DNA 甲基化在調(diào)控基因表達(dá)中扮演著重要角色。一直以來(lái)，細(xì)胞 DNA 甲基化狀態(tài)的改變被認(rèn)為與衰老、發(fā)育和疾病病理相關(guān)。十多年來(lái)，研究者可借助基于芯片的強(qiáng)大工具，來(lái)定量測(cè)量整個(gè)基因組的 DNA 甲基化。迄今為止，甲基化芯片已被應(yīng)用于推動(dòng)表觀遺傳組關(guān)聯(lián)研究（EWAS）的數(shù)據(jù)采集，在基于甲基化生物標(biāo)志物的癌癥研究、遺傳疾病、衰老和分子流行病學(xué)領(lǐng)域大顯身手。

為了最大程度支持科學(xué)研究，即日起博奧晶典將甲基化芯片升級(jí)為全新的 MethylationEPIC v2.0 BeadChip?（935K甲基化芯片）。在 MethylationEPIC v1.0 BeadChip （850K 甲基化芯片）的基礎(chǔ)上，935K 甲基化芯片保留了高度向下兼容性，同時(shí)去除了 10.7 萬(wàn)個(gè)優(yōu)化不足的 CpG 探針，增加了超過(guò) 18.6 萬(wàn)個(gè)新探針，靶向已知的增強(qiáng)子、超級(jí)增強(qiáng)子、CTCF 結(jié)合域以及使用染色質(zhì)轉(zhuǎn)座酶可及性測(cè)序分析（ATAC-Seq）和染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序（ChIP-Seq）實(shí)驗(yàn)鑒定的與原發(fā)性腫瘤相關(guān)的染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域，為表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域鑒定的更多功能性內(nèi)容擴(kuò)展空間。

下面就和小編一起看一下新款 935K 甲基化芯片的優(yōu)勢(shì)和具體升級(jí)內(nèi)容吧~

01、935K 甲基化芯片產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

深度全面的基因組覆蓋：檢測(cè)超過(guò) 935K 的 CpG 位點(diǎn)，全面覆蓋 CpG 島、甲基化位點(diǎn)、增強(qiáng)子、超甲基化位點(diǎn)、啟動(dòng)子區(qū)域等；注釋信息更新到 hg38 版基因組和 v41 版 GenCode 數(shù)據(jù)庫(kù)
去粗取精，深度優(yōu)化 CpG 探針：保留高度向下兼容性，同時(shí)去除了?10.7?萬(wàn)個(gè)優(yōu)化不足的?CpG?探針，增加了超過(guò)?18.6?萬(wàn)個(gè)新探針，靶向增強(qiáng)子、超級(jí)增強(qiáng)子、更多的?CTCF?結(jié)合域和染色質(zhì)可及性區(qū)域等新增兼容從?FFPE?組織樣本提取的?DNA，實(shí)現(xiàn)多種樣本類型研究高度精確、高度可重現(xiàn)性、高度分析靈敏度、高度相關(guān)性的數(shù)據(jù)：技術(shù)重復(fù)之間顯示出＞ 99%的可重現(xiàn)性；可檢測(cè) β 值為?0.2 的差異，假陽(yáng)性率低于 1%；與靶向亞硫酸氫鹽測(cè)序數(shù)據(jù)之間具有高度相關(guān)性

單堿基分辨率：解密 DNA 檢測(cè)盲區(qū)，直接獲得準(zhǔn)確的甲基化位點(diǎn)信息

02、935K 甲基化芯片具體升級(jí)內(nèi)容

1、CpG 探針優(yōu)化大升級(jí)，深度覆蓋全基因組

935K 甲基化芯片去除了 10.7 萬(wàn)個(gè)優(yōu)化不足的 CpG 探針，基于以下內(nèi)容新增超過(guò) 18.6 萬(wàn)個(gè)新探針，且更新到 hg38 版基因組和 v41 版 GenCode 數(shù)據(jù)庫(kù)，全面助力表觀遺傳組關(guān)聯(lián)研究（EWAS）。

1、在多種癌癥的腫瘤與正常樣本中鑒定出的差異甲基化位點(diǎn)

2、通過(guò)ChIP-Seq在癌癥和細(xì)胞系樣本中鑒定出的增強(qiáng)子和超級(jí)增強(qiáng)子

3、通過(guò)ATAC-Seq在原發(fā)性人類癌癥中鑒定出的差異可及性染色質(zhì)區(qū)域

4、擴(kuò)展的CpG島覆蓋度

5、增強(qiáng)的外顯子覆蓋度，實(shí)驗(yàn)更準(zhǔn)確的拷貝數(shù)變異（CNV）檢測(cè)

6、常見(jiàn)的癌癥驅(qū)動(dòng)突變

2、新增兼容從 FFPE 組織樣本提取的 DNA升級(jí)的 935K 芯片新增兼容從 FFPE 組織樣本提取的 DNA，在分析 FFPE 組織樣本時(shí)表現(xiàn)出優(yōu)秀的穩(wěn)定性能。

3、高度精確、高度可重現(xiàn)性、高度分析靈敏度、高度相關(guān)性的數(shù)據(jù)

935K 芯片化學(xué)技術(shù)針對(duì)分析的每個(gè) CpG 位點(diǎn)使用多個(gè)磁珠重復(fù)，每個(gè)磁珠附有數(shù)千個(gè)探針。癌細(xì)胞系的測(cè)試實(shí)驗(yàn)在技術(shù)重復(fù)之間顯示出＞99%的可重現(xiàn)性，可見(jiàn)能夠提供高度精確的甲基化測(cè)量；此外可檢測(cè) β 值為 0.2 的差異，假陽(yáng)性率低于 1%，展現(xiàn)出了高度的分析靈敏度；同時(shí)數(shù)據(jù)顯示 935K 芯片和 850K 芯片重疊檢測(cè)與甲基化數(shù)據(jù)之間具有高度相關(guān)性，而芯片獲得的準(zhǔn)確度和精確度水平只能在 100X 及以上測(cè)序深度的靶向亞硫酸氫鹽測(cè)序下獲得。

看了以上的介紹，相信您對(duì)新升級(jí)的?935K?甲基化芯片有了更深的了解，此款芯片可以在單堿基分辨率層面定量分析全基因組?CpG，獲得高度精確、高度可重現(xiàn)性、高度分析靈敏度的甲基化檢測(cè)。心動(dòng)不如行動(dòng)，快快聯(lián)系我們的銷售同事，開(kāi)啟您的表觀遺傳組關(guān)聯(lián)研究（EWAS）吧！