MS軟件模塊翻譯-設(shè)置常規(guī)選項(xiàng)

GULP服務(wù)器應(yīng)用程序支持大量設(shè)置,其中許多設(shè)置可以通過(guò)Materials Studio用戶(hù)界面訪問(wèn)。通過(guò)向輸入文件添加各種關(guān)鍵字,可以在計(jì)算中包括許多其他設(shè)置。
一個(gè)可能最終決定計(jì)算精度的重要設(shè)置是力場(chǎng)庫(kù)的選擇。盡管可以在輸入文件本身中指定各種原子間相互作用的細(xì)節(jié),但用戶(hù)界面提供了最簡(jiǎn)潔的選項(xiàng)。GULP安裝中提供了許多forcefield庫(kù),下面簡(jiǎn)要介紹了它們的內(nèi)容和推薦使用方法。
名字
描述
元素
Belashchenko
Na的嵌入原子法(EAM)勢(shì)能,用于描述液態(tài)金屬狀態(tài)。
Na
Brenner
用于有機(jī)體系建模的反應(yīng)鍵序(REBO)勢(shì)能。
C, H, O, F
Brenner1
將Brenner REBO勢(shì)能擴(kuò)展到碳硅烷。
C, Si, H
Bresme-H2O
Bresme的水的中心力模型。
O, H
Bush
無(wú)機(jī)氧化物材料(包括稀土金屬氧化物)的殼層模型勢(shì)能。
O, Li, Na, K,
Mg, Ca, Sr,
Ba, Fe, Ti,
Al, Ga, Y, La,
Pr, Nd, Gd,
Eu, Tb, Yb
Carbonates
方解石和相關(guān)體系建模的勢(shì)能。氧氣用殼層模型勢(shì)能表示。
Ca, Mg, Fe,
Cd, Mn, Ni,
Zn, Co, C, O
Catlow
基于Catlow oxygen shell模型勢(shì)能的收集-建議用于沸石和相關(guān)硅酸鹽(包括具有羥基的材料)。
O, Mg, Al,
Na, Si, P, H
ClayFF
粘土材料的勢(shì)能
O, Mg, Al,
Si, Ca, Fe, Li,
Na, K, Cs,
Ba, Cl, H
Cleri-Rosato
用嵌入原子方法(EAM)形式構(gòu)建的FCC金屬的勢(shì)能。
Ni, Cu, Rh,
Pd, Ag, Ir,
Pt, Au, Al,
Pb
Dreiding
有機(jī)分子、生物分子和主族無(wú)機(jī)分子的通用勢(shì)函數(shù)。
H, B, C, N,
O, F, Cl, Br,
I, Al, Si, P, S,
Ga, Ge, As,
Se, In, Sn,
Sb, Te, Na,
Ca, Fe, Zn,
Ti, Tc, Ru
EDIP-carbon
碳與環(huán)境相關(guān)的相互作用勢(shì)能。
C
EDIP-Si
硅與環(huán)境相關(guān)的相互作用勢(shì)能。
Si
Ercolessi
嵌入式原子方法的粘合類(lèi)型實(shí)現(xiàn)。
Au
FFSiOH
使用從頭計(jì)算結(jié)果參數(shù)化的(羥基化)二氧化硅的殼層模型。
Si, O, H
Finnis-Sinclair
Finnis和Sinclair的嵌入式原子方法實(shí)現(xiàn)。
W, Nb, Ta,
Cr, Mo, Fe,
V
Garofalini
玻璃體系建模的勢(shì)能,主要是鋁硅酸鹽。
不使用埃瓦爾德求和,而是使用截?cái)鄮?kù)侖勢(shì)。不同出版物的切片參數(shù)不同,Litton和Garofaini(1992)的值被認(rèn)為是決定性的。
Ca, Al, Si, O,
H, Na
Johnson
Johnson的嵌入式原子方法實(shí)現(xiàn)。
Cu, Ag, Au,
Ni, Pd, Pt
Lewis
氧化物基于Catlow氧氣殼層模型勢(shì)函數(shù)。
O, Ca, Sc, Ti,
V, Cr, Mn,
Fe, Co, Ni,
Zn, Zr, Cd,
Hf, Ce, Eu,
Tb, Th, U, Y,
La, Nd, Eu,
Gd, Ho, Yb,Lu, Pu
Matsui
二氧化鈦的勢(shì)能。
Ti, O
MEAM-1nn
原始版本的修改嵌入原子勢(shì),第一近鄰方法。有更準(zhǔn)確的MEAM版本涉及第二近鄰方法。
Cu, Ag, Au,
Ni, Pd, Pt,
Al, Pb, Rh,
Ir, Li, Na, K,
V, Nb, Ta,
Cr, Mo, W,
Fe, C, Si, Ge,
H, N, O
MEAM-2nn
涉及第二近鄰的MEAM版本。
Cu, Ag, Au,
Ni, Pd, Pt,
Al, Pb, Fe,
Cr, Mo, W,
V, Nb, Ta, C,
Si, Ge, In,
Mg, Ti, Zr,
Li, Ga, N, Ni,
O, H
Mei-
Davenport
在關(guān)于自由能和熔化的原始論文中使用的Al的嵌入原子模型。
Al
MOX-fuels
利用從頭計(jì)算和實(shí)驗(yàn)測(cè)量構(gòu)建混合氧化物核燃料的勢(shì)能。
U, Np, Pu, O
