waters??MassLynx色譜圖和質(zhì)譜圖查看與處理

MassLynx中，數(shù)據(jù)采集完成后，要對譜圖進(jìn)行查看與處理，本文為您介紹MassLynx色譜圖和質(zhì)譜圖查看與處理。

Part I色譜圖查看

打開色譜圖：

在Sample list中，選中要打開的色譜圖序號（可以是一個，也可以是連續(xù)多個），單擊Chromatogram，色譜圖會顯示。圖中一般包括色譜峰強度、保留時間、數(shù)據(jù)類型、離子化方式等信息。

譜圖放大：

按住鼠標(biāo)左鍵在色譜圖上拖動一段距離，松開左鍵，可放大色譜圖，單擊恢復(fù)鍵 ，可回到初始范圍。

顯示不同項目下的色譜圖：

首先打開一張色譜圖，然后左上角點擊File > Open。從文件名列表中選擇需要的另一張色譜圖，選中Add，點擊OK。

刪除一個色譜圖：

單擊要刪除的色譜圖，確保圖的左側(cè)有一個彩色的小方塊，按Delete鍵，單擊 OK 就可將其刪除。

局部放大色譜圖，微調(diào)放大倍數(shù)：

用左鍵選擇一段區(qū)域，用magnify（放大鍵）?放大色譜圖，單擊恢復(fù)按鈕恢復(fù) ，在放大部分的上部會顯示放大倍數(shù)。

微調(diào)：

• 雙擊放大倍數(shù)，出現(xiàn)對話框；

• 在 From 到 To 的區(qū)域里輸入要放大的區(qū)域；

• 在 By 后面輸入放大倍數(shù)，單擊 OK。

在色譜圖窗口添加文字：

在工具欄單擊A，鼠標(biāo)左鍵在色譜窗口中空白區(qū)域單擊一下，出現(xiàn)?Edit Text String對話框，在Text區(qū)域輸入要輸入的內(nèi)容，在上面部分選擇顯示方式，單擊OK。

提取質(zhì)量色譜圖：

菜單欄>Display > Mass，出現(xiàn)質(zhì)量色譜圖窗口，單擊 Select All > OK，所有色譜圖將會顯示?；螂p擊預(yù)顯示的離子通道，也可以把兩個通道的質(zhì)量色譜圖進(jìn)行疊加（ch1+ch3）或相減(ch3-ch1)，之后點擊OK。

窗口右下方有幾個選項：

• Add trace:?新打開的圖會加到目前色譜圖的窗口中；

• Replace trace:?新打開的色譜圖會替換原來的色譜圖；

• New window:?新打開的色譜圖會在新的窗口中顯示；

• File:?可顯示另外一個文件中的色譜圖。

改變色譜圖排列順序：

選擇色譜圖，確保圖的左側(cè)有一個彩色的小方塊，菜單欄> Display>Move to Last 或Move to First。

重疊色譜圖，縱軸不關(guān)聯(lián)：

菜單欄>Display>View>勾選Overlay Graphs，不勾Link Vertical Axies，所有色譜圖會重疊，但縱軸不關(guān)聯(lián)。

重疊色譜圖，縱軸關(guān)聯(lián)：

菜單欄>Display>View>勾選Overlay Graphs和Link Vertical Axies，所有色譜圖會重疊，縱軸關(guān)聯(lián)。

顯示TIC圖：

單擊 restore TIC 工具 ，可顯示整個TIC圖。

改變X軸顯示方式：

色譜圖的X軸有兩種顯示方式：按保留時間或按掃描數(shù)，可通過Display > View > Horizental Axies選擇Time/Scan來切換，一般色譜峰數(shù)據(jù)點要求:定量>12點，定性>5點。

色譜圖峰頂顯示信息：

選擇 Display > Peak Annotation. 峰頂可顯示 peak top time, peak top scan, peak response height and peak response area.等，或他們的任意組合。

對齊色譜圖：

當(dāng)質(zhì)譜前串聯(lián)紫外檢測器時，紫外譜圖與質(zhì)譜圖保留時間會有一定的偏移，如果要對齊兩張色譜圖，選擇Display>Range>Align>輸入offset time>OK，譜圖將被對齊。

色譜圖上添加標(biāo)題：

選擇 Display > View.> 單擊 Header >上面空格為標(biāo)題的位置，下面為標(biāo)題的內(nèi)容. 例如選中左角位置的空格，下面選擇. Raw Data Date，單擊? Add ，單擊OK。譜圖左上角將會顯示數(shù)據(jù)采集日期。

Part II色譜圖處理

色譜圖平滑：

選擇 Process > Smooth. 輸入平滑參數(shù)，單擊 OK。推薦窗口用2，次數(shù)用1。如果平滑效果不佳，可以增加次數(shù)。對于質(zhì)量色譜圖，平滑方法（Smoothing Method）選擇Mean（平均）。

