醫(yī)學圖像開源數(shù)據(jù)集匯總
編輯丨極市平臺
3D-IRCADB 臟器分割數(shù)據(jù)集
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3D-IRCADb-01 數(shù)據(jù)庫由 10 名女性和 10 名男性 75% 的肝腫瘤患者的 3D CT 掃描組成。20個文件夾對應20個不同的患者,可以單獨下載也可以聯(lián)合下載。下表提供了圖像信息,例如肝臟大?。▽挾?、深度、高度)或根據(jù) Couninaud 分割的腫瘤位置。它還表明肝臟分割軟件可能遇到的主要困難是由于與鄰近器官的接觸、肝臟的非典型形狀或密度,甚至圖像中的偽影。

FASCICLE 小腿肌肉超聲數(shù)據(jù)集
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FAscicle 小腿肌肉超聲數(shù)據(jù)集是一個由 812 幅小腿肌肉超聲圖像組成的數(shù)據(jù)集,用于分析肌肉弱點并預防受傷。該數(shù)據(jù)集在文章 AW-Net:B 型超聲圖像上的自動肌肉結(jié)構(gòu)分析以預防傷害中進行了介紹。它結(jié)合了由 Ryan Cunningham 等人發(fā)表的兩篇文章“使用卷積、殘差和反卷積神經(jīng)網(wǎng)絡從 B 模式超聲圖像中估計全區(qū)域骨骼肌纖維方向”提供的數(shù)據(jù)集。和 Neil Cronin 發(fā)表的“使用深度學習對肌肉骨骼超聲圖像進行自動分析”,并附有補充注釋。
該 zip 文件包含兩個數(shù)據(jù)集,分別分為兩個由其作者命名的文件夾。每個數(shù)據(jù)集的每個圖像都有一個匹配的分束分割掩碼和一個可按名稱識別的腱膜分割掩碼。

腫瘤數(shù)據(jù)集
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這一數(shù)據(jù)集是通過仔細注釋幾名患有不同器官腫瘤并在多家醫(yī)院被診斷出的患者的組織圖像獲得的。該數(shù)據(jù)集是通過從TCGA存檔下載以 40 倍放大倍率捕獲的 H&E 染色組織圖像創(chuàng)建的。H&E 染色是增強組織切片對比度的常規(guī)方案,通常用于腫瘤評估(分級、分期等)??紤]到多個器官和患者的細胞核外觀的多樣性,以及多家醫(yī)院采用的豐富染色方案,訓練數(shù)據(jù)集將能夠開發(fā)出開箱即用的穩(wěn)健且可推廣的細胞核分割技術(shù)。

結(jié)直腸腺癌組織學圖像數(shù)據(jù)集
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該數(shù)據(jù)集包含 100 張 H&E 染色的結(jié)直腸腺癌組織學圖像。出于檢測目的,在中心/周圍共標記了 29,756 個原子核。其中,有 22,444 個細胞核也具有相關(guān)的類別標簽,即上皮細胞、炎癥細胞、成纖維細胞和其他細胞核。

淋巴結(jié)切片的組織病理學數(shù)據(jù)集
數(shù)據(jù)集鏈接:http://m6z.cn/6axBNq
本數(shù)據(jù)集由從淋巴結(jié)切片的組織病理學掃描中提取的 327.680 張彩色圖像 (96 x 96px) 組成。每個圖像都帶有一個二進制標簽,表示存在轉(zhuǎn)移組織。PCam 為機器學習模型提供了新的基準:大于 CIFAR10,小于 imagenet,可在單個 GPU 上訓練。

m2caiSeg腹腔鏡圖像數(shù)據(jù)集
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m2caiSeg是根據(jù)真實世界外科手術(shù)的內(nèi)窺鏡視頻源創(chuàng)建的。數(shù)據(jù)由 307 張圖像組成,每張圖像都針對場景中存在的器官和不同的手術(shù)器械進行了注釋。

血細胞圖像數(shù)據(jù)集
數(shù)據(jù)集下載地址:http://m6z.cn/5zdTDb
該數(shù)據(jù)集包含 12,500 張帶有細胞類型標簽 (CSV) 的增強血細胞圖像 (JPEG)。4 種不同細胞類型中的每一種都有大約 3,000 張圖像,這些圖像被分組到 4 個不同的文件夾中(根據(jù)細胞類型)。細胞類型是嗜酸性粒細胞、淋巴細胞、單核細胞和中性粒細胞。

腦腫瘤 MRI 數(shù)據(jù)集
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該數(shù)據(jù)集包含7022張人腦 MRI 圖像,分為 4 類:膠質(zhì)瘤-腦膜瘤-無腫瘤和垂體。注意這個數(shù)據(jù)集中的圖像大小是不同的。您可以在預處理并去除多余的邊距后將圖像調(diào)整為所需的大小。
糖尿病性黃斑水腫的OCT圖像數(shù)據(jù)集
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使用杜克企業(yè)數(shù)據(jù)統(tǒng)一內(nèi)容瀏覽器搜索引擎追溯識別杜克眼科中心醫(yī)學視網(wǎng)膜實踐中的患者,并使用與他們就診相關(guān)的 DME (ICD-9 362.07) 計費代碼。然后,一名眼科醫(yī)生使用標準 Spectralis(Heidelberg Engineering,Heidelberg,Germany)61 線體積掃描協(xié)議確定了 6 名臨床成像的患者,這些患者具有嚴重的 DME 病理學和不同的圖像質(zhì)量。
身體部位X射線圖像數(shù)據(jù)集
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本數(shù)據(jù)集收集了來自身體各部位的X光圖片

眼病深度學習數(shù)據(jù)集
數(shù)據(jù)集下載地址:http://m6z.cn/5yth3m
712張片狀角膜潰瘍的眼部染色圖像

皮膚病數(shù)據(jù)集
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23類皮膚病的圖像數(shù)據(jù),圖像總數(shù)約為 19,500 張,其中大約 15,500 張已在訓練集中分割,其余在測試集中分割。
心臟病發(fā)作分析和預測數(shù)據(jù)集
數(shù)據(jù)集下載地址:http://m6z.cn/6ikH8v
本數(shù)據(jù)集含有303名心臟病患者的數(shù)據(jù)。

膝關(guān)節(jié) X 射線圖像數(shù)據(jù)集
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該數(shù)據(jù)集包括從知名醫(yī)院和診斷中心收集的 1650 張膝關(guān)節(jié)電子 X 射線圖像。X 射線圖像是使用 PROTEC PRS 500E X 射線機獲取的。原始圖像是 8 位灰度圖像。每個 X 射線膝關(guān)節(jié) X 射線圖像均由 2 位醫(yī)學專家根據(jù) Kellgren 和 Lawrence 等級手動注釋/標記。
