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正準(zhǔn)備做miRNA定量?這個(gè)羊毛一定要薅!

2022-07-15 14:57 作者:分子科普小feng子  | 我要投稿

今天要推薦的是來(lái)自QIAGEN的一個(gè)miRNA熒光定量的驚喜“小禮包”:miRCURY LNA miRNA PCR Starter Kit(貨號(hào):339320)

試劑盒包含逆轉(zhuǎn)錄試劑、SYBR Green qPCR Mix,還有UniSp6模板及引物,一個(gè)候選內(nèi)源對(duì)照引物組引物(miR-103a-3p)和兩個(gè)經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的引物組(可任選2條預(yù)制引物哦,物種包含人、大鼠、小鼠),所有試劑均通過(guò)LNA技術(shù)進(jìn)行了增強(qiáng)。這些試劑足夠定量分析多達(dá)20個(gè)樣品。

關(guān)于性能,也是非常厲害的!有圖有真相,可以從低至 1 pg 的總 RNA 起始材料進(jìn)行準(zhǔn)確定量!再也不用擔(dān)心樣本量太少?zèng)]辦法定量啦!

圖注:顯示了來(lái)自人 AM6000 總 RNA 的連續(xù)稀釋的數(shù)據(jù)。 所有 miRNA 測(cè)定均顯示線性讀數(shù),相關(guān)系數(shù) R2 > 0.99。

Tips:我們建議在研究miRNA表達(dá)時(shí),選擇的內(nèi)參是內(nèi)源性內(nèi)參基因應(yīng)是穩(wěn)定表達(dá)的miRNAs,而不是較長(zhǎng)的RNA物種,如snoRNAs和包括U6在內(nèi)的snRNAs。這是因?yàn)閙iRNAs較短,在提取和逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程中可能與較長(zhǎng)的轉(zhuǎn)錄本有非常不同的行為。根據(jù)樣本的來(lái)源,一些常用的參考miRNAs包括:hsa-miR-103a-3p、hsa-miR-423-3p、hsa-miR-191-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-423-5p和hsa-let-7a-5p。

而人工合成的RNA spike-in 在檢查miRNA分離、cDNA 合成和 PCR 擴(kuò)增效率差差異的過(guò)程中,可以起到全程監(jiān)控的作用,可能揭示核酸酶的潛在存在。方法是分別在 RNA 分離和 cDNA 合成之前向樣品中添加已知量的 RNA 摻入物,如試劑盒提提到的Unisp6,或RNA Spike-In Kit, For RT。

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