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各位小伙伴們，大家晚上好鴨~~小果的小粉絲看了《差異基因分析完之后不知道下步該怎樣做？小果教你這么辦！》之后，深受啟發(fā)，于是立馬做了一下發(fā)現(xiàn)找到了很多感興趣的調(diào)控因子，感覺科研又燃氣希望了（哈哈哈）。

但是面對那么多可能與目的lncRNA互作的調(diào)控因子，粉絲又繼續(xù)追問了小果一個問題，我預(yù)測出來的調(diào)控因子都能和我的lncRNA結(jié)合嗎，我該怎樣進一步篩選與我的lncRNA互作的調(diào)控因子呢？聰明絕頂?shù)男」舜罅课墨I之后，終于找到了一個可以預(yù)測lncRNA與蛋白能否結(jié)合的神器網(wǎng)站——RPISeq。

這個網(wǎng)站使用非常簡單，只需要找到lncRNA序列以及和他可能存在互作的蛋白序列，剩下的就都交給數(shù)據(jù)庫就可以幫我們搞定了，聽起來是不是特別簡單，趕快跟小果一塊學(xué)習(xí)一下吧?。?！

1、 進入數(shù)據(jù)庫（http://pridb.gdcb.iastate.edu/RPISeq/#）

2、 我們運行數(shù)據(jù)庫的示例文件?

分別輸入lncRNA的序列以及蛋白的序列，進行兩者互作的預(yù)測

3 、預(yù)測結(jié)果查看

如果都大約0.5就說明兩者存在互作，當然大家也可以輸入已知與該lncRNA互作的蛋白作為對照，這樣結(jié)果就更可信了。

4 、上面的示范是單個lncRNA和單個蛋白之間的互作，除此之外，還可以單個lncRAN和多個蛋白，或者單個蛋白和多個lncRNA之間進行預(yù)測哦，預(yù)測速度也非?？臁?/strong>

這個數(shù)據(jù)庫是不是特別的簡單，是不是學(xué)一遍就會了，趕快用起來吧?。。g迎大家私聊小果喲！

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標簽：數(shù)據(jù)庫lncRNA調(diào)控因子RPISeq