江戶時代（1603-1868）

日本和古巴之間有記錄的交流可以追溯到 1614 年，當時豐臣秀吉的失去親人的兒子秀賴仍在大阪城掌權(quán)。 1613年秋，以傳教士路易斯·索泰羅為首席，支倉常長為副使的慶長歐洲使團從仙臺藩月之浦（今石卷市）啟程。翌日，7月23日， 1614 年，他在哈瓦那停留，當時是西班牙新西班牙總督轄區(qū)的省級城市，并一直待到 8 月初。2001年，與支倉常長有淵源的仙臺生榮學園為了紀念這一歷史事實，將長谷常長雕像捐贈給了哈瓦那，作為其100周年紀念項目的一部分。這尊銅像是由雕刻家土屋瑞穗使用仙臺城石墻的石頭制作的，并于同年4月26日舉行了揭幕儀式。?

1620 年 8 月，由支倉率領(lǐng)的慶長歐洲使團返回日本，沒有擔任常任特使的傳教士索泰羅。長支倉等人在國外旅行約七年之際，常駐大阪的秀賴與母親淀殿人一起自殺，豐臣家被滅亡。作為只與荷蘭建交的基本方針不干涉內(nèi)政的基督教新教勢力正在建立國家隔離體系，索特羅受舊基督教勢力大國西班牙的影響在馬尼拉不得不回國。 1622年9月，作為慶長使團歐洲公使的索泰羅企圖偷渡到日本，被幕府發(fā)現(xiàn)并逮捕。兩年后，即 1624 年，他在長崎縣大村被火刑焚燒，那里曾是基督教大名大村住忠的統(tǒng)治者。此外，在這一年，日本與西班牙斷絕了外交關(guān)系，并與包括古巴在內(nèi)的西班牙總督轄區(qū)新西班牙斷絕了外交關(guān)系。此后，直到江戶幕府垮臺，外交關(guān)系才得以恢復。

從明治維新到二戰(zhàn)結(jié)束（1868-1945）

日本農(nóng)業(yè)移民于 1898 年首次在古巴定居，比建立正式外交關(guān)系還早了大約 30 年。 1998年，舉辦了各種文化活動，紀念日本移民古巴100周年。

日本與古巴于 1929 年 12 月 21 日正式建立外交關(guān)系。 然而，1941年12月8日，帝國海軍襲擊夏威夷珍珠港，引發(fā)太平洋戰(zhàn)爭，兩國友好關(guān)系破裂。 次日，9日，古巴盡早升起國旗，向日本宣戰(zhàn)。?此后，日本與古巴沒有恢復外交關(guān)系，日本在接受《波茨坦宣言》后于 1945 年 8 月投降。

從復交到冷戰(zhàn)結(jié)束（1952-1989）

隨著 1952 年 4 月 28 日舊金山和約生效，日本恢復為國際社會成員。古巴是簽署舊金山和約的49個國家之一，同年8月12日在古巴獲得批準，兩國于11月21日正式恢復外交關(guān)系。

1959年1月1日，以菲德爾·卡斯特羅為首的革命力量推翻了受美國和西方資本強烈影響的巴蒂斯塔政府，在古巴建立了革命政府（古巴革命）。在此之前，一直被親美反共的巴蒂斯塔政府鎮(zhèn)壓的人民社會黨（后來的古巴共產(chǎn)黨），將把古巴作為該國唯一的政黨來統(tǒng)治。與菲德爾一起參加革命的切格瓦拉對古巴革命的成就不滿意，后來前往玻利維亞進一步投身革命，未經(jīng)許可被行政命令槍殺。在革命中犧牲的切·格瓦拉不僅在當時，甚至在 21 世紀作為 T 恤衫在日本和世界各地繼續(xù)受到人們的喜愛。

到古巴革命時，資本主義和共產(chǎn)主義陣營爭奪權(quán)力的冷戰(zhàn)結(jié)構(gòu)已經(jīng)形成，但我沒有。美國不滿足于僅僅不承認革命政府，于1961年與古巴斷絕外交關(guān)系（斷交將持續(xù)到2015年奧巴馬政府的第二個任期），并動用武力和暗殺行動. 試圖通過充分利用政治手段推翻菲德爾卡斯特羅政權(quán)然而，美國推翻古巴政權(quán)的計劃沒有一個成功，古巴革命政權(quán)通過加強與蘇聯(lián)的關(guān)系尋求生存。大約在1962年夏天，當核導彈及其運載工具被帶到接受蘇聯(lián)軍事援助的古巴時，美蘇之間的東西方對抗達到了頂峰。古巴距離佛羅里達州只有150公里左右，肯尼迪政府下的美國斷然拒絕允許在古巴建設(shè)核導彈基地。同年11月，蘇聯(lián)總書記赫魯曉夫同意撤出古巴導彈，人類成功避免了一場核戰(zhàn)爭（古巴導彈危機）。這樣一來，盡管美國和古巴發(fā)生了嚴重的對抗，日本卻選擇在不與古巴斷絕外交關(guān)系的情況下保持友好關(guān)系。