色譜圖標(biāo)準(zhǔn)積分：

選擇 Process > Integrate，在 Integrate chromatogram 窗口中，需要用戶輸入 Peak-to-peak noise amplitude。 這個值可用鼠標(biāo)的右鍵在噪音位置拉一段來自動輸入。 Peak-to-peak noise amplitude 值輸入后，單擊 Peak detect，輸入合適的值，單擊 OK。推薦先用默認(rèn)值，單擊 Threshold，輸入閾值。

Relative height/Relative area: 刪除那些峰面積或高度是最高峰特定比例下的峰，Absolute height/Absolute area: 刪除面積或高度是某特定值的峰。 單擊 OK 積分色譜峰。

色譜圖ApexTrack積分：

選擇 Process > Integrate，在 Integrate chromatogram 窗口中，勾選ApexTrack，單擊 Peak detect，基線噪音和峰寬均選自動檢測，輸入 Baseline Start 和 End Threshold% 的值，推薦的基線起始和結(jié)束百分閾值是0和0.5，單擊 OK。另外標(biāo)準(zhǔn)積分和Apex積分都推薦勾選平滑，平滑參數(shù)同上。

手動積分-編輯已監(jiān)測到的峰：

Edit > Integrated Peaks。刪除一個峰：用右鍵在要刪除的峰上單擊，或者從 Peak Tops 列表中用左鍵選擇要刪除的峰，單擊 Delete；

要加一個新的峰：在 start 和 end 處輸入新的基線，或用右鍵拉一段，單擊Add按鈕，Peak Information 顯示了新積分到的峰的信息，單擊 OK確認(rèn)。?

色譜圖信噪比：

選擇 Process > Signal-To-Noise用鼠標(biāo)的右鍵拉進(jìn)信號和噪音范圍；其它參數(shù)參考默認(rèn)設(shè)置，單擊 OK，信噪比的數(shù)值會顯示在峰頂?？梢杂脙煞N方法顯示信噪比：RMS和Peak to Peak。

Peak to Peak是信號和噪音均值的比值，RMS是信號和噪音均方根的比值，通常RMS算出來的值是Peak to Peak的5倍。?

Part III質(zhì)譜圖查看

質(zhì)譜圖局部放大：

選擇 Display > Range > Magnify，在 From 和 To 輸入要放大的區(qū)域，在 By 后面輸入放大倍數(shù)，單擊 OK。

質(zhì)譜圖局部放大多個區(qū)域：

選擇 Display > Range > Magnify. 在 From 和 To 輸入要放大的區(qū)域，在 By 后面輸入放大倍數(shù),在 Range 選擇不同的放大區(qū)域，最多可選5個，單擊 OK。單擊 delete magnification工具 ，可把放大的部分恢復(fù)。

質(zhì)譜峰頂顯示信息：

選擇 Display > Peak Annotation，可選擇峰頂顯示的信息。

峰頂信息的類型:

• Decimal Places: 質(zhì)量數(shù)的小數(shù)點位數(shù)，0-4；

• Mass: 質(zhì)量數(shù)；

• Intensity: 強度；

• Delta Mass: 該峰與參比峰的質(zhì)量數(shù)的差值，在后面空格中輸入?yún)⒈鹊馁|(zhì)量數(shù)；

• Annotation Threshold Parameters: 顯示峰信息的閾值；

• % Full scale: 輸入基峰的高度的百分比，默認(rèn)值為1；

• Intensity:? 輸入絕對強度閾值；

• Level:? 決定在色譜圖中標(biāo)簽的個數(shù)，分為高，中，低。

在質(zhì)譜圖中增加文字描述：

單擊 Add Text 按鈕 ，用鼠標(biāo)左鍵在質(zhì)譜圖的空白區(qū)域單擊，在 Edit Text String 中輸入要顯示的內(nèi)容。

Part IV?質(zhì)譜圖處理

質(zhì)譜圖加和平均

用鼠標(biāo)右鍵在色譜圖需要加和的掃描數(shù)范圍內(nèi)拉一段，即顯示的是加和之后的平均質(zhì)譜圖。

質(zhì)譜圖加和平均并扣除本底：

Process > Combine，鼠標(biāo)右鍵在出峰位置拖動一段，掃描點會自動輸入Averange，代表用于平均的掃描點，用鼠標(biāo)右鍵在前噪音拖動一段，掃描點會自動輸入Substract，如果需要扣除兩段本底，用鼠標(biāo)右鍵拖動一段后噪音，掃描點也會自動輸入Substract，單擊 OK，即顯示扣除本底的質(zhì)譜圖。