WOFOST模型與PCSE模型實踐技術(shù)應(yīng)用
實現(xiàn)作物產(chǎn)量的準(zhǔn)確估算對于農(nóng)田生態(tài)系統(tǒng)響應(yīng)全球變化、可持續(xù)發(fā)展、科學(xué)糧食政策制定、糧食安全維護(hù)都至關(guān)重要。傳統(tǒng)的經(jīng)驗?zāi)P?、光能利用率模型等估產(chǎn)模型原理簡單,數(shù)據(jù)容易獲取,但是作物生長發(fā)育非常復(fù)雜,中間涉及眾多生理生化過程,使用經(jīng)驗?zāi)P突蚬饽芾寐誓P腿狈σ欢ǖ臋C(jī)理性,而作物模型是一種能夠詳細(xì)描述作物生長原理并能高精度模擬作物生長發(fā)育全過程的以天為步長的機(jī)理模型,在生產(chǎn)模擬方面具有很大的優(yōu)勢。農(nóng)業(yè)生產(chǎn)模擬在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)中具有重要的意義,它為農(nóng)業(yè)決策制定、資源管理和食品生產(chǎn)提供了有力的工具和支持。
WOFOST(WorldFoodStudies)和PCSE(PythonCropSimulationEnvironment)是兩個用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)模擬的模型:WOFOST是一個經(jīng)過多年開發(fā)和驗證的模型,被廣泛用于全球的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)模擬和農(nóng)業(yè)政策分析;采用了模塊化的結(jié)構(gòu),可以對不同的農(nóng)作物和環(huán)境條件進(jìn)行參數(shù)化和適應(yīng);WOFOST可用于長期模擬,能夠模擬整個作物生長周期,包括播種、生長、收獲等各個階段;WOFOST積累了大量的實驗數(shù)據(jù),可用于驗證模型的準(zhǔn)確性,使其成為決策支持和政策分析的有力工具。PCSE是用Python編寫的,這使得它易于學(xué)習(xí)和使用,尤其是對于具有Python編程經(jīng)驗的用戶。PCSE是開源的,用戶可以自由訪問和修改其代碼,以滿足特定需求;PCSE可以與其他Python庫和工具集成,使其更容易與數(shù)據(jù)科學(xué)工作流程和其他農(nóng)業(yè)相關(guān)工具進(jìn)行集成。選擇使用哪個模型取決于具體的應(yīng)用場景、用戶的技能水平以及可用數(shù)據(jù)和計算資源。
圍繞兩個模型運行展開,包括:數(shù)據(jù)準(zhǔn)備,模型參數(shù)解讀與設(shè)置,模型運行與結(jié)果輸出,模型結(jié)果解讀與決策支持等內(nèi)容。本課程培訓(xùn)將你將學(xué)會如何使用WOFOST和PCSE這兩個農(nóng)業(yè)生產(chǎn)模型進(jìn)行作物生長模擬,了解不同農(nóng)作物的生長過程、對環(huán)境的響應(yīng)以及如何進(jìn)行模擬預(yù)測;使你深入了解作物的生長、發(fā)育和生態(tài)需求,包括光合作用、水分需求、營養(yǎng)吸收等;以幫助你在農(nóng)業(yè)決策中更準(zhǔn)確地評估不同因素的影響,如何根據(jù)氣象、土壤和作物特性做出更明智的決策,例如何時種植、如何灌溉和施肥等;在模型應(yīng)用過程中,你將需要處理和整理農(nóng)田相關(guān)的數(shù)據(jù),這有助于提高你的數(shù)據(jù)處理和分析能力;同時,你還會學(xué)習(xí)如何運用模型進(jìn)行科學(xué)研究,如何設(shè)置實驗和模擬,以及如何解釋和分析模型結(jié)果。我們將為你提供一系列與農(nóng)業(yè)生產(chǎn)模擬和科學(xué)研究相關(guān)的技能,這些技能可以在農(nóng)業(yè)、科研和決策支持等領(lǐng)域中發(fā)揮作用。
第一章理論基礎(chǔ)
農(nóng)作物生長模型概述
1、介紹農(nóng)作物生長模型的用途和應(yīng)用領(lǐng)域
2、比較WOFOST模型和PCSE模型的特點和優(yōu)勢
第二章數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
1、氣象數(shù)據(jù):
數(shù)據(jù)類型:溫度、降水、濕度、風(fēng)速等氣象要素數(shù)據(jù)。
數(shù)據(jù)格式:時間序列數(shù)據(jù),通常以日為單位。
獲取方法:氣象數(shù)據(jù)通??梢詮臍庀笳尽⑿l(wèi)星數(shù)據(jù)、氣象模型輸出或氣象數(shù)據(jù)服務(wù)提供商處獲取。
