朝霧彩是個(gè)不幸的女孩，她在學(xué)校里遭受著同學(xué)的欺凌，回到家還會(huì)被親哥哥虐待，這樣的生活讓她每天只思考一件事，那就是死亡才能解脫。這天晚上，朝霧彩被哥哥當(dāng)做泄憤的沙袋揍得遍體鱗傷，生無可戀的她躺在床上思考如何去死，突然電腦里彈出來一個(gè)魔法少女網(wǎng)站。網(wǎng)站里說給不幸的朝霧彩送上魔法杖，這樣她就能體驗(yàn)不一樣的魔法少女生活。

奴村露乃在千鈞一發(fā)之際救下了朝霧，她也是魔法少女。奴村向朝霧說明了關(guān)于魔法少女和魔法少女網(wǎng)站的信息，魔法少女可以用自己的魔法制裁任何她們覺得有罪之人。但每次使用魔法她們的壽命都會(huì)減少，當(dāng)身上的魔法標(biāo)記完全消失之時(shí)，那就是她們的死期。奴村想與朝霧聯(lián)手，因?yàn)樵邶嫶蟮哪Хㄉ倥后w中，出現(xiàn)了魔法少女獵人，獵人專門殺害魔法少女來奪取魔杖，奴村想用朝霧的魔杖來吸引獵人出現(xiàn)。

殺害魔法少女，奪走魔杖的“魔法少女獵人”的真實(shí)身份，是名為潮井梨奈的魔法少女?！拔沂菫榱嗽凇╋L(fēng)雨’中存活”梨奈將網(wǎng)站的秘密公開，但由于過度使用魔杖而導(dǎo)致失去意識(shí)。為了讓梨奈恢復(fù)意識(shí)，彩和露乃開始尋找擁有治療能力的魔法少女。但是，找到的新的魔法少女卻是個(gè)讓人意外的人物……

新的魔法少女，穴澤虹海想取了梨奈的命，也沒有讓梨奈恢復(fù)意識(shí)的手段。即便如此與露乃相遇后，彩的生活也逐漸變得好起來了。就在這時(shí)，班里來了個(gè)轉(zhuǎn)校生。那位充滿笑容打招呼的轉(zhuǎn)校生——正是虹海！彩著急了起來。但能依賴的露乃卻沒來學(xué)?！?/p>

失去朋友并受了傷的雫芽紗理奈，因自己也成為了魔法少女而發(fā)誓要找彩去報(bào)仇。另一方面，去探望露乃的彩，發(fā)現(xiàn)露乃處于瀕死狀態(tài)。露乃頑固拒絕呼叫救護(hù)車，因?yàn)槁赌说倪^去隱藏著一個(gè)秘密。得知秘密后的彩無法抑制淚水。面對(duì)彩的眼淚和決心，露乃的內(nèi)心開始動(dòng)搖。