1984年11月20日，時任日本共產(chǎn)黨主席的不破哲三在古巴首都哈瓦那會見了菲德爾·卡斯特羅[20]。當時，國際形勢再次因冷戰(zhàn)而激化，美日等資本主義國家批評共產(chǎn)主義陣營領(lǐng)袖蘇聯(lián)對阿富汗的軍事干預是侵略。猶豫是否向尼加拉瓜新成立的反共叛軍提供軍事援助（反對戰(zhàn)爭）。菲德爾接二連三地就日本政治和工業(yè)提出問題，他表達了對意識形態(tài)的強烈警惕。菲德爾與不破的會面持續(xù)了3小時15分鐘。

冷戰(zhàn)結(jié)束后（1989-）

統(tǒng)治古巴的菲德爾·卡斯特羅于 2016 年 11 月 25 日去世。同日，岸田文雄外長首先向布魯諾·羅德里格斯外長發(fā)出慰問電，同月28日，岸田外相和外務(wù)大臣岸信夫來自執(zhí)政黨的外務(wù)大臣園浦健太郎和國會副外務(wù)大臣武井俊介訪問古巴駐東京大使館并表示哀悼、。反對黨黨主席石井一雄到古巴大使館吊唁。日本共產(chǎn)黨的不和也造訪了使館，并在便條上簽名說：“我還記得32年前我們討論各民族自決權(quán)的那次會議。日本共產(chǎn)黨不和哲三”。同樣在 11 月 28 日，日古議會友好聯(lián)盟主席古谷敬二作為首相特使前往古巴并出席了在那里舉行的葬禮。

文化交流

1968 年 1 月，“亞洲、非洲和拉丁美洲問題國際知識分子會議”（西班牙語：Reunión de intelectuales de todo el mundo sobre problemas de Asia, áfrica y América Latina）在哈瓦那召開。Seicho松本和久保田誠（文學），山本佐夫和羽尼進（電影），三菜直介（音樂），本田涼介和山本進（記者）參加，久保田報道了日本的文化狀況[26]。

電影

古巴革命十年后的 1969 年，仍處于越南戰(zhàn)爭之中，導演黑木一夫執(zhí)導了首部日古合作電影《古巴戀人》（西班牙語：La novia de Cuba[27]）。 ) 已發(fā)表 [28]。舞臺是 1968 年的古巴，20 多歲的津川雅彥扮演一個訪問哈瓦那的日本年輕人，朱莉·普拉圣西亞 [29] 扮演一個在煙草廠工作的當?shù)貗D女，也是一名民兵。[ 30] 她是女主角。這部電影作為獨立放映發(fā)行，但被認為是一部阻礙當時日本蓬勃發(fā)展的學生運動的電影，票房表現(xiàn)不佳，黑木導演最終獲得巨額收入債務(wù)。[28]

棒球

棒球在北美、遠東亞洲和加勒比地區(qū)之外是一項相對不受歡迎的運動，[31] 但它在日本和古巴都很受歡迎。因此，兩國棒球交流深入。

1980年在日本舉行的世錦賽上，日本與古巴爭奪冠軍，古巴在一場正面交鋒中1-0奪冠。

1992年巴塞羅那奧運會，日本國家隊在棒球比賽中對陣古巴國家隊，古巴8-2戰(zhàn)勝日本隊。這兩個國家都進入了四分之一決賽，古巴獲勝。日本隊輸給了臺灣隊（中華臺北隊），但在第三名的比賽中擊敗美國隊獲得銅牌。日本和古巴也在2004年雅典奧運會上打過棒球，日本在兩國的對決中以6-3獲勝。兩個國家都晉級決賽，但日本在半決賽中被澳大利亞擊敗，因此他們無法在決賽中面對古巴。在雅典奧運會上，古巴獲勝，日本獲得第三名。

日本和古巴的代表參加了2006年舉行的第一屆世界棒球經(jīng)典賽（WBC）。本次比賽，兩國都是除非晉級決賽，否則永遠無法交鋒的牌，但日本和古巴都挺進了半決賽，在決賽中對決。日本隊以10-6獲勝，贏得了令人難忘的首場WBC勝利。輸球的古巴也獲得了WBC的亞軍。

2012年，日本和古巴之間的國際友誼賽以武士日本比賽的名義舉行。本場比賽，日本隊取得兩連勝。