處理方法:數(shù)據(jù)需要按照WOFOST模型的要求進(jìn)行格式化,包括將數(shù)據(jù)按照時間步長整理成日數(shù)據(jù),并確保數(shù)據(jù)質(zhì)量。
2、土壤數(shù)據(jù):
數(shù)據(jù)類型:土壤質(zhì)地、有機(jī)質(zhì)含量、土壤層次、土壤水分保持量等土壤屬性。
數(shù)據(jù)格式:通常以土壤剖面的方式提供,包括不同深度的土壤屬性數(shù)據(jù)。
獲取方法:土壤數(shù)據(jù)可以通過土壤測量、土壤樣本分析、土壤數(shù)據(jù)庫或地理
信息系統(tǒng)(GIS)來獲取。
處理方法:需要將土壤數(shù)據(jù)與模型所需的土壤層次和深度相匹配,并確保數(shù)據(jù)質(zhì)量和一致性。
3、農(nóng)田管理信息:
數(shù)據(jù)類型:包括灌溉、施肥、播種日期、收獲日期等管理實踐數(shù)據(jù)。
數(shù)據(jù)格式:通常以時間序列形式提供。
獲取方法:這些數(shù)據(jù)通常由農(nóng)場記錄、農(nóng)民提供或通過問卷調(diào)查獲得。
處理方法:數(shù)據(jù)需要與模型的時間步長匹配,并與氣象和土壤數(shù)據(jù)進(jìn)行時間上的協(xié)調(diào)。
4、作物參數(shù):
數(shù)據(jù)類型:作物特性、生長速率、生育期、產(chǎn)量潛力等作物參數(shù)。
數(shù)據(jù)格式:通常以具體作物的參數(shù)表格或文件形式提供。
獲取方法:這些數(shù)據(jù)可以從農(nóng)業(yè)研究文獻(xiàn)、農(nóng)業(yè)擴(kuò)展服務(wù)或?qū)I(yè)農(nóng)業(yè)組織獲得。
處理方法:將作物參數(shù)與特定作物的模型運行相關(guān)聯(lián)。
5、其他數(shù)據(jù):
地理數(shù)據(jù):可能需要地理信息、地形和地理坐標(biāo)等數(shù)據(jù)來定義模型的運行區(qū)域。
觀測數(shù)據(jù):實際的農(nóng)田觀測數(shù)據(jù),如產(chǎn)量、生長情況、土壤水分等,用于模型校準(zhǔn)和驗證。
6、處理和準(zhǔn)備數(shù)據(jù)的方法:
數(shù)據(jù)清洗:確保輸入數(shù)據(jù)沒有缺失值或異常值,并進(jìn)行必要的數(shù)據(jù)清洗和修復(fù)。
數(shù)據(jù)插值:在需要時,使用插值方法填充缺失的數(shù)據(jù),以獲得連續(xù)的時間序列。
數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換:將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成模型可以接受的格式,通常是文本或表格文件。
數(shù)據(jù)空間匹配:確保不同來源的數(shù)據(jù)在時間和空間上匹配,以便模型正確運行。
第三章WOFOST模型基礎(chǔ)
1、WOFOST模型基礎(chǔ):
WOFOST模型的基本原理和生理基礎(chǔ)
設(shè)置模型輸入數(shù)據(jù)和參數(shù)
運行WOFOST模型并解讀輸出結(jié)果
2、WOFOST模型的主要參數(shù)包括:
物候發(fā)育:根據(jù)溫度和光照等因素,計算作物的發(fā)育階段(DVS),從0(出苗)到1(開花)到2(成熟)。發(fā)育階段決定了作物的生理狀態(tài)和同化物的分配比例1。
光截獲:根據(jù)葉面積指數(shù)(LAI)、輻射水平、散射系數(shù)等因素,計算作物冠層內(nèi)的光強(qiáng)分布和被吸收的光能量。
CO2同化:根據(jù)葉片的光合速率-光響應(yīng)曲線、溫度、CO2濃度等因素,計算作物冠層內(nèi)各層葉片的CO2同化率和總同化量。
呼吸作用:根據(jù)維持呼吸和生長呼吸的經(jīng)驗公式、溫度、干物質(zhì)含量等因素,計算作物各器官的呼吸消耗量。
同化物分配:根據(jù)發(fā)育階段、干物質(zhì)分配系數(shù)等因素,計算同化物在葉、莖、根、貯藏器官等部位的分配比例和累積量。
葉面積動態(tài):根據(jù)葉片的形成速率、衰老速率和死亡速率等因素,計算葉面積指數(shù)(LAI)的變化和總?cè)~面積。
蒸騰作用:根據(jù)潛在蒸散量、氣孔導(dǎo)度、土壤水分等因素,計算作物冠層內(nèi)各層葉片的蒸騰率和總蒸騰量。
土壤水分平衡:根據(jù)降水、滲透、蒸發(fā)、蒸騰、排水等因素,計算土壤剖面內(nèi)各層的土壤含水量和水分虧缺量。
土壤肥力:根據(jù)土壤氮素含量、氮素礦化速率、氮素淋失速率等因素,計算土壤對作物提供氮素的能力和氮素限制系數(shù)。
3、WOFOST模型安裝和運行:
氣象數(shù)據(jù)庫建立:
WOFOST氣象格式文件包含長期的月平均值(WOFOST氣候)或每月平均
