 怎么分析熱圖？

當(dāng)我們成功繪制出細(xì)胞表達(dá)的熱圖后，如何快速地從中獲取有效的信息呢？不要急，小果告訴你！

1.樣本名稱區(qū)：分為右側(cè)和下方兩部分，分別細(xì)胞名稱和基因名稱；

2.色塊展示區(qū)：根據(jù)樣本名稱生成的顏色矩陣，每一個(gè)小矩形的色塊 都代表一個(gè)表達(dá)數(shù)值；

3.色板對(duì)照區(qū)：色板中的每一個(gè)顏色都對(duì)應(yīng)到每一個(gè)矩形中的顏色數(shù)值，在本圖的色板對(duì)照區(qū)中，值越大越紅，越小越藍(lán)。

現(xiàn)在你學(xué)會(huì)熱圖的繪制以及分析方法了嗎？同學(xué)們也可以自行下載一些數(shù)據(jù)，繪制屬于你的專屬“調(diào)色板”！大家也可以移步云生信畫圖專版進(jìn)行更深入的學(xué)習(xí)哦！

小果云生信平臺(tái)表達(dá)量熱圖繪制小工具www.biocloudservice.com/365/365.php

趕緊跟著小果一起學(xué)起來吧！

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