ReaxFF 5.5
具有有機(jī)分子參數(shù)的反應(yīng)力場(chǎng)ReaxFF。
C, O, H
ReaxFF 6.0
反應(yīng)力場(chǎng)ReaxFF,具有多種有機(jī)和無(wú)機(jī)體系的組合參數(shù)。
C, O, H
Zn, O, H
Fe, Cl, O, H
Ni
Ba, Y, Zr
Cu
N
Au, S, C, H
Au,O
Al
Mg, P
Si, Na
ReaxFF Li
反應(yīng)力場(chǎng)ReaxFF,含Li材料的參數(shù)。
C, O, H, N,
S, Li (Mo,
Ni, B, F, P)
Sauer (a)
基于Sauer氧-氧殼層模型勢(shì)函數(shù)建議用于沸石(包括具有羥基的材料)。
O, Si, Al, H,
Li, Na, K
Stillinger-
Weber
硅的Stillinger Weber勢(shì)能。
Si
Streitz-
Mintmire
氧化鋁的Streitz和Mintmire可變電荷模型。
O, Al
Sutton-Chen
用嵌入原子方法(EAM)形式構(gòu)建的FCC金屬的勢(shì)能。
Ni, Cu, Rh,
Pd, Ag, Ir,
Pt, Au, Al,
Pb
Tersoff
半導(dǎo)體及其常見(jiàn)雜質(zhì)的勢(shì)能。
Si, Ge, C, N,
H, O
Tersoff ZRL
硅、二氧化硅和常見(jiàn)雜質(zhì)的勢(shì)能
Si, O, N, H
Tiwary
使用從頭計(jì)算構(gòu)建二氧化鈾的勢(shì)能。
U, O
Vashishta
專(zhuān)用二氧化硅勢(shì)能。
Si, O
VBO
Al-H體系的價(jià)鍵有序勢(shì)。
Al, H

Sauer庫(kù)只能通過(guò)QMERA“計(jì)算”對(duì)話(huà)框作為QMERA GULP力場(chǎng)使用
注:除非周期體系中靜電相互作用的處理外,GULP中Dreiding力場(chǎng)的實(shí)現(xiàn)基本上與Forcite中的等效。為了在GULP和Forcite之間達(dá)成一致,應(yīng)通過(guò)編輯Dreiding.off文件并將
DISTANCE_DEPENDENT_DIELETRIC_CONSTANT的值從T更改為F,在Forcite中打開(kāi)完整的庫(kù)侖相互作用。該文件存儲(chǔ)在客戶(hù)端和服務(wù)器上的share\Resources\Simulation\ClassicalEnergy\FORCEFIELDS\Standard文件夾中-在遠(yuǎn)程網(wǎng)關(guān)上運(yùn)行Forcite時(shí),必須修改這兩個(gè)文件。
注:ReaxFF 6.0庫(kù)包含許多論文中的參數(shù)匯編。請(qǐng)謹(jǐn)慎使用此庫(kù),因?yàn)閰?shù)集之間可能存在兼容性問(wèn)題,并且沒(méi)有定義元素之間的所有交叉項(xiàng)。Gale(2011)對(duì)GULP中的ReaxFF實(shí)現(xiàn)進(jìn)行了詳細(xì)描述。以下是由Gale教授修改的兼容集指南:
l Zn?O?H
l Fe?Cl?(O,H)-O和H與相容性論文中的略有不同
l Ni?(C,H)-C和H與兼容性論文中的略微不同
l Ba?Y?Zr?(N,O,H,(O,H)-O和H與論文中的相容性略有不同
l Si,C,Na,(O,H.)-O,H與論文的相容性略微不同
l Au,S,(C,H.)O和H與本文的相容性稍有不同
注:EAM庫(kù)文件設(shè)置為運(yùn)行涉及單個(gè)金屬物種的計(jì)算。為了研究合金,重要的是要在感興趣的金屬之間添加交叉項(xiàng)。
這些經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的力場(chǎng)庫(kù)隨GULP一起提供。許多其他出版物包含了進(jìn)一步的參數(shù),盡管這些參數(shù)不太常用,因此也沒(méi)有得到很好的驗(yàn)證。倫敦大學(xué)學(xué)院網(wǎng)站上提供了元素周期表中各種元素的此類(lèi)勢(shì)能數(shù)據(jù)庫(kù):
http://www.ucl.ac.uk/klmc/Potentials/.
提示:可以將外部源的力場(chǎng)庫(kù)添加到Materials Studio中。使用“選擇GULP力場(chǎng)”對(duì)話(huà)框可以定位并導(dǎo)入其他力場(chǎng)庫(kù)。只要文件名的擴(kuò)展名為.lib,就可以將其導(dǎo)入GULP,并且可以從GULP“計(jì)算”對(duì)話(huà)框的“設(shè)置”選項(xiàng)卡上的“力場(chǎng)”下拉列表中進(jìn)行選擇。
或者,GULP允許您通過(guò)執(zhí)行力場(chǎng)擬合運(yùn)行來(lái)生成新的力場(chǎng)或編輯現(xiàn)有的力場(chǎng)。