細(xì)胞及其在組織內(nèi)與組織間的關(guān)系對(duì)于理解正常發(fā)育和疾病病理至關(guān)重要?？臻g組學(xué)技術(shù)可以彌補(bǔ)單細(xì)胞測(cè)序沒(méi)有空間位置信息的缺憾，在組織背景下對(duì)基因表達(dá)進(jìn)行定位和定量。FFPE 樣本可以長(zhǎng)期保存病理信息，同時(shí)可以溯源如疾病診斷、預(yù)后等臨床信息，具有很高的臨床科研價(jià)值。但 FFPE 樣本固定時(shí)福爾馬林的使用和保存時(shí)間久等原因，會(huì)導(dǎo)致核酸存在不同程度的降解，使其在空間基因表達(dá)的研究中富有挑戰(zhàn)。

2021 年推出的基于 10x 公司的 Visium FFPE 產(chǎn)品很好地解決了 FFPE 組織樣本轉(zhuǎn)錄組分析難題，但是該技術(shù)依然存在很多問(wèn)題和挑戰(zhàn)。

問(wèn)題一：珍貴樣本已經(jīng)貼在普通玻片上，無(wú)法轉(zhuǎn)移

問(wèn)題二：切片面積大于捕獲面積，希望只針對(duì)感興趣的區(qū)域進(jìn)行研究

問(wèn)題三：研究需要更大的切片面積

問(wèn)題四：重要的石蠟樣本保存時(shí)間太久，質(zhì)檢不合格

問(wèn)題五：樣本切片太少，不滿足黏附測(cè)試及質(zhì)檢需求

問(wèn)題六：病理科石蠟樣本不允許帶出醫(yī)院

為了解決以上問(wèn)題，博奧晶典引入了最新的?10x Visium CytAssist 空間組學(xué)組織分析物轉(zhuǎn)移系統(tǒng)，為 FFPE 樣本的空間組學(xué)研究拓展了新方向，下面跟著小編一起了解一下吧。

Visium CytAssist?儀器介紹

Visium CytAssist 是一款輕便小巧且易于攜帶的臺(tái)式儀器，搭配全新升級(jí)試劑，可以輕松進(jìn)入您的實(shí)驗(yàn)室完成FFPE空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)。它的使命是將 FFPE 組織切片上的探針捕獲的轉(zhuǎn)錄組信息從普通載玻片轉(zhuǎn)移到 Visium 建庫(kù)芯片上，實(shí)現(xiàn)組織切片的空間組學(xué)分析。比如病理科存檔貼在普通載玻片上的FFPE樣本現(xiàn)在就可以通過(guò) Visium CytAssist 進(jìn)行分析了。

Visium CytAssist 工作流程

在 Visium CytAssist 工作流程中，在普通玻片上進(jìn)行的是 FFPE 組織切片的脫蠟、染色、成像、解交聯(lián)和探針雜交；然后，將兩個(gè)普通玻片和一張含有2個(gè)捕獲區(qū)域（6.5 mm x 6.5 mm 或者 11 mm x 11 mm）的 Visium 建庫(kù)芯片放入 Visium CytAssist 儀器中，使普通玻片上的組織切片與 2 個(gè) Visium 捕獲區(qū)域?qū)R；隨后，通過(guò) Visium CytAssist 儀器捕捉明場(chǎng)圖像，確定感興趣的病理區(qū)域；最后，Visium CytAssist 將普通玻片組織切片上的轉(zhuǎn)錄組信息轉(zhuǎn)移到 Visium 捕獲區(qū)域，Visium 捕獲區(qū)域通過(guò)帶有不同位置標(biāo)簽的探針捕獲轉(zhuǎn)錄組信息，從而獲取石蠟切片不同空間位置的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平。

Visium CytAssist 優(yōu)勢(shì)展示?

樣本類型 Plus+?

可同時(shí)兼容普通石蠟塊樣本、標(biāo)準(zhǔn)載玻片上的預(yù)切片組織、及存檔的蓋玻片樣本等，通過(guò) Visium CytAssist 系統(tǒng)將分析物轉(zhuǎn)移到 Visium 建庫(kù)芯片上，進(jìn)一步擴(kuò)展了樣本類型。

選片低風(fēng)險(xiǎn)?

可以先通過(guò) H&E 染色確定要分析的正確切片，聚焦感興趣的切片區(qū)域，然后再進(jìn)行分析物轉(zhuǎn)移，極大的避免了樣本選片不合適造成的樣本浪費(fèi)。

面積更靈活?

新增加了更大面積的 11 mmx11 mm 捕獲芯片，同時(shí)可在 6.5 mmx6.5 mm 或 11 mmx11 mm 的反應(yīng)區(qū)域靈活選擇感興趣的病理區(qū)域。

質(zhì)控更友好?

質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)降低為 DV200>30%，可檢測(cè)更多高降解度的樣本。

檢測(cè)配置大升級(jí)?

更高組織粘附性，跟預(yù)實(shí)驗(yàn) say goodbye；三對(duì)探針對(duì)，人的高表達(dá)基因精準(zhǔn)捕獲。

湊樣更自由?一張芯片從四個(gè)點(diǎn)陣減少至兩個(gè)點(diǎn)陣，不再擔(dān)心湊樣難的問(wèn)題。
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博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部?蒲葉丨文案

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