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Nature:劉清華團(tuán)隊(duì)揭示調(diào)控睡眠時(shí)間的關(guān)鍵分子通路

2023-05-10 09:22 作者:茗創(chuàng)科技  | 我要投稿

導(dǎo)讀

你能做到一周不睡覺嗎?良好的睡眠對(duì)我們保證生活質(zhì)量十分重要。不過,有些人每天只需睡4-6個(gè)小時(shí),有些人則需要8個(gè)小時(shí)(可能還不夠),這是什么原因?qū)е碌模?/p>

其實(shí),這也是很多科學(xué)家好奇的問題,最近,研究人員在小鼠身上發(fā)現(xiàn)了調(diào)控睡眠時(shí)間的通路機(jī)制,揭示了其中的答案。

在我們的生命活動(dòng)過程中,睡眠不可或缺,它在學(xué)習(xí)、記憶、運(yùn)動(dòng)、代謝和免疫等過程中發(fā)揮著重要作用1-3。睡眠行為也保守存在于鳥類、章魚、水螅等其他動(dòng)物中4。然而,不同動(dòng)物的睡眠時(shí)長(zhǎng)卻有著巨大差異,比如長(zhǎng)頸鹿每天只需要2-5小時(shí)的睡眠5,而考拉需要18-22小時(shí)6。

有趣的是,同種動(dòng)物中不同個(gè)體的睡眠時(shí)間也不盡相同。人類通常每天需要7-8小時(shí)睡眠,而有一些人是天生短睡眠者,他們只需要4-6小時(shí)睡眠,就能保持正常工作生活7。目前,調(diào)控睡眠時(shí)間的分子機(jī)制還不清楚。

2022年12月8日,北京生命科學(xué)研究所/清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)交叉研究院劉清華實(shí)驗(yàn)室,與日本國(guó)際綜合睡眠醫(yī)學(xué)研究所的Masashi Yanagisawa/Hiromasa Funato實(shí)驗(yàn)室,在?Nature?背靠背發(fā)表了一篇題為“A signaling pathway for transcriptional regulation of sleep amount in mice”的研究論文。

這項(xiàng)研究揭示了調(diào)控小鼠睡眠時(shí)間的核心分子通路——LKB1-SIK3-HDAC4/5-CREB,并提出了轉(zhuǎn)錄調(diào)控睡眠的新機(jī)制。

這個(gè)實(shí)驗(yàn)要從2016年講起,當(dāng)時(shí),Yanagisawa/Funato實(shí)驗(yàn)室在小鼠的正向遺傳學(xué)篩選中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)“嗜睡”突變體,該突變體中Sik3的點(diǎn)突變?cè)斐赏怙@子13的跳讀,編碼了功能獲得性SLEEPY突變蛋白8,從而使小鼠每天睡眠時(shí)間增加4-5個(gè)小時(shí)。劉清華實(shí)驗(yàn)室和Yanagisawa/Funato實(shí)驗(yàn)室的研究以SIK3為突破口,揭示了一條調(diào)控睡眠時(shí)間的關(guān)鍵分子通路。

成年小鼠腦細(xì)胞特異性基因表達(dá)及敲除系統(tǒng)

此前,劉清華實(shí)驗(yàn)室建立了小鼠睡眠體細(xì)胞遺傳學(xué)研究的新方法:通過在小鼠中眼眶靜脈注射腺相關(guān)病毒(adeno-associated virus),實(shí)現(xiàn)成年腦嵌合基因表達(dá)或敲除(Adult Brain Chimeric-expression/knockout),繼而通過視頻記錄(SleepV)或腦電圖/肌電圖(EEG/EMG)記錄來分析小鼠的睡眠情況(圖1)9。

這個(gè)系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì)在于,它極大程度地縮短了小鼠交配時(shí)間,將原本需要1-2年才能完成的小鼠交配和睡眠分析,縮減到了1-2個(gè)月內(nèi),讓小鼠遺傳分析像果蠅遺傳分析一樣方便快捷。

此外,這個(gè)系統(tǒng)能實(shí)現(xiàn)基因的快速表達(dá)或敲除,也能避免小鼠發(fā)育缺陷,因而突破傳統(tǒng)遺傳學(xué)局限,適于冗余基因和必需基因的睡眠表型分析。

由于SIK3相關(guān)分子通路中的基因都是必需基因,所以本研究充分應(yīng)用這個(gè)系統(tǒng)的優(yōu)勢(shì),進(jìn)行小鼠睡眠的體細(xì)胞遺傳分析。

研究者發(fā)現(xiàn),在成年小鼠中敲除SIK3的上游激酶LKB1后,小鼠睡眠時(shí)間減少了3小時(shí)以上,這說明LKB1也是促進(jìn)睡眠的蛋白激酶。

同時(shí),研究者觀察到LKB1敲除大腦中SIK3的T221磷酸化水平下降,而在LKB1缺失小鼠中表達(dá)模擬T221被磷酸化,從而持續(xù)激活的SIK3-ST221E?或?SLP-ST221E部分重建了LKB1缺失小鼠的睡眠時(shí)間,說明LKB1-SIK3激酶級(jí)聯(lián)促進(jìn)睡眠。

與此相一致的是,研究者也在LKB1敲除大腦中觀察到SIK3下游轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,組蛋白去乙?;窰DAC4/5的S245磷酸化水平下降和核質(zhì)比升高。干擾LKB1缺失小鼠神經(jīng)元中HDAC4/5的轉(zhuǎn)錄活性發(fā)現(xiàn)其睡眠時(shí)間減少的表型被完全回復(fù),而在小鼠神經(jīng)元中表達(dá)持續(xù)位于核中的HDAC4/5CN或敲除Hdac4/5分別減少或增加小鼠睡眠時(shí)間,說明HDAC4/5位于LKB1下游,是抑制睡眠的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)HDAC4/5對(duì)睡眠的調(diào)控作用依賴于對(duì)去乙?;瘡?fù)合體NCoR/SMRT-HDAC3的募集。

立體定位注射結(jié)果表明,HDAC4/5在下丘腦后部調(diào)控睡眠時(shí)間,但并非位于已知調(diào)節(jié)睡眠/覺醒的VLPO腦區(qū),而可能在全新的調(diào)控睡眠/覺醒腦區(qū)發(fā)揮功能。此外,研究者還發(fā)現(xiàn)HDAC4/5的S245磷酸化水平隨著黑暗期小鼠覺醒時(shí)間的積累或睡眠需求的上升而上升,隨著光照期小鼠睡眠時(shí)間的積累或睡眠需求的下降而下降,這個(gè)現(xiàn)象暗示了反饋調(diào)節(jié)機(jī)制的存在。

HDAC4/5不直接結(jié)合DNA,而需要結(jié)合其他轉(zhuǎn)錄因子來發(fā)揮轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能10。研究者通過篩選發(fā)現(xiàn)了另一與HDAC4/5相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子CREB也能抑制睡眠。在HDAC4CN表達(dá)小鼠神經(jīng)元中干擾CREB的轉(zhuǎn)錄活性,發(fā)現(xiàn)HDAC4對(duì)睡眠時(shí)間的調(diào)控作用依賴于CREB。

同時(shí),轉(zhuǎn)錄組分析和ChIP-seq分析發(fā)現(xiàn),HDAC4和CREB可能結(jié)合在相同靶基因的同一位置,并且同向調(diào)控其轉(zhuǎn)錄水平,這一結(jié)果與HDAC4和CREB在睡眠調(diào)控中扮演的角色相一致。進(jìn)一步地,在Sleepy小鼠中表達(dá)HDAC4CN或CREB均能回補(bǔ)其嗜睡表型,同時(shí)也能回復(fù)其轉(zhuǎn)錄變化,這說明HDAC4和CREB位于LKB1-SIK3下游調(diào)控睡眠時(shí)間。

研究團(tuán)隊(duì)的這一系列工作,首次揭示LKB1-SIK3-HDAC4/5-CREB是調(diào)控睡眠時(shí)間的關(guān)鍵信號(hào)通路(圖2),闡明了睡眠時(shí)間受轉(zhuǎn)錄調(diào)控的分子機(jī)制。

睡眠調(diào)控的分子通路模型

在未來,這項(xiàng)研究或許可以幫助我們理解和解決睡眠缺陷與睡眠疾病的問題,進(jìn)一步促進(jìn)人類探索高質(zhì)量睡眠、構(gòu)建良好的生活狀態(tài)。

劉清華實(shí)驗(yàn)室的博士研究生周瑞和王國(guó)棟為本論文的共同第一作者;劉清華博士為通訊作者;劉清華實(shí)驗(yàn)室的博士后李祺博士(現(xiàn)遺傳篩選中心主任)、劉燦博士、孟凡熙和許俊杰等也對(duì)本研究做出重要貢獻(xiàn),我所的張二荃實(shí)驗(yàn)室、遺傳篩選中心、核酸測(cè)序中心、生物信息中心、轉(zhuǎn)基因動(dòng)物中心和日本國(guó)際綜合睡眠醫(yī)學(xué)研究所的Hiromasa Funato教授和Masashi Yanagisawa院士也對(duì)本研究做出重要貢獻(xiàn)。本研究在北京生命科學(xué)研究所完成,受到了北京市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)的“前沿創(chuàng)新項(xiàng)目”和科技創(chuàng)新2030“腦科學(xué)與類腦研究”重大項(xiàng)目等的大力資助。

參考文獻(xiàn):

1.Tononi, G. & Cirelli, C. Sleep and the price of plasticity: from synaptic and cellular homeostasis to memory consolidation and integration. Neuron?81, 12-34 (2014).

2.Xie, L. et al. Sleep drives metabolite clearance from the adult brain. Science?342, 373-377 (2013).

3.Wang, G., Grone, B., Colas, D., Appelbaum, L. & Mourrain, P. Synaptic plasticity in sleep: learning, homeostasis and disease. Trends Neurosci.?34, 452-463 (2011).

4.Pennisi, E. The simplest of slumbers. Science?374, 526-529 (2021).

5.Tobler, I. & Schwierin, B. Behavioural sleep in the giraffe (Giraffa camelopardalis) in a zoological garden. J. Sleep Res.?5, 21-32 (1996).

6.Benesch, A. R., Munro, U., Krop, T. & Fleissner, G. J. B. R. R. Seasonal changes in the behaviour and circadian rhythms in activity and behaviour of captive koalas Phascolarctos cinereus. Biol. Rhythm Res.?41, 289-304 (2010).

7.Zheng, L. & Zhang, L. The molecular mechanism of natural short sleep: A path towards understanding why we need to sleep. Brain Sci. Adv.?8, 165-172 (2022).

8.Funato, H. et al. Forward-genetics analysis of sleep in randomly mutagenized mice. Nature?539, 378-383 (2016).

9.Wang, G. et al. Somatic Genetics Analysis of Sleep in Adult Mice. J. Neurosci.?42, 5617 (2022).

10. Wang, Z., Qin, G. & Zhao, T. C. HDAC4: mechanism of regulation and biological functions. Epigenomics?6, 139-150 (2014).

論文鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41586-022-05510-6


來源:北京生命科學(xué)研究所

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