無論是執(zhí)行單點能量計算、最小化體系還是執(zhí)行分子動力學模擬，運行遠程GULP作業(yè)所執(zhí)行的步驟序列始終相同。單擊“GULP計算”對話框上的“運行”按鈕時，將執(zhí)行示例遠程作業(yè)運行中描述的步驟，但有以下差異：Materials Studio在從服務器接收更新信息時的確切行為取決于正在執(zhí)行的計算類型。

對于能量計算，如果

l 已選中更新結(jié)構(gòu)：沒有效果，因為沒有任何結(jié)構(gòu)更改與此任務關聯(lián)。

l 已檢查更新圖形：沒有效果。

l 選中更新文本結(jié)果：Materials Studio下載一個名為Status.txt的文本文件，其中包含所執(zhí)行的計算、總能量和總能量收斂的摘要（例如，上一次迭代的更改）。

對于“幾何體優(yōu)化”計算和“表面計算”，如果選中了

l “更新結(jié)構(gòu)”：Materials Studio將下載結(jié)構(gòu)的快照，并相應地修改原始結(jié)構(gòu)的副本。

l 檢查了更新圖：Materials Studio創(chuàng)建了一個名為[seedname]Energies.xcd的圖表文檔，顯示了總能量與優(yōu)化步驟的關系，另一個稱為[seedname]Convergence.xcd的圖文檔，以對數(shù)尺度顯示了總能源變化和梯度與優(yōu)化步驟的關系。

l 選中更新文本結(jié)果：Materials Studio下載一個名為Status.txt的文本文件，其中包含所執(zhí)行的計算、總能量、總能量收斂（例如上一次迭代的變化）和梯度的摘要。

對于動力學計算，如果選中了

l “更新結(jié)構(gòu)”：Materials Studio將下載結(jié)構(gòu)的快照，并相應地修改原始結(jié)構(gòu)的副本。

l 檢查了更新圖：Materials Studio創(chuàng)建了一個名為[seedname]Constant.xcd的圖表文檔，顯示運動常數(shù)與模擬時間的關系，一個稱為[seedname]Energy.xcd的圖表文檔顯示勢能和動能與模擬時間之間的關系，另一個名為主[seedname]Temperature.xcd的表格文檔顯示溫度與模擬時間。此外，如果為三維周期性結(jié)構(gòu)運行計算，則會創(chuàng)建圖表文檔[seedname]Pressure.xcd。當GULP完成平衡階段時，圖表將被清除，并僅顯示從那時起的生產(chǎn)階段結(jié)果。

l 檢查更新文本結(jié)果：Materials Studio下載一個名為Status.txt的文本文件，其中包含執(zhí)行的計算摘要、完成的動力學步驟數(shù)、溫度以及最后完成的優(yōu)化步驟的運動常數(shù)。它還說明了GULP目前是否處于計算的平衡或生產(chǎn)階段。

作業(yè)完成后，Materials Studio將把輸出文件傳輸回你的電腦，你可以在那里查看和編輯它們，分析結(jié)果，或使用它們進行進一步的計算。根據(jù)你執(zhí)行的計算類型，可能會生成或修改其他輸出文件。

l 對于Energy運行，Materials Studio會下載所有GULP輸出文件。

l 對于幾何體優(yōu)化運行，Materials Studio下載所有GULP輸出文件，更新已復制到結(jié)果文件夾中的結(jié)構(gòu)以顯示最終幾何體，并創(chuàng)建軌跡文件[seedname].xtd，其中包含優(yōu)化過程的歷史記錄?？梢允褂谩皠赢嫛惫ぞ邫谏系墓ぞ邽檐壽E文件設置動畫。

l 對于動力學運行，Materials Studio下載所有GULP輸出文件，更新已復制到結(jié)果文件夾中的結(jié)構(gòu)，以在動力學運行開始時顯示配置，并創(chuàng)建一個軌跡文件[seedname].xtd，用于描述分子動力學計算的生產(chǎn)階段?？梢允褂谩皠赢嫛惫ぞ邫谏系墓ぞ邽檐壽E文件設置動畫。

2.2.1如果遠程GULP作業(yè)失敗

Materials Studio會在啟動前檢查執(zhí)行GULP作業(yè)所需的大部分數(shù)據(jù)和設置。如果無法啟動作業(yè)，則會生成詳細說明原因的錯誤消息。

但是，有時作業(yè)可能會因為無法在啟動前檢查的原因而失敗。在這種情況下，有關錯誤的更詳細信息可能只能在作業(yè)生成的[seedname].gout文件或位于服務器端項目目錄[seedname]_Files中的MatStudioLog.htm文件中獲得。存儲在服務器目錄中的其他文件，例如Gulp.log，也可能包含進一步的線索。要查看服務器端文件，可以使用作業(yè)資源管理器的“遠程查看”功能。

以下是GULP作業(yè)失敗的最常見原因列表。它可以幫助你識別并解決遠程GULP作業(yè)中的任何問題。有關遠程作業(yè)失敗的一般原因，請參閱“如果遠程作業(yè)失敗”幫助主題。

提示：從菜單欄中選擇“查看|項目日志”，查看是否報告了任何錯誤或警告消息。

2.2.2GULP作業(yè)無法啟動的常見原因

服務器端問題GULP輸出包含一條消息“錯誤：內(nèi)存分配失敗”。此消息通常意味著運行GULP的計算機上沒有足夠的可用內(nèi)存。例如，當要求具有1000多個原子的大型體系具有振動性質(zhì)時，這很可能發(fā)生。通過從GULP設置對話框的性質(zhì)選項卡中刪除振動性質(zhì)計算，通常可以成功完成運行。

提示：在采取任何行動之前，確定GULP作業(yè)失敗的原因很重要。在大多數(shù)情況下，錯誤消息會在GULP報告文件[seedname].gout或位于服務器端項目目錄[seedname]_Files中的MatStudioLog.htm文件中報告。

2.2.3在獨立模式下運行GULP

運行GULP最方便的方法是通過Materials Studio界面，該界面執(zhí)行運行GULP作業(yè)所需的所有準備任務。然而，在某些情況下，可能需要在獨立模式下運行GULP，并在其他地方準備一組輸入文件。例如，你可能希望在未配置為網(wǎng)關的服務器上運行計算，例如不與Materials Studio客戶端通信的計算機（可能是因為防火墻阻止自動文件傳輸和作業(yè)啟動）。