【維真生物-知識分享】RNAi常用工具比較:siRNA和shRNA

siRNA和shRNA作用原理
shRNA和siRNA都是通過RNAi途徑介導基因的沉默,但兩者轉(zhuǎn)染媒介、構(gòu)建方式和細胞內(nèi)加工過程不完全相同。
siRNA可以在體外合成后通過轉(zhuǎn)染進入細胞,也可以將其dsRNA前體轉(zhuǎn)染入細胞,dsRNA在細胞質(zhì)內(nèi)經(jīng)過一系列酶處理,形成siRNA,之后siRNA與RISC結(jié)合并介導RISC與靶mRNA結(jié)合,導致靶mRNA的切割和降解。
shRNA則需構(gòu)建至表達載體中,利用質(zhì)?;虿《久浇檫M入細胞,在細胞核內(nèi)通過轉(zhuǎn)錄和剪切形成,之后shRNA轉(zhuǎn)運出細胞核,在細胞質(zhì)內(nèi)經(jīng)過Dicer酶處理后形成siRNA,進而導致靶mRNA的切割和降解。

siRNA和shRNA的區(qū)別
1. shRNA具有更長的作用時效:siRNA的穩(wěn)定性較低,進入細胞后會逐漸被降解,因此只能在短期內(nèi)(一周左右)實現(xiàn)對靶基因的沉默;shRNA借助表達載體可以在細胞內(nèi)大量轉(zhuǎn)錄,因此靶基因的沉默時效更長,可以持續(xù)數(shù)個星期。
2. shRNA對于難轉(zhuǎn)染的細胞效果更好:siRNA主要通過轉(zhuǎn)染進入細胞,難轉(zhuǎn)染的細胞會嚴重影響siRNA的功能;shRNA可借助病毒導入細胞,對于難轉(zhuǎn)染的細胞仍然有很高的導入效率,因此對于難轉(zhuǎn)染的細胞干擾效果更好。
3. shRNA脫靶率更低:有證據(jù)表明shRNA的脫靶更低,可能是由于siRNA在細胞質(zhì)中逐漸降解導致脫靶。