時間序列(WOFOST天氣)的有關(guān)氣象變量。
氣象數(shù)據(jù)庫的編寫遵循獨自的語法規(guī)則該文件的前三行頭文件是帶有注釋的信息,這些信息用于區(qū)分氣象站點,此文件存儲在.../WCC/METEO/CLIMD。作
氣象數(shù)據(jù)庫文件包括最低氣溫、最高氣溫、天氣輻射、水汽壓、風(fēng)速、降水和每月降水天數(shù)。
作物數(shù)據(jù)庫的建立
對每種模擬作物來說,必須為WOFOST模型提供一系列具體的參數(shù)。
參數(shù)是包括作物的物候?qū)W參數(shù)、同化和呼吸特征參數(shù)以及同化物分配到植物器官的參數(shù)等,這些參數(shù)保存在安裝目錄...\WCC\CROPD,在模型控制中心可以通過選擇該作物調(diào)用該文件進(jìn)行模擬。
土壤數(shù)據(jù)庫的建立
土壤文件包含土壤物理特性的信息,這些土壤數(shù)據(jù)常常被模型用來模擬水分限制條件下的日土壤水分平衡,并確定作物的最佳種植日期。
介紹WOFOST模型的軟件環(huán)境、安裝步驟、運行界面和操作指南。
4、WOFOST模型輸出結(jié)果:
介紹WOFOST模型的輸出結(jié)果類型、含義、展示和分析方法。
5、WOFOST模型校準(zhǔn)和優(yōu)化:
WOFOST模型的校準(zhǔn)目標(biāo)、方法、工具和評價指標(biāo)。
模型驗證:
模型參數(shù)敏感性分析
模型參數(shù)標(biāo)定
作物本身的生長發(fā)育是一個非常復(fù)雜的過程,因此在利用作物模型模擬作物生長過程中涉及的輸入?yún)?shù)較多,主要包括氣象、作物、土壤、田間管理參數(shù)等,在模型參數(shù)敏感性分析的基礎(chǔ)上,結(jié)合實驗區(qū)實際情況,對敏感性較高的參數(shù)進(jìn)行定標(biāo),參數(shù)標(biāo)定部分可參閱文獻(xiàn)和網(wǎng)站等資料。
6、WOFOST模型應(yīng)用案例:
介紹WOFOST模型在不同作物類型、氣候條件、管理措施等方面的應(yīng)用案例。
第四章PythonCropSimulationEnvironment
1、PCSE模型基礎(chǔ):
"PCSE"通常指的是"PythonCropSimulationEnvironment",它是一個用于模擬農(nóng)作物生長和生態(tài)系統(tǒng)互動的Python軟件包。PCSE旨在幫助研究者和農(nóng)民預(yù)測不同農(nóng)作物在不同環(huán)境條件下的生長情況。
2、安裝和配置PCSE
1)已安裝Python;
2)設(shè)置Python環(huán)境;
3)使用Python的包管理工具`pip`來安裝PCSE。
3、創(chuàng)建PCSE項目:
以創(chuàng)建一個新的Python項目或文件,以開始使用PCSE。
4、設(shè)置PCSE輸入數(shù)據(jù)和參數(shù)
導(dǎo)入PCSE模塊:通導(dǎo)入PCSE的核心模塊以及特定的作物模型
```python
frompcse.baseimportParameterProvider
frompcse.fileinputimportCABOFileReader
frompcse.modelsimportWofost71_WLP_FD
frompcse.utilimportWOFOST71SiteDataProvider
```
5、準(zhǔn)備數(shù)據(jù):
準(zhǔn)備與作物模型相關(guān)的數(shù)據(jù),如土壤性質(zhì)、氣象數(shù)據(jù)等。
6、配置作物模型:
設(shè)置作物種類、種植日期、品種等參數(shù),創(chuàng)建一個包含這些信息的字典。
7、運行模擬:
根據(jù)氣象數(shù)據(jù)、土壤屬性和農(nóng)田管理實踐,模擬農(nóng)作物的生長和水分需求。運行PCSE模型,并獲取輸出結(jié)果。
土壤水分情況:PCSE可以提供有關(guān)土壤水分的模擬結(jié)果,包括土壤水分的變化趨勢和水分利用效率。
作物的生長情況:您可以獲得作物的生長階段、葉面積指數(shù)(LAI)以及根系水分吸收等信息。
灌溉建議:基于模擬結(jié)果,PCSE可能會提供有關(guān)何時進(jìn)行灌溉以及灌溉的數(shù)量的建議。
8、分析和可視化:
分析和可視化模擬結(jié)果,以便了解農(nóng)作物生長的預(yù)測和模擬。
第五章案例拓展
1、模型應(yīng)用和決策支持:
如何使用WOFOST和PCSE模型為農(nóng)田提供農(nóng)作物生長和產(chǎn)量預(yù)測
模型在灌溉管理、施肥、氣候適應(yīng)性等方面的應(yīng)用
2、模型的局限性和不確定性:
討論模型的局限性和假設(shè)
評估模型結(jié)果的不確定性
關(guān)注【科研技術(shù)平臺】了解詳情