熒光素酶干貨系列1
在上一系列的干貨分享中,我們介紹了組織(細胞)特異性基因表達調(diào)控相關知識。接下來,我們將目光聚焦 “檢測工具的核心成員”——熒光素酶,開啟一個新的篇章。本系列將由熒光素酶的歷史和發(fā)展開始,詳細介紹當前熒光素酶相關實驗的干貨知識。
熒光素酶(Luciferase)
熒光素酶(Luciferase)是自然界中能夠催化生物發(fā)光的酶的統(tǒng)稱,熒光素酶催化的發(fā)光也是自然界最常見的生物發(fā)光形式之一,人類對熒光素和熒光素酶觀察和研究有著悠久的歷史。伴隨著人類文明的發(fā)展,對發(fā)光生物認識也從簡單的觀察記錄轉(zhuǎn)為實驗性的探索利用。
公元前4世紀的先哲亞里士多德最早提及生物發(fā)光,17世紀羅伯特.波義耳則證明了生物發(fā)光需要氧氣的參與。19世紀 Rapha?l Dubois通過實驗發(fā)現(xiàn)了催化生物發(fā)光的重要物質(zhì)——熒光素酶和它的底物——熒光素。
隨著時間的推移,研究人員揭示了更多熒光素酶催化-熒光素發(fā)光反應背后的機制。也開始利用這個機制用于科研。
熒光素酶可以催化熒光素氧化成氧化熒光素,在熒光素的氧化過程中,會發(fā)出生物熒光(bioluminescence),可通過熒光測定設備測定反應中釋放的生物熒光。
目前,以北美螢火蟲(Photinus pyralis)來源的熒光素酶(Fluc)應用的最為廣泛,應用于分子生物學和生物分析系統(tǒng),F(xiàn)luc具有信號強,背景干擾弱,蛋白穩(wěn)定耐熱性強,無需表達后修飾等特點,此外,其底物也無毒且十分穩(wěn)定,非常適用于體內(nèi)或者體外實驗。
Fluc是腺苷酸形成酶(adenylate-forming enzymes)超家族的一員,其利用ATP的化學能催化熒光素發(fā)生氧化、脫羧反應,并伴有發(fā)光的現(xiàn)象。Fluc會選擇含有羥基-苯并噻唑-噻唑-羧酸結(jié)構(gòu)(hydroxy- benzothiazolyl- thiazoline-carboxylic acid structure ,D-LH2)的底物,并在ATP、氧氣和金屬離子(如Mg+2)的參與下,D-LH2噻唑啉環(huán)上的羧酸鹽攻擊ATP的α-磷酸基,發(fā)生SN2親核位移反應,生成一種不穩(wěn)定的熒光素二氧乙酮(luciferin dioxetanone),隨后分解生成二氧化碳和一個處在電子激發(fā)態(tài)的氧化熒光素酶,當電子衰減到基態(tài)附近時,釋放紅色和綠色的光子,光譜的可見區(qū)在540 - 600nm之間。
除此之外,F(xiàn)luc還能催化一些脂肪酸輔酶A形成,甚至有研究通過點突變一種甲蟲的脂肪酸酶CoA合成酶,使其轉(zhuǎn)變?yōu)闊晒馑孛福@些證據(jù)足以說明Fluc起源于脂肪酸CoA合成酶。
Fluc也是腺苷酸形成酶超家族中第一個通過X光進行結(jié)構(gòu)分析的成員。Fluc的C端和N端的結(jié)構(gòu)域均含有柔性鉸鏈的α+β結(jié)構(gòu)(α+β structure),熒光素的催化活性位點位于近N端的柔性鉸鏈區(qū)。通過對其結(jié)構(gòu)的認識,人類對其進行改造,使其廣泛應用于不同的檢測技術中。
另外,取自海洋腔腸動物海腎(Renilla reniformis)的熒光素酶(Rluc)也是一種可以催化底物發(fā)生熒光反應的單亞基特異活性蛋白。與Fluc不同的是,他們的底物和輔因子不同,F(xiàn)luc需要氧氣、ATP和鎂離子同時存在才能催化底物熒光素發(fā)光,而Rluc僅需要氧氣便可催化底物腔腸素(coelenterazine)發(fā)光。區(qū)別于Fluc產(chǎn)生的黃綠色熒光,Rluc產(chǎn)生藍色的光,波長480nm附近。正是由于這兩種酶的底物和發(fā)光顏色不同,所以在雙信號報告實驗中得到廣泛的應用。
同F(xiàn)luc一樣,Rluc在完成轉(zhuǎn)錄翻譯后即具有催化活性。熒光素酶可以作為報告基因,通過檢測熒光的強度,來反映熒光素酶的表達水平,進而反映某一表達系統(tǒng)的活力水平。
熒光素酶的具體應用,主要有以下幾個方面:?
驗證miRNA與mRNA/lncRNA/circRNA的互作
將要研究的靶點序列(序列可以是mRNA上的,也可以是lncRNA/circRNA的序列)插入到報告載體中,作為熒光素酶基因的3’UTR,與miRNA共同轉(zhuǎn)染工具細胞,如果mir與靶序列互作,則熒光素酶表達量下降(檢測的熒光信號下降)。
啟動子與轉(zhuǎn)錄因子作用分析
將要研究的啟動子序列構(gòu)建到報告載體中作為熒光素酶的啟動子,同時轉(zhuǎn)染要研究的轉(zhuǎn)錄因子過表達質(zhì)粒(根據(jù)實驗需求也可以不轉(zhuǎn)染,利用細胞內(nèi)源轉(zhuǎn)錄因子)。如果轉(zhuǎn)錄因子與啟動子存在相互作用,則熒光素酶表達量會發(fā)生相應改變(檢測的熒光信號隨之變化)。
檢測信號通路活性
將待研究的信號通路響應元件序列構(gòu)建到報告基因載體中,相應信號通路激活/抑制后會作用于響應元件,引起熒光素酶表達水平的改變,通過檢測熒光信號的改變來反應信號通路的活性。
動物試驗指示作用
將攜帶熒光素酶的病毒遞送載體或穩(wěn)定表達熒光素酶的腫瘤細胞注射到實驗動物體內(nèi)后,在不處死動物的情況下,通過注射熒光素酶底物,通過活體成像技術可以觀察病毒感染的組織和腫瘤細胞的轉(zhuǎn)移情況。
接下來的幾期內(nèi)容我們將陸續(xù)對熒光素酶在科研中的應用進行深入詳細的介紹,歡迎大家繼續(xù)關注我們的內(nèi